白芨内生细菌组成及多样性分析          下载免费PDF全文

陈泽斌  李冰  王定康  徐胜光  刘佳妮  余磊  张永福  任禛  靳松 《南方农业学报》2016,47(2):227-233

[目的]调查白芨内生细菌种类及多样性,为更好地保护和开发利用白芨资源提供科学依据.[方法]应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定白芨内生细菌的16S rDNA-V4变异区序列,应用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种丰度及分布的差异.[结果]获得用于分析的有效序列和OTU数为49550/48;稀释曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和.白芨内生细菌主要分布于鞘脂单胞菌属(Sph ingomonas,3226%)、地杆菌属(Pecobacter,16.13%)、盐单胞菌属(Halomonas,16.13%)、土壤杆菌属(Agrobacterium,12.90%)、Kaistobactc届(6.45%)、希瓦氏菌属(Shcwanclla,6.45%)、假单胞菌属(Pseudomonas,6.45%)和短波单胞菌属(Brevundimonas,3.23%)8个属.[结论]鞘脂单胞菌属、地杆菌属、盐单胞菌属和土壤杆菌属是白芨内生细菌的优势种群.Illumina MiSeq高通量测序技术能准确反映植物内生微生物的种类组成和真实比例,在植物内生微生物研究中具有明显的优势和可行性.  相似文献   

薄荷内生细菌的多样性及组成分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈泽斌  李冰  王定康  余磊  徐胜光  张永福  任禛 《浙江农业学报》2016,28(1):56

为了调查薄荷内生细菌种类多样性,应用高通量测序技术测定薄荷内生细菌的16S rDNA\|V4变异区序列,采用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元（OTUs）数量,分析物种的丰度、分布和α多样性,以及物种丰富度的差异。研究获得用于分析的有效序列和OTU数为60 034/226;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和。薄荷（样品名BH）的Chao 1指数为226.0,Shannon多样性指数为2538。薄荷内生细菌分布于以下10个属：食酸菌属（Acidovorax,65.34%）、鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas,17.32%）、土地杆菌属（Pedobacter,5.88%）、甲基杆菌属（Methylobacterium,4.33%）、Luteolibacter属（1.94%）、土壤杆菌属（Agrobacterium,153%）、鞘氨醇杆菌属（Sphingobacterium,1.30%）、金黄杆菌属（Chryseobacterium,0.92%）、黄杆菌属（Flavobacterium,0.78%）、Dyadobacter属（0.67%）;薄荷内生细菌优势菌属为食酸菌属（Acidovorax,65.34%）和鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas,17.32%）。Illumina MiSeq高通量测序技术为植物内生细菌的研究提供了更加准确、科学的数据资源。  相似文献   

生物炭肥对易感根结线虫病烤烟根际菌群和理化性质的影响     

赵娅红  胡骞予  夏融  王志江  谢永辉  叶贤文  余磊  齐颖  羊绍武  薛至勤  吴治兴  黄飞燕  韩天华 《中国农业科技导报》2024,(4):206-214

为明确生物炭肥对烟草根结线虫病及根际土壤的影响,通过田间试验研究拌塘施用不同量生物炭肥对烟草根结线虫病株根际土壤的影响。结果表明,常规施肥减量10%拌塘施用酵素生物炭肥能够显著降低烟草根结线虫病的病情指数,其中酵素生物炭肥施用量为350 g·株^-1时,根结线虫病防治效果较好,防治效果达23.98%,且烟株农艺性状表现较好;根际土壤中过氧化氢酶、脲酶和磷酸酶活性较高,酚酸物质含量降低,化感自毒作用减弱。各处理土壤真菌数量均随生育期的推进呈先增高后降低趋势,其中酵素生物炭肥施用量为350 g·株^-1时,根际土壤中的细菌量随生育期推进逐步降低。各生育期土壤中均表现为真菌数量较高,细菌数量较低,真菌/细菌值较高,说明在烟草种植中,减量施肥10%同时拌塘施用酵素生物炭肥350 g·株^-1能提高土壤中真菌数量,降低土壤中细菌数量,显著提高土壤肥力及土壤酶活性,为生物炭肥对易感根结线虫病根际微生态调控提供了科学依据。  相似文献   

钾高效利用烤烟品种的筛选及其qPCR分析     

刘加红  高华锋  解燕  蔺忠龙  余磊  孔垂思  杨涛 《分子植物育种》2019,17(9):2939-2942

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云南省珠芽魔芋(Amorphophallus bulbifer)软腐病病原菌鉴定     

魏环宇  魏薇  杨敏  裴卫华  赵建荣  钟宇  刘佳妮  苏源  黄飞燕  王启宇  胡文婷  陈海如  余磊 《植物病理学报》2020,50(4):381-386

 魔芋 (Amorphophallus spp.) 是我国西南地区广泛种植的一种重要经济作物。2016~2018年在云南省发现一种由细菌侵染引起的珠芽魔芋新病害,症状表现为茎秆或叶片出现水渍状病斑,茎秆软化下垂,根部及球茎腐烂变褐,甚至整株倒伏。根据病害发病症状,并通过菌落形状、致病性测定、Biolog和16S rDNA测序分析,结果显示该病原菌在LB培养基上菌落呈近圆形,中央隆起,淡奶油色,质地均匀,表面光滑发亮;扫描和透射电子显微镜下观察显示,菌体形态呈短杆状,周生鞭毛,两端稍钝圆;基于16S rDNA扩增序列系统进化分析与已报道的Pectobacterium aroidearum strain CL1904-3 (MK875007) 相似性达99%以上,构建的系统进化树表明与P. aroidearum菌株亲缘关系最近,Biolog测定和16S rDNA序列分析均将该病原菌鉴定为软腐果胶杆菌 (P. aroidearum)。这是我国首次报道由P. aroidearum引起的珠芽魔芋软腐病害。研究结果进一步加深了人们对该病害的认识,为其防治提供了科学依据。  相似文献   

