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【目的】分析贵州地方柑橘品种‘惠水金橘’的叶绿体基因组特征及分子标记,为研究该品种的系统进化关系、丰富柑橘类果树叶绿体分子标记奠定基础。【方法】提取‘惠水金橘’成熟叶片总DNA,构建小片段插入文库并测序,以甜橙叶绿体基因组为参考,筛选叶绿体基因组相关序列组装,开展SSR(simple sequence repeat,简单重复序列)预测、SNP(single nucleotide polymorphisms,单核苷酸多态性)/InDel(insertion-deletion,插入缺失)分析以及聚类分析。【结果】组装后获得叶绿体基因组全长为160 698 bp,GC含量为38.42%,共有117种基因被注释;检测到92个SSR位点,大部分的SSR位点都偏向于A/T组成;检测到417个SNPs位点、149个InDels位点、InDel的标记密度约为每kb 0.927个。进化树显示该品种与其他宽皮柑橘聚为一大类。【结论】利用高通量测序技术挖掘柑橘叶绿体基因组DNA分子标记是可行的。 相似文献
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为贵州地方特色柑橘品种牛肉红朱橘及其亲本惠水金钱橘在孢粉学上的鉴别提供参考,利用扫描电镜观察花粉形态,采用醋酸洋红染色法观察花粉活力,采用离体培养观察花粉体外萌发情况,比较牛肉红朱橘与其亲本惠水金钱橘花粉形态和育性的差异。结果表明:牛肉红朱橘、惠水金钱橘的花器官发育均正常,为完全花;花粉形态差异不大,花粉粒小,圆球形,极面观为四裂圆形,赤道面观为长圆形,外壁为网状纹饰,网脊宽,网眼小,萌发沟4条;花粉染色率分别为93.95%和95.45%,无明显差异;离体花粉萌发率分别为71.25%和54.62%。 相似文献