基于转录组测序的花斑裸鲤SSR、SNP和InDel位点特征分析     

贺彩霞  李长忠  金文杰  保长虹  简生龙  李昭楠  王丽楠  严青春  王振吉  王国杰  陈艳霞 《大连海洋大学学报》2024,(1):48-56

为利用分子标记规模化开发与辅助花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)良种选育,以花斑裸鲤(2⁺龄)的鳃、肾脏和肝脏组织为材料,经总RNA提取和cDNA文库构建后采用Illumina Novaseq 2000平台进行转录组测序,并采用MISA和GATK3软件分析转录组的SSR、SNP和插入缺失标记(InDel)位点特征。结果表明：在486 221条Unigenes序列中共发现了128 727个SSR,出现频率为26.47%,平均每3.76 kb出现1个SSR;花斑裸鲤SSR包括6个重复类型,以单碱基和二碱基重复基元类型为主,分别占总SSR位点数的46.53%和42.45%,重复基元类型共77种,其中,A/T和AC/GT两种基元的出现频率最高,是花斑裸鲤SSR的优势重复基元;所有重复次数中出现次数最多的为5～15次,占所有SSR位点的87.52%;通过GATK3软件搜索得到399 080个SNP位点,转换类型多于颠换类型,分别占总SNP的56.29%和43.71%,转换类型中A/G发生频率略高于C/T,而颠换类型中A/T发生频率最高,C/G发生频率最低;I...  相似文献   

动物细胞系的染色体组型分析和致癌／致瘤性     

张德礼  李六金 《中国兽医学报》1999,19(4):348-349,352

为确定供生物制品和生物工程产品生产所用动物传代细胞系有无致癌／致瘤性,对研制生产犬、貉、狐用五联病毒,即犬狂犬病病毒（ＲＶ）、犬瘟热病毒（ＣＤＶ）、犬细小病毒（ＣＤＶ）、犬腺病毒２型（ＣＡＶ２）和犬副流感病毒（ＣＰＩＶ）的活疫苗以及猫、狮、虎、豹用三联病毒,即泛白细胞减少症病毒（ＦＰＬＶ）、猫疱疹病毒１型（ＦＨＶ１）和猫杯状病毒（ＦＣＶ）的活疫苗,所用猫肾细胞系（Ｆ８１,ＣＲＦＫ）、犬肾细胞系（ＭＤＣＫ）、非洲绿猴肾细胞系（Ｖｅｒｏ,Ｖｅｒｏ２）、恒河猴肾细胞系（ＭＡ１０４）和叙利亚金…  相似文献   

不同剂型育苗灵应用试验     

季相金  冯安君 《垦殖与稻作》1999,(3):25-26

通过田间试验证明,杀菌营养型育苗灵具有防病治病,强健林体的双重功效。较单一性育苗灵使用省工,降低成本,秧苗素质好,经济效益高。  相似文献   

肉鸭全价饲料适宜营养水平的研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

哈志刚  金明昌  吴勇  史春先 《四川畜牧兽医》1999,26(12):19-19

肉鸭饲养业发展迅速,四川肉鸭饲养量不断上升,集约化饲养增加,对肉鸭饲料的需求量也不断增加。随着饲养技术的提高,对饲料质量的要求也越来越高,但现有关于肉鸭的资料较少,在肉鸭饲料配制过程中多借鉴肉鸡资料。肉鸡和肉鸭消化生理存在一定差异,完全按照肉鸡的高能高蛋白要求配制肉鸭日粮不够科学。为了了解肉鸭能量蛋白需要,更合理地配制肉鸭日粮,进行了肉鸭不同营养水平的初步研究。同时,研究了两种饲养方式对肉鸭生长效果的影响。１　试验材料和方法１－１　试验动物：选择３２５只１日龄樱桃谷商品代肉鸭,随机分成５组,每组…  相似文献   

