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71.
水稻颖花开放前浆片转录组变化 总被引:6,自引:0,他引:6
【目的】水稻颖花开放是由其基部的一对浆片吸水膨大所启动。测序技术的发展为从细胞整体水平研究浆片对颖花开放的分子响应,从而对掌握浆片调控颖花开放的内在分子机制提供更为快速、有效的方法。【方法】以常规籼稻品种中早25为材料,应用Illumina测序技术对水稻颖花开放前12 h和临开放前1 h 2个时间点的浆片转录组进行测序,将所得高质量的序列(clean reads)与籼稻9311参考序列比对,获得唯一比对上某一参考基因匹配的reads(unique reads),采用RPKM法计算基因表达量,并在此基础上以FDR≤0.001和|log2Ratio|≥1为条件筛选出两样本间差异表达的基因,通过与Gene Ontology(GO)数据库、KEGG pathway数据库以及联合蛋白质数据库中的UniProtKB等数据库比对注释差异表达基因的功能和可能参与的分子调控途径。【结果】从水稻颖花开放前12 h和临开放前1 h 2个时间点的浆片转录组中分别检测到有26 369和26 157个表达基因,2个时间点的转录组之间存在3 924个差异表达基因,其中2 623个基因呈现下调表达和1 301个基因呈现上调表达,有105个基因表达差异倍数高达100倍以上(即|log2Ratio|≥6.7)。GO分析结果表明被注释分子功能的差异基因有1 624个,其中21.7%基因具有离子结合活性、10.3%具有氧化还原酶活性、5.4%具有转运活性。富集于生物学过程的差异基因有1 313个,其中15.0%的差异基因参与定位、12.4%参与运输、4.7%参与碳水化合物代谢、4.5%参与脂类代谢。Pathway显著性富集分析发现有2 229个差异基因参与了123条代谢途径,其中,富集基因数目较多的途径主要包括次生物质生物合成(399个)、植物激素信号转导(152个)、核苷酸代谢(146个)以及淀粉和糖代谢(64个)等路径。花前1 h浆片中特异表达且唯一比对上基因的reads数(Uniq-reads_ num)超过30的基因的功能主要涉及细胞壁重塑、质膜的稳定性、能量代谢、基因转录调节以及信号转导等生命活动。茉莉酸及其类似物对水稻颖花开放有强烈的诱导效应,差异表达基因中有16个基因参与了茉莉酸生物合成途径以及11个基因参与了茉莉酸的信号转导过程,且随着颖花开放时间的临近,多数基因表达水平显著提高。【结论】获得颖花开放前12 h和临开放前1 h浆片中差异表达基因的表达变化模式及其功能信息,发现参与调控碳水化合物代谢与运输、细胞能量代谢、细胞壁结构修饰以及茉莉酸等激素代谢与信号转导等生理过程的基因在颖花临开前被强烈诱导或抑制表达,提示这些基因与浆片细胞吸水膨大调控水稻颖花开放密切相关。 相似文献
72.
水稻颖花开放前花器官茉莉酸水平变化及浆片茉莉酸信号基因表达分析 总被引:2,自引:0,他引:2
【目的】水稻颖花开放是由浆片膨大所启动的,并与花丝伸长和花药开裂同步发生。脂类衍生的茉莉酸(JA)激素在植物生殖发育中发挥重要调控作用。本文分析水稻颖花开放过程中花器官JA水平及浆片JA信号基因表达的动态变化,以进一步揭示内源JA信号在水稻颖花开放中的作用。【方法】以粳稻中花11颖花自然开放前18 h(18 h BF)和临近开放时0 h(0 h BF)的颖花器官(小穗梗、内外稃、浆片、雄蕊、雌蕊)为试验材料。100 mg液氮研磨的样品经甲醇﹕水﹕乙酸(80﹕19﹕1,体积比)混合液提取、氮气浓缩和0.22 μm滤膜过滤后,直接应用超高速液相色谱-电喷雾-质谱系统(UFLC-ESI-MS)测定JA含量。Trizol试剂提取水稻总RNA,DNaseⅠ消化残存的基因组DNA,M-MLV逆转录酶合成第一链cDNAs。JA生物合成和信号转导相关基因的表达分析采用SYBR Green实时定量 PCR技术,以水稻GAPDH作内参。试验设置2次生物学重复,差异显著性分析采用t测验。