不同温度下TMV侵染枯斑三生烟的LncRNA差异表达     

贾海燕  宋丽云  徐翔  解屹  张超群  刘天波  赵存孝  申莉莉  王杰  李莹  王凤龙  杨金广 《中国农业科学》2020,53(7):1381-1396

【目的】 筛选不同温度下烟草花叶病毒（Tobacco mosaic virus,TMV）侵染后枯斑三生烟（Nicotiana tabacum var. Samsun NN）差异表达的长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）,研究lncRNA在枯斑三生烟抗性反应中的作用。【方法】 N基因的温度敏感性使枯斑三生烟在25℃时具备对TMV的抗性、在31℃抗性丧失,在这两个温度条件下对枯斑三生烟接种TMV和磷酸盐缓冲盐水（phosphate buffered saline,PBS）,48 h后提取系统叶总RNA,构建链特异性文库后进行深度测序。对测序结果进行过滤后利用HTSeq将有效数据与近缘品种TN90（N. tabacum var. TN90）基因组比对,筛选得到lncRNA后利用FPKM法估计lncRNA的表达水平。通过edgeR筛选差异表达lncRNA（differentially expressed lncRNA,DElncRNA）,并利用qRT-PCR技术对这一结果进行验证。通过共定位及共表达分析预测DElncRNA的靶基因,通过参考基因组注释、GO和KEGG富集分析研究靶基因的功能。【结果】 4个处理共12个样本经lncRNA-seq各测得约8 000万条clean reads,共获得4 737条已知lncRNA、40 169条新lncRNA。其中64个lncRNA在不同温度条件下TMV侵染后存在差异表达,qRT-PCR测定结果显示这些lncRNA的测序正确率在80%左右,表明本研究所得测序数据具备较高的可信度。对DElncRNA进行靶基因预测,发现一些基因同时被25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶向。靶基因注释功能丰富,主要参与植物抗病、激素和代谢等生理过程。部分可能与激素通路相关的lncRNA,在25℃下TMV侵染时呈现下调趋势,而在31℃下TMV侵染则呈现上调趋势。GO富集分析显示靶基因主要参与构成膜、囊泡等组分,具备钙、钾离子通道抑制剂活性等分子功能,使相应离子得以转运引发随后的反应,同时也参与发病、抗原加工和呈现、细胞分裂素代谢等生理过程。KEGG分析发现靶基因显著富集在植物激素信号转导通路,25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶基因同时富集在激素信号传导、ABC运输蛋白、苯丙烷类生物合成等通路。【结论】 不同温度（25℃和31℃）条件下TMV侵染枯斑三生烟后,长链非编码RNA差异表达,DElncRNA通过作用于激素信号传导、物质转运等过程参与寄主系统获得性抗性反应。研究结果可为揭示植物系统获得性抗性中lncRNA的调控功能以及新型抗病毒技术开发提供依据。  相似文献   

榄溪菊韵的景观特色分析     

沈顺锋  吴桂昌 《广东园林》2015,(3)

小榄菊花会是广东省中山市小榄镇一项重要的民俗活动。以菊花会200周年景点之一的榄溪菊韵为例,从园林景观的角度分析了菊花与湿地景观融合、菊花与园林造景等方面的关系,为菊花在园林中的应用提供了新的思路,阐述弘扬小榄菊花文化和保护湿地的重要性。  相似文献   

基于粒子群算法的海洋平台热介质锅炉PID参数优化     

郝宝齐  沈彬  孙勤江 《山东饲料》2015,(6)

文中采用串级控制作为海洋平台热介质锅炉的控制方案，采用粒子群算法对PID控制器的比例带啄、积分时间Ti进行最优化，从而实现热介质锅炉温度的自动控制。通过粒子群算法进行串级控制系统PID参数优化，提高了控制系统的控制精度、可靠性、稳定性，具有工业应用价值。  相似文献   

红松无性系种子园与实生种子园种实性状观测     

宋双林  王元兴  董元海  董淑英  张玉东  张伟娜  张连中  赵福安  祝培敏  沈广平 《吉林林业科技》2011,(5):9-10,50

建立红松无性系种子园和实生种子园的实践证明:嫁接母树的结实株数、结实率、公顷产种量、种子千粒重等9项种实性状均优于实生母树,关键种实性状指标结实率、公顷产种量、出种率、种子千粒重、出仁率分别是实生母树的3.67倍、2.74倍、1.16倍、1.02倍和1.12倍.  相似文献   

BI-2000图像分析系统在家兔失血性休克实验中的应用     

陈雪  安英  沈楠  徐博  赵丽晶 《动物医学进展》2017,38(12)

家兔失血性休克实验是《医学机能学》实验中的一个重要组成部分,在日常教学过程中,传统经典实验只观察血压的变化,针对这一问题,我院引进BI-2000图像分析系统,并在2014级临床医学教改班家兔失血性休克实验中应用,使学生对于休克发生、进展的机制有了更深刻的理解,对休克各期微循环血液灌流的变化特点有了更直观的认识。  相似文献   

Nutrient uptake requirements with increasing grain yield for rice in China     

CHE Sheng-guo  ZHAO Bing-qiang  LI Yan-ting  YUAN Liang  LIN Zhi-an  HU Shu-wen  SHEN Bing 《中国农业科学(英文版)》2016,(4):907-917