中国水仙FOMT2基因及启动子的克隆与分析     

张蒙  潘腾飞  余磊  杨华丽  潘东明 《热带作物学报》2018,39(4):726-732

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烟草黑胫病植株根际土壤真菌群落多样性及结构分析     

方宇  白涛  刘冬梅  韩小女  刘舜  王瑞宝  郭永升  陈小龙  王柄权  程凌寒  黄飞燕  余磊  蔡永占  刘佳妮 《西南农业学报》2022,(4):822-830

【目的】为改善云南烟区植烟土壤微生态环境及从土壤生防菌筛选等角度防治烟草黑胫病提供基础数据及理论依据。【方法】采用Illumina MiSeq高通量测序技术分析了健康与患病烟株根际土壤真菌群落结构。【结果】健康烟株根际土壤(ZCTY)和患病烟株根际土壤(HJTY)真菌OTU数分别为1809和1479个,同时ZCTY的OTU数、特有OTU数分别是HJTY的1.22、1.62倍,且HJTY中的真菌物种量、丰富度和多样性显著降低,ACE、Chao1和Shannon指数较ZCTY分别降低了31.87%、30.47%和0.68%;同时,优势种属中的Soilcoccozyma、镰刀菌属(Fusarium)、Spiromastix和青霉属(Penicillium)在两组间存在显著差异,较ZCTY相比,HJTY中的Soilcoccozyma、镰刀菌属和青霉属相对丰度分别增加了177.06%、54.32%和144.27%,而毛壳菌属(Chaetomium)等有益菌属显著减少,且Spiromastix是HJTY的特有菌属;烟株根际土壤真菌群落与土壤理化因子(pH、有机质、碱解氮、有效磷、速效钾)变化存在一...  相似文献   

移栽期对冬季烤烟上部烟叶致香成分和质量评价的影响     

陈小龙  段卫东  张展  申洪涛  封幸兵  张留臣  邓小鹏  蔡永占  杨敏  黄飞燕  余磊  童文杰  尹光庭 《中国农学通报》2021,37(22):28-34

为揭示冬季烤烟烟叶生长后期致香成分的生成规律,改善冬季烤烟香气品质,以‘KRK26’上部烟叶(B₂F)为材料,采用SDE（同时蒸馏萃取）-GC/MSD气质联用法对同一产区4个不同移栽期的相同栽培及初考条件下的烟叶致香成分及相对含量进行检测。结果表明,致香成分总量与感官评吸结果吻合度较好,可能对冬烟烟叶整体香气质量起基础作用;次年1月15日移栽处理(K3)新植二烯含量显著高于其他3个处理,且烤后烟叶评吸质量较优,显示新植二烯含量可能对冬烟烟叶整体香气质量起主导作用;类胡萝卜素降解产物中的大马士酮、香叶基丙酮、3-羟基大马酮及芳樟醇;类西柏烷类致香物质中的茄酮;美拉德反应产物中的糠醛、2,3-二氢呋喃、5-甲基-2-糠醛、3-甲基-2-(5H)-呋喃酮和2,3-二氢苯并呋喃;苯丙氨酸类降解产物中的苯甲醛、苯甲醇、苯乙醛、苯乙醇和吲哚;其他类致香物质中的2-乙酰呋喃、杜烯、棕榈酸甲酯、香叶基香叶基焦磷酸、棕榈酸等,可能是影响冬烟烤后烟叶香气质量的重要成分。研究结果可为云南冬烟栽培技术优化,改善冬烟烟叶香气品质及提高上部烟叶可利用性提供科学依据。  相似文献   

适合绣球属植物的无菌播种技术改良     

沈柏春  余磊  邱帅  孙丽娜  彭悠悠  魏建芬  高凯 《浙江农业科学》2022,63(2):359-362

为了解决绣球属杂交育种和野生资源开发中,无菌播种操作难度大、 污染率高、 萌发率低、 种子损失多的问题,本研究改良了常规无菌播种技术,提出一种操作简单、 高效的绣球无菌播种技术.结果表明,改良无菌播种技术具有操作简单、 污染率低、 种子损失小和萌发率高等优点,能在短时间内获得大量绣球杂交后代和野生资源实生苗,为新品种培...  相似文献   

中草药提取物对烟草根结线虫病及根际土壤理化性状的影响     

王志江  叶贤文  詹莜国  薛建康  余磊  钟宇  苏源  刘佳妮  黄飞燕 《湖南农业科学》2020,(6):66-69

以烤烟红花大金元为材料,分别研究了苍耳、青蒿、和苦参3种中草药的提取物溶液对烟草根结线虫病及根际土壤的影响。结果表明:在移栽时浇穴灌根施用苍耳、青蒿和苦参的提取物溶液均有利于提高根际土壤养分、降低土壤酚酸类物质含量、促进烤烟的生长发育;其中苦参提取物溶液可显著提高根际土壤过氧化氢酶和脲酶活性、降低土壤酚酸类物质的积累,烤烟的农艺性状表现最好,烟草根结线虫病防治效果较佳,防效达23.87%;而苍耳、青蒿提取物溶液对烟草根结线虫病的防治效果不明显。  相似文献