利用差减链式反应构建白菜基因组代表性文库   总被引：1，自引：0，他引：1  

武剑  冯艳丽  和江明  王晓武 《农业生物技术学报》2009,17(2):307-311

构建多态性比例高的基因组代表性文库是提高芯片和测序基础上的标记技术效率的关键。通过差减链式(differential subtractive chain, DSC) 反应,去除同一物种内的不同栽培种群间不具多态性的片段,能够提高基因组代表性文库中多态性片段的比例。研究利用白菜类作物（Brassica campestris） 8个栽培种群的材料构建tester DNA样品,利用水菜(B.campestris ssp. nipposinica) DNA作为driver样品。这两个DNA样品经EcoRⅠ/Mse Ⅰ酶切,酶切产物连接不同的接头。3遍DSC反应后,将反应产物连接到pDONR201载体中,构建基因组复杂性降低文库。分2批随机取其中20个单克隆和95个单克隆,分别进行Southern斑点杂交,结果分别显示9个和98个多态性片段,其比例分别为45%和61%,较之前关于多态性芯片技术的相关研究中15%～17%的多态性克隆比例大大提高。  相似文献   

黄瓜营养体苦味基因Bi的定位   总被引：2，自引：1，他引：1  

李曼  龚义勤  苗晗  武剑  顾兴芳  张圣平  王晓武 《园艺学报》2010,37(7):1073-1078

以黄瓜（Cucumis sativus L.）营养体无苦味的材料9110Gt（bibi）与有苦味的材料9930（BiBi）为亲本,对以两亲本构建的148个株系的RILs群体进行SSR标记的遗传连锁分析,对Bi基因进行初步定位,两侧翼标记SSR19672和SSR00004与Bi基因的连锁距离分别为4.4和3.4 cM。利用两侧翼标记筛选以相同亲本构建的1 815株的F2群体中的重组单株,结合黄瓜基因组测序的结果及生物信息学的知识,在标记区域内开发了31对SSR标记,最终将Bi基因定位在黄瓜的第6染色体上,最近的两侧翼标记SSR02309和SSR00004与苦味基因分别相距1.7和2.2 cM。  相似文献   

黄瓜复雌花性状QTL定位分析   总被引：6，自引：1，他引：5  

苗晗  顾兴芳  张圣平  武剑  方智远  张振贤 《园艺学报》2010,37(9):1449-1455

利用具有复雌花性状的华北保护地类型黄瓜材料9930和具有单雌花性状的欧洲温室类型黄瓜材料9110Gt构建的含148个株系的F9代RILs群体进行QTL定位分析。利用已构建的遗传图谱,使用MapQTL4.0软件进行多座位QTL模型（MQM）检测。共检测到8个控制复雌花性状的QTL,分布在第1、2、3、6、7染色体上。各QTL的LOD值在3.62 ~ 8.37之间,可解释8.2% ~ 20.0%的表型变异。6个QTL贡献率超过10%,位于第3染色体的Mp3.2贡献率（2007秋季20.0%,LOD = 8.37）最大;位于第6染色体的Mp6.2（2006春季13.9%,LOD = 5.95;2007秋季11.9%,LOD = 5.10;2009春季11.5%,LOD = 4.38）在两季的位置都很稳定。获得紧密连锁（< 10 cM）的特异标记（SSR04635、SSR13466、SSR00584、SSR10449）为将来进行QTL精细定位提供了参考。  相似文献   

多样性序列芯片技术(DArT)的原理及应用     

冯艳丽  武剑  王晓武 《中国蔬菜》2010,1(2):1-6

多样性序列芯片技术(DArT)是一种基于杂交的分子标记技术,利用芯片技术来辨认和检测DNA多态性的分子标记,用于基因组型分析具有高质量、高通量、低成本且不需要已知序列信息等优点。本文介绍了DArT技术的原理及要点,以及对基因组复杂性降低方法的改进;阐述了其在种质资源、遗传图谱构建等方面的应用。  相似文献   

甘蓝显性雄性不育基因CDMs399-3紧密连锁的分子标记     

张新梅  武剑  郭蔼光  张慧  方智远  王晓武 《中国农业科学》2009,42(11):3980-3986

 【目的】筛选与甘蓝显性雄性不育基因CDMs399-3紧密连锁的分子标记。【方法】以甘蓝显性核不育为不育源转育获得的芥蓝BC4分离群体226个单株为试材,利用SRAP、SSR技术结合集群分析法筛选与CDMs399-3紧密连锁的分子标记。【结果】获得8个SRAP、1个SSR和1个SCAR标记与不育基因连锁,最近的双侧翼标记ENA14F-CoEm7R和8C0909,连锁距离分别为0.53和2.55 cM,并将侧翼标记ENA14F-CoEm7R转化为SCAR标记。【结论】本研究丰富了与CDMs399-3连锁的分子标记,获得多个紧密连锁的标记为该不育基因标记辅助转育和进一步精细定位奠定了良好的基础。  相似文献   

农村人口转移与小城镇建设初探   总被引：2，自引：0，他引：2  

江占民  武剑 《北京农学院学报》2002,17(1):64-68

农村人口转移与小城镇建设是国家未来"十五和2015年规划"战略重点之一.农村人口转移和小城镇建设是相互联系的两个问题,其互动关系的研究将有利于两者的协调发展.本文对农村人口转移现状、小城镇发展的动因和互动关系进行了分析,提出了相应的对策.  相似文献   

白菜类作物BrFLC5与开花时间相关的dCAPs标记开发     

张学铭  刘博  胡云艳  刘静  王晓武  武剑 《园艺学报》2014,41(10):2035-2042

为了揭示BrFLC5对白菜类作物抽薹开花的作用机制,克隆了12份开花习性不同的白菜类作物BrFLC5基因exon2 ~ exon4特异序列,分析发现在exon3的Pi3 + 1存在G–A变异,并开发了dCAPs标记。通过对来自10个不同栽培种群的93份材料进行开花时间调查和基因型检测,发现该基因的分子标记与开花时间表型显著相关（P < 0.05）。因此,用该标记可以进行抽薹开花分子标记辅助选择育种。  相似文献