核果类果树中microRNAs的生物信息学预测及验证   总被引：2，自引：0，他引：2  

罗晓燕  侍婷  蔡斌  高志红 《林业科学》2012,48(2):75-81

microRNA(miRNAs)是一类非编码小分子RNA,在植物生长发育、新陈代谢以及逆境生理中起重要作用。基于生物信息学的基因搜索和同源搜索,从NCBI数据库中登录的核果类果树的EST和GSS中寻找miRNAs。从核果类果树的107982条ESTs和48273条GSSs中搜寻到了11条miRNAs前体序列,编码11条成熟体序列,并预测到19个靶基因,分别编码与生长发育、新陈代谢和转录调节等相关的蛋白。利用miRbase数据库进一步分析表明:11条miRNAs属于8个microRNA家族,分别来自桃和梅,其大小为20～23bp,其中6条为21bp,而且ppe-miR162a和ppe-miR164f保守性最高。采用poly(A)RT-PCR方法随机对预测的ppe-miR156h,pmu-miR482,ppe-miR399a,ppe-miR171a进行组织表达验证,发现ppe-miR156h在果梅花芽中表达,pmu-miR482,ppe-miR399a,ppe-miR171a在桃叶片中表达。  相似文献   

“人才红利”引领科技进步——创新活力助推产业升级     

叶颖  蔡斌 《绿色中国(综合版)》2014,(24):67-70

在海蓝化工集团有限公司工作的日本专家宫本光雄，目前，喜获2014年度浙江省人民政府“西湖友谊奖”!宫本光雄是日本森田化学株式会社社长顾问，一直从事氟化学产品的研发、质量管理及企业策划等工作，先后获3项发明专利，并已产业化。2011年起，与海蓝接触，去年4月被聘为公司副总经理兼总工程师。  相似文献   

果树中基因枪法遗传转化的研究进展   总被引：2，自引：1，他引：1  

佟兆国  蔡斌华  章镇  王富荣  张开春  闫国华  周宇 《果树学报》2008,25(3):389-395

目前,应用于果树遗传转化的方法主要有农杆菌介导法和DNA直接导入法。介绍了DNA直接导入法中基因枪转化技术的原理、类型和基因枪的轰击参数、受体材料、基因型、轰击前后的培养条件等对其遗传转化频率的影响,并系统地概述了基因枪法在选择标记基因、报告基因、改良果树性状相关基因、启动子及多基因遗传转化中的应用研究进展,同时对果树基因枪转化研究中存在的问题及应用前景进行了讨论。  相似文献   

通过玻璃化超低温处理脱除草莓轻型黄边病毒(SMYEV)研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

蔡斌华  张计育  渠慎春  高志红  乔玉山  章镇  朱峰 《果树学报》2008,25(6):872-876

以草莓品种明宝为材料,取茎尖做初代培养,继代扩繁5次后,取2mm左右的茎尖,利用玻璃化超低温技术对SMYEV进行脱除,并利用结合内标的多重RT-PCR技术对再生植株进行病毒检测。结果表明,在病毒脱除过程中,预培养蔗糖浓度为0.5mol/L,处理3d;装载处理为25℃,60min;玻璃化处理为0℃,120min;液氮处理60min后,进行40℃水浴2min,草莓茎尖的存活率为76%,而草莓轻型黄边病毒的脱除率为95%。只有通过液氮处理才可以脱除该病毒,液氮处理前的玻璃化处理脱毒率为0。利用超低温脱毒法可以简便有效地脱除SMYEV。  相似文献   

梅PmmiR319a与靶基因PmTCP2的验证与表达分析     

王万许  侍婷  高志红  倪照君  蔡斌华 《核农学报》2018,(10)

为验证PmmiR319a与PmTCP2基因的靶标关系,并研究PmmiR319a在梅花芽发育过程中的作用,本研究以梅品种‘大嵌蒂’为试验材料,克隆梅PmmiR319a前体序列及其靶基因PmTCP2,采用5'RACE技术对两者之间的靶标关系进行验证,并进一步分析在花芽发育过程中的表达模式。结果表明,梅PmmiR319a前体序列含有茎环结构,通过序列比对和系统发育分析发现,不同物种的miR319a前体序列的茎环发卡结构和成熟体区域表现出较高的保守性。梅PmTCP2基因全长1 500 bp,编码499个氨基酸。荧光定量PCR分析结果表明,PmmiR319a在梅花发育的前期表达量高,而PmTCP2在梅花发育的中期和后期表达量较高,PmmiR319a与预测靶基因PmTCP2的表达模式呈负相关,表明二者存在负调控的关系,与预测的靶标关系一致。RLM-5'RACE技术验证结果表明,PmmiR319a对其靶基因PmTCP2的mRNA进行了切割,切割位点位于第10和第11个碱基之间。由此可知,PmmiR319a通过调控靶基因PmTCP2影响花的发育。本研究结果为阐明梅花中miR319a的功能提供了一定的理论依据。  相似文献   