Improved estimates of nutrient requirements for rice（Oryza sativa L.）in China are essential to optimize fertilization regulation for increasing grain yields and reducing the potential of environmental negative influences,especially under high-yielding intensive systems.A database involving rice grain yields,nutrient concentrations and accumulations collected from on-field station experiments in the literatures published from 2000 to 2013 in China was developed to understand the relationships between grain yields and plant nutrient uptakes,and to quantify nutrient requirements for different yield levels.Considering all data sets,rice grain yield ranged from 1.4 to 15.2t ha^-1with the mean value of 7.84t ha^-1,and ca.10.4%of yield observations were higher than the yield barrier level of 10 t ha^-1.N requirement to produce one ton grain was 21.10 kg for the yield range<4.0t ha^-1with a high variation of 45.8%.Except of the yield range<4.0t ha^-1,the values of N requirement,firstly increased from 18.78 kg for yield range 4.0-5.5 t ha^-1to 20.62 kg for yield range 7.0-8.5 t ha^-1,then decreased slightly to 19.67 and19.17 kg for the yield range 8.5-10 and>10 t ha^-1,respectively.Phosphorus（P）and potassium（K）requirements showed increasing trends,from 3.51 and 19.87 kg per t grain for<4.0 t ha^-1yield range to 4.10 and 21.70 kg for>10.0t ha^-1range.In conclusion,nutrient requirement varied with increasement of grain yield,and N,P and K presented various response trends,increasing,declining or stagnating,which would be of great benefit for improving fertilizer strategies.  相似文献   

生殖细胞早期发生与减数分裂启动调节机制的研究进展     

张连君  张西锋  陈波  冯艳敏  沈伟 《青岛农业大学学报(自然科学版)》2011,(3):181-187

卵巢性生殖疾病发生的主要原因之一是卵子发生过程中减数分裂发生或染色体分离异常。为了更好地进行这些生殖疾病的诊断和治疗,需要充分地了解个体发育的生物学过程中及关键时间点。鉴于此,本文主要阐述了哺乳动物生殖细胞早期发生和减数分裂启动的生理过程,介绍生殖细胞的出现、迁移、性别分化和减数分裂的整个过程。深入了解卵母细胞发生过程将为利用体外发育来源的卵母细胞治疗卵巢性生殖疾病,克服女性不孕、卵巢早衰等重大疾病提供一定的理论支持。  相似文献   

Cloning and Sequence Analysis of Complete Genome of Porcine Circovirus Type 2 from Liaoning Province     

DONG Ye  GUO Shi-qi  SUN Xue  SHEN Guo-shun  LIU Li-xia 《中国畜牧兽医》2015,42(11):2895-2901

It was aimed to lay a foundation for epidemiological survey of porcine circovirus type 2(PCV2) in Liaoning province and selection of highly homologous strain inactivated vaccine.Some pigs suspected of having postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) from Shenyang,Chaoyang,Tieling,Dalian and other places in Liaoning province,were detected by PCR method,then the whole genome of 10 positive samples were cloned and sequenced.The result showed that all of them were virulent strains,9 strains were 1767 bp and 1 strain was 1768 bp,and there was a T base additon at 1039 bp.The nucleotide homology was 95.1% to 98.5% with HM038034 and JQ692110.In the phylogenetic tree,JHZ2 was PCV2a type,the other 9 strains were PCV2b type,DLS38,LYD32 and SYX7 were in the same branch and same onset time.The amino acid homology of ORF2 was 89.6% to 100.0%,there were 35 mutation points,large degree of variation,the only glycosylation site (NYS) was conserved.10 strains did not change significantly,mutants were not due to PCVD,PCV2b was the predominant type,and PCV2 was related with seasonality.  相似文献   

水稻卷叶突变体rlm1的基因克隆     

申雅君  崔学安  张治国  吴金霞 《中国农业科技导报》2016,18(2):25-30

叶片是植物光合作用的主要场所,优良的叶片形态有利于塑造理想的株型,提高光合效率。为了研究叶片形态建成的分子机制,自水稻T-DNA插入突变体库中筛选获得1个叶片半卷曲的卷叶突变体(roll leaf mutant,命名为rlm1),突变体rlm1主要特征为成熟叶片沿中脉向内卷,叶片最终卷成直立半圆筒状,叶片卷曲度达0.64,叶片直立参数达95,且光合效率显著优于野生型。通过图位克隆技术,确定突变体rlm1突变位点位于LOC_Os03g06654基因的第1个内含子,LOC_Os03g06654基因编码黄素单氧化酶(flavin-containing monooxygenase),RT-PCR表达分析表明LOC_Os03g06654基因因T-DNA插入而导致完全失活。该基因与已报道的水稻卷叶基因Os COW1(Constitutively Wilted 1)为等位基因,而且突变体rlm1所表现的农艺性状均佳,可期待利用该突变体进行高光合的育种实践。  相似文献   

绍兴黄酒陶坛氧传递速率研究     

周晓丹  王睿琪  沈启添  朱依瑶  吴雨涵  田润刚 《西北农业学报》2016,25(6):950-954

传统绍兴黄酒贮存于陶坛,因陶坛透气,进入陶坛的氧气可促进黄酒成熟,并影响黄酒的颜色、风味和稳定性。为研究黄酒贮存过程中陶坛的氧传递速率,以Fe~(2+)溶液为还原剂,绍兴黄酒密封于陶坛贮存30d后,进入陶坛的O_2会将Fe~(2+)氧化为Fe~(3+),采用硫氰酸钾比色法测定Fe~(3+)质量浓度,可估算出贮存期进入陶坛的氧气量及氧传递速率。结果表明,传统陶坛的日均氧传递速率(OTR)为0.106mg/L,为设计带有微氧化装置的黄酒专用大型不锈钢贮酒罐提供理论依据。  相似文献