不同混合时间对预混料均匀度的影响     

王赛玉  金贤元 《湖北畜牧兽医》1999,(6):6-7

分别在4、5、6、7、8min混合时间各取10个样,以比色法测定各样本的铁含量,求变异系数,以确定卧式混合机混合预混料的最佳时间.结果表明4min的变异系数较高,没有达到预期的混合均匀度,最佳混合时间以5min为宜.  相似文献   

重组马立克病病毒CVI988/Rispens的构建   总被引：2，自引：0，他引：2  

刘红梅  秦爱建  叶建强  陈鸿军  金文杰  刘岳龙 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2005,26(4):1-4

根据Ⅰ型马立克病病毒（MDV）强毒GA株基因序列,设计两对引物,用PCR方法扩增出CV1988／Rispens株的US10及其侧翼序列,分别克隆入pUC18载体中。经测序检测正确后,进一步插入含CMV启动子的绿色荧光蛋白（EGFP）基因表达盒,获得了含EGFP报告基因的转移载体质粒pPUC18-US10-EGFP。通过同源重组,成功地筛选出表达EGFP的重组病毒rCV1988-EGFP,经传代证明重组rCV1988-EGFP在感染的CEF细胞中能稳定表达EGFP。结果表明：构建的重组转移载体质粒正确,US10是MDV复制非必需片段,为进一步利用US10区构建重组MDV多价基因工程疫苗奠定了基础。  相似文献   

禽源性大肠杆菌HPI irp2基因序列的扩增及比较   总被引：5，自引：1，他引：4  

金文杰  郑志明  王倩倩  秦爱建  刘岳龙  邵红霞 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2005,26(3):5-7

从养殖场发病家禽中分离到多株禽源性大肠杆菌（Escherichia coli）,用其中YZG040515、NTLFC040402、CHZ031016菌株提取细菌高致病性染色体DNA,根据耶尔森菌高致病性毒力岛（HPI）irp2基因设计引物,用PCR扩增出278 bp基因片段。将PCR产物克隆到pGEM-T-easy中,经EcoR I酶切鉴定为阳性者进行序列测定。结果表明：该基因片段与GeneBank中公布的耶尔森菌HPI irp2基因的同源性高达98％以上。证明禽源性大肠杆菌中具有耶尔森菌毒力岛HPI基因序列,结合临床发病情况和流行病学,提示该毒力岛与日趋严重的家禽大肠杆菌病可能有一定的相关性。  相似文献   

绒山羊皮肤组织结构的研究   总被引：8，自引：0，他引：8  

金海国  申秀吉  李学俊  金成范  李正虎 《延边大学农学学报》1999,(2)

对内蒙古阿白绒山羊的皮肤组织结构观察研究表明,内蒙古阿白绒山羊的皮肤毛囊结构有其品种特征,具有较高的毛囊密度和Ｓ／Ｐ 值（ 即次级毛囊与初级毛囊之比） ,可以将皮肤毛囊组织形态指标运用到选种上,并为绒山羊的早期选种提供了科学依据  相似文献   

三种蔬菜作物高温下蒸腾,种子活力和ATP的变化及其与抗热性 …   总被引：2，自引：0，他引：2  

金新文  沈征言 《中国农业大学学报》1999,4(5):98-102

芹菜、菜豆和辣椒３种蔬菜作物。取其抗热性有明显差异的品种各１或２对为材料,研究高温对蒸腾、种子活力及萌动种子ＡＴＰ水平的影响。结果表明,高温胁迫下３种蔬菜的蒸腾强度升高,１天中变化加剧,且抗热品种更为明显;种子活力和ＡＴＰ水平受热胁迫而下降,其下降率抗热品种均低于相应的热敏型品种。初步认为,高温下上述３项指标的变化幅度可望作为作物抗热性的鉴定指标。  相似文献   

养好稚鳖的技术措施     

郭树林  金岭梅 《甘肃农业科技》1999,(1):41-42

通过试验从稚鳖消毒,饲料选配,培育环境,水质条件,放养密度,病害防治等１０个方面总结出了稚鳖的养殖技术。  相似文献