雏鸡大肠杆菌和副鸡嗜血杆菌混合感染的诊治     

严汉权  姜红玉  蔡斌  彭志凌 《养殖技术顾问》2010,(6):175-175

随着饲养规模的扩大,加之饲养者的管理水平、科技水平低下,导致鸡病的混合感染疾病增加,现将1例大肠杆菌和副鸡嗜血杆菌混合感染病例及其防治措施报道如下,供同仁参考。  相似文献   

适于葡萄不同组织RNA提取方法的筛选   总被引：5，自引：0，他引：5  

张彦苹  王晨  于华平  蔡斌华  房经贵 《西北农业学报》2010,19(11):135-140

比较了CTAB法、改良CTAB法、Trizol法、SDS-苯酚法和改良SDS法5种RNA提取方法提取葡萄叶片、花序、茎尖、卷须和果实组织RNA的效果。并进一步从总RNA中分离出了高质量的低分子量RNA(LMWRNA),建立了葡萄LMWRNA提取的方法。改进后的改良SDS法能够克服果实中RNA提取难度大的问题,能够从果实中提取到质量和产量都很高的RNA。结果表明,改良SDS法适用于葡萄叶片、花序、茎尖、卷须组织中总RNA的提取,改进的改良SDS法是从果实中提得LMWRNA较佳选择。在总RNA提取的基础上建立的葡萄LMWRNA提取方法能够达到研究的要求。  相似文献   

中国西藏小反刍兽疫的发生状况与防控   总被引：1，自引：0，他引：1  

王乐元  次真  吴国珍  安荣祥  周明  多杰热登  蔡斌 《畜牧兽医学报》2011,42(5):717-720

2007年7月,我国首次在西藏自治区阿里地区发生了小反刍兽疫疫病流行.从2007年7月9日到11月15日,先后在阿里地区革吉、日土、札达、改则4个县出现疫情,共20个疫点,羊发病6122只,死亡1888只.2008年6月,在那曲地区尼玛县双湖区再次发现小反刍兽疫疫情,病羊及同群羊合计6690只.为消灭该病,采取了扑杀、...  相似文献   

苹果CAX基因家族生物信息学和表达分析     

张璐  刘帅  竹龙鸣  蔡斌华  章镇  王三红 《南京农业大学学报》2015,38(1):41-49

[目的] CAX(Ca2+/H+exchanger antiporter)是一类重要的跨膜转运蛋白,在植物体内阳离子转运上起着非常重要的作用.本文对苹果MdCAXs基因进行了生物信息学和组织特异性表达分析,以期为该类基因的功能研究奠定基础.[方法]利用生物信息学的方法对苹果MdCAXs基因家族染色体定位、蛋白质等电点、亲疏水性、跨膜区域、亚细胞定位及保守结构域进行了预测和分析,同时还分析了MdCAXs基因与其他物种CAXs基因的进化关系.采用实时荧光定量PCR法对苹果MdCAXs基因在不同盐处理下根、茎、叶中的表达变化进行分析.[结果]苹果MdCAXs家族包含8个成员,分别属于CAXsⅠ型中的A亚型和B亚型,编码436～817个氨基酸,等电点4.97～7.12,且都为疏水性蛋白;所有MdCAXs基因编码的氨基酸都有11个及以上的跨膜区域,含有CAXs基因5个典型的功能域:N-端自抑制区域(NRR)、C-端功能区域、Ca2+功能域(CaD)、C功能域和D功能域.亚细胞定位预测MdCAXs主要是定位在质膜和内质网上.苹果MdCAXs基因具有组织特异性表达特点,不同种类盐处理根、茎、叶中表达发生不同程度的变化,反映了MdCAXs存在功能上的差异,对不同阳离子有特异性的应答反应.[结论]苹果MdCAXs是一类跨膜转运蛋白,具有植物CAXs基因典型的结构特征,根、茎、叶对不同的盐离子具有不同的表达响应.  相似文献   

"猪小龙"是发展生猪规模养殖的"推进器"     

蔡斌 《养猪》2007,(4):32-32

如东县是江苏省小有名气的生猪养殖大县,常年存栏生猪110万头(含仔猪),其中能繁母猪14万头,是苏中地区最大的苗猪生产基地,生产的优质  相似文献