【结果】水稻颖花开放前18 h,花器官中小穗梗JA水平(16.0 ng·g-1 FW)最高,内外稃次之(6.1 ng·g-1 FW),雄蕊、浆片和雌蕊极低(小于4.0 ng·g-1 FW)。颖花开放时,小穗梗JA水平下降了69%,内外稃升高了71%,雌蕊、雄蕊和浆片JA水平分别上升至19.0、77.2和52.4 ng·g-1 FW。颖花开放时雄蕊和浆片的JA水平显著高于其他花器官,而小穗梗JA含量最低。与JA水平变化相一致,颖花开放时JA生物合成相关基因OsDAD1、OsAOS1、OsAOC及OsOPR7在雄蕊和浆片中的表达大幅上升,在内外稃中略有上升,而在小穗梗中的表达明显下调。但是,颖花开放时这些JA生物合成相关基因在雌蕊中的表达不上调,与JA水平变化不一致。OsLOX2和OsAOS2在小穗梗和内外稃中的表达水平较高,而在浆片、雄蕊、雌蕊中的表达水平极低。伴随颖花开放时浆片JA水平的大幅上升,浆片JA信号转导途径相关基因OsJAR1、OsCOI1b以及13个OsJAZs的表达也明显上调。其中,OsJAZ11的表达水平上升幅度最大,升高了近520倍。然而, OsJAR2、OsCOI1a、OsCOI2、OsJAZ5和OsJAZ15在浆片中的表达没有上调。【结论】内源JA在水稻颖花器官中的分布具有组织和发育时期特异性。结合外源JA对水稻颖花开放的灵敏诱导,颖花开放时浆片JA的积累以及JA生物合成和信号转导途径相关基因的差异性激活,强烈表明内源JA信号介导水稻浆片膨大的调控。 相似文献
73.
旨在制作鸡的急性药物性肝损伤模型,将40只33日龄SPF级白羽鸡随机分成4组,每组10只,模型组灌胃不同浓度的恩诺沙星(200、150、100 mg/kg),对照组灌胃等体积蒸馏水,每天给药1次,连续给药5 d。最后1次灌胃后,禁食不禁水,24 h后空腹称重并颈静脉采血用于肝功能检测,取肝脏计算肝指数、剖检后肉眼观察、组织切片进行HE染色观察肝脏组织病理学变化。结果显示,模型组丙氨酸氨基转移酶(ALT)和直接胆红素(DBIL)同时升高,其中DBIL升高至对照组的2倍以上;总胆红素(TBIL)、碱性磷酸酶(ALP)和天冬氨酸氨基转移酶(AST)同时升高,其中TBIL升高至对照组的2倍以上,认为这2组指标可以作为恩诺沙星致鸡急性肝损伤诊断的生化参考依据;模型组肝脏病理切片均有不同程度的肝细胞病变,可视为鸡急性药物性肝损伤诊断的"金标准"。结果表明,鸡连续灌胃100 mg/kg的恩诺沙星5 d可以制作急性药物性肝损伤模型,此模型可用于保肝护肝药物筛选和药物性肝损伤机制的研究。 相似文献
74.
将30头健康临产母猪(大白×长白)随机均分为I、Ⅱ、Ⅲ组。I组为对照组;Ⅱ、Ⅲ组为试验组,在预产期前3天分别在饲料中加拌0.75%和1.5%比例中药超微粉(d<30μm)。母猪产仔后将仔猪按照母猪的分组分为Ⅰa、Ⅱa、Ⅲa组,在仔猪7、14、21日龄分别从各组仔猪中抽取5头仔猪进行采血进行T淋巴细胞亚群和细胞因子检测。结果表明,两试验组仔猪CD4+显著提高(P<0.05)、CD4+显著提高(P<0.05)、CD4+/CD8+/CD8+有升高趋势;IL-2、INF-γ较对照组差异显著(P<0.05);1.5%剂量试验组TNF-α含量与对照组差异显著(P<0.05)。 相似文献
75.
优化黄皮叶挥发油的提取条件,并分析挥发油的化学成分及相对含量。采用水蒸气蒸馏法提取黄皮叶挥发油,以料液比、浸泡时间、提取时间为考察因素进行单因素试验;在单因素试验基础上,以挥发油得率为评价指标,进行正交试验确定黄皮叶挥发油最佳提取工艺;采用气相色谱-质谱法(GC-MS)对黄皮叶挥发油进行成分分析和含量测定。结果显示,黄皮叶挥发油最佳提取工艺为浸泡时间2 h、提取时间4 h、料液比为1∶10(m∶V),挥发油得率为0.50%,GC-MS共分离鉴定出37种化合物,以芳香烃、萜类化合物及其含氧衍生物等为主,占挥发油总量的96.49%。本试验明确了水蒸气蒸馏法提取黄皮叶挥发油的优化工艺和挥发油的成分,可为黄皮叶挥发油的工艺研究、标准制定和规模化生产提供理论依据。 相似文献
76.
为了探究火炭母临床用药的安全性,试验进行火炭母对小鼠的急性毒性和大鼠的长期毒性研究。在急性毒性预试验中,SPF级KM小鼠最高攻毒剂量达到6 000 mg/kg时所有小鼠未死亡,故正式试验SPF级KM小鼠每个重复10只(雌雄各半),一次性灌胃给药,重复2次,给药后4 h内仔细观察受试小鼠的临床表现,连续观察7 d。长期毒性研究中,将80只SPF级SD大鼠随机分为火炭母高剂量组(40 g/kg)、中剂量组(20 g/kg)、低剂量组(10 g/kg)和空白对照组,每组20只(雌雄各半)。高、中、低剂量组连续饲喂药化饲料30 d,空白对照组饲喂基础日粮30 d。攻毒结束后每组随机取10只大鼠(雌雄各半),后腔静脉采血用于血常规、血清生化指标检测;按照动物福利安乐死后进行大体剖检变化观察,采集主要脏器测量脏器系数,对高剂量组和空白对照组的主要脏器进行组织病理学检查。每组剩余的10只大鼠用于恢复试验,攻毒组大鼠药化饲料换成基础日粮,继续饲养15 d后检测以上项目。结果表明:急性毒性研究中,火炭母半数致死剂量(LD50)大于5 000 mg/kg,属于实际无毒级别。长期毒性研... 相似文献
77.
茉莉酸甲酯对水稻白叶枯病的诱导抗性及相关防御酶活性的影响 总被引:7,自引:5,他引:2
为探索茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)诱导水稻抗白叶枯病的效应,采用MeJA喷雾处理剪叶接种法,测定MeJA对水稻幼苗的白叶枯病病情指数、白叶枯病病菌Xanthomonas oryzae pv.oryzae的抑菌效果及对叶片过氧化物酶(peroridase,POD)、过氧化氢酶(catalase,CAT)、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)和苯丙氨酸解氨酶(phenylalnaine ammonialyase,PAL)等相关防御酶活性的影响.0.05 ~ 2.0 mmol/L的MeJA能降低水稻幼苗白叶枯病的病情指数,但对水稻白叶枯病菌无直接抑菌活性;0.1 mmol/L MeJA的诱导效果最好,处理48h后,感病品种温229和抗病品种嘉早312的诱导效果分别为73.18%和70.43%;0.05 ~2.0mmol/L的MeJA处理水稻叶片中POD、CAT、SOD、PPO和PAL活性呈上升趋势.研究表明MeJA能诱导水稻幼苗对白叶枯病的抗性,且诱导抗性的产生与MeJA提高水稻相关防御酶的活性有关. 相似文献
78.
[目的]为评价银翘解毒颗粒对鸭人工感染大肠杆菌病的疗效。[方法]以仙湖3号鸭为研究对象,通过体外和体内抑菌试验研究了银翘解毒颗粒防治鸭实验性大肠杆菌病的疗效,并对银翘解毒颗粒的临床安全性进行了探讨。[结果]体外抑菌试验表明,银翘解毒颗粒对鸭大肠杆菌病有抑制作用,其最小抑菌浓度为0.012 5 g/ml。体内抑菌试验中,感染对照组出现典型大肠杆菌病理变化,各试验组临床症状较轻。5.01、.0 g/kg银翘解毒颗粒组中的有效率、痊愈率显著高于感染对照组,5.0、1.00、.5 g/kg 3个剂量组肉鸭的相对增重率显著高于感染对照组。临床安全试验表明,银翘解毒颗粒剂的安全性较高。[结论]银翘解毒颗粒可用于防治鸭大肠杆菌病,以1.0g/kg的防治效果最佳。 相似文献
79.
PBL(Problem Based Learning)教学法直译为"以问题为基础的学习",是1969年由美国神经病学教授Barrows在加拿大的McMaster大学医学院首创的一种新的教学模式,1993年在爱丁堡世界医学教育高峰会议中得到推荐,目前已成为国际上较为流行的教学方法。PBL教学法与传 相似文献
80.
“黄芩、大黄”合剂对人工诱发传染性喉气管炎患鸡血液SOD、MDA水平的影响 总被引:2,自引:0,他引:2
132只60日龄青年鸡随机平均分为三组:不感染不给药的健康对照组,感染不给药的感染对照组和感染同时给予1%“黄芩、大黄”合剂的中药预防组。在实验前1d、感染症状最明显时(实验第5d)、临床症状消失后(实验第15d)采血检测SOD(抗氧化酶)、MDA(脂质过氧化物)水平变化。结果表明,自由基介导了鸡传染性喉气管炎(ILT)疾病的发生和发展过程,“黄芩、大黄”合剂能提高抗氧化酶活性,清除介导ILT疾病产生的过多自由基,从而发挥保护机体免受自由基攻击的作用。 相似文献