意大利蜜蜂工蜂中肠发育过程中长链非编码RNA的差异表达分析   总被引：7，自引：7，他引：0  

郭睿  耿四海  熊翠玲  郑燕珍  付中民  王海朋  杜宇  童新宇  赵红霞  陈大福 《中国农业科学》2018,51(18):3600-3613

【目的】长链非编码RNA(lncRNA)在真核生物的基因表达、表观遗传和细胞周期调控等方面发挥重要功能。本研究旨在探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠发育过程中lncRNA的表达谱及其作用。【方法】利用RNA-seq技术和链特异性建库方法对意蜂7和10日龄工蜂中肠(Am7、Am10)进行深度测序,下机的原始数据经过Perl脚本过滤得到高质量有效读段。利用bowtie工具将有效读段比对核糖体数据库,进一步利用Top Hat2软件将未比对到核糖体数据库上的数据比对到参考基因组。利用CPC和CNCI软件对转录本的编码能力进行预测。通过RT-PCR对部分lncRNA进行鉴定。利用edgeR软件进行差异表达lncRNA(DElncRNA)分析,进而预测lncRNA的上下游基因,并对上下游基因进行GO及KEGG代谢通路富集分析。联用RNAhybrid、Miranda和Target Scan软件预测DElncRNA靶向结合的mi RNA及mi RNA靶向结合的靶基因,并通过Cytoscape软件构建DElncRNAs-mi RNAs-m RNAs的调控网络。最后,通过RT-qPCR验证测序数据的可靠性。【结果】Am7和Am10的深度测序分别获得134 802 058和147 051 470条原始读段,经严格过滤分别得到134 166 157和146 293 288条有效读段;共得到3 890个DElncRNA,包括2 005个上调lncRNA与1 885个下调lncRNA。RT-PCR验证结果显示共有8个lncRNA能扩增出符合预期的目的片段,表明预测出的lncRNA真实存在。DElncRNA的上下游基因数为1 793个,它们涉及42个GO条目,包括代谢进程、发育进程、细胞进程、应激反应和免疫系统进程等;这些上下游基因还涉及251条代谢通路,包括碳代谢、嘌呤代谢和脂肪酸的生物合成等物质代谢通路,硫代谢、甲烷代谢和氧化磷酸化等能量代谢通路,Hippo信号通路、Wnt信号通路和Notch信号通路等信号通路,溶酶体、内吞作用和泛素介导的蛋白水解等细胞免疫通路,以及MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路和NF-kappa B信号通路等体液免疫通路,上述结果表明DElncRNA在意蜂中肠发育过程中参与物质和能量代谢、细胞生命活动和免疫调控。进一步分析发现TCONS_00020918可通过调控西方蜜蜂王浆主蛋白1编码基因在意蜂工蜂中肠的营养吸收、级型分化中发挥功能。DElncRNA的调控网络分析结果显示DElncRNA与mi RNA、m RNA间存在复杂的调控关系,部分DElncRNA处于调控网络的中心位置且能靶向结合较多的mi RNA,也有部分mi RNA可被多个DElncRNA共同靶向,表明这些DElncRNA可能在中肠发育中发挥重要作用。随机挑取5个DElncRNA进行RT-qPCR验证,结果显示它们的表达量变化趋势与测序结果一致,证实了本研究测序数据的可靠性。【结论】差异表达长链非编码RNA(DElncRNA)广泛参与意蜂工蜂中肠的新陈代谢、细胞活动和免疫调控并作为竞争性内源RNA(ce RNA)发挥作用,研究结果为关键lncRNA的筛选和功能研究提供了必要的数据支持。  相似文献   

香蕉上的新纪录雪松毛刺线虫描述     

杜宇  和万忠  郝文广  李生贵  段禄华  周剑 《植物保护》2010,36(4):170-172

本文对中国云南河口香蕉上的雪松毛刺线虫(Trichodorus cedarus Yokoo)的形态特征进行了描述,其测计值与我国文献记载的杉木、桃、苹果和梨树种群相关测计值比较,香蕉种群的雌雄虫虫体平均长度和b值偏大,口针平均长度较杉木和桃上种群的短,长于苹果和梨树上的种群。该线虫在香蕉根围土发现尚属首次。  相似文献   

不同药剂防除小麦田猪殃殃药效试验     

杜宇  王春兰  崔劲松 《现代农业科技》2019,(6)

为筛选防治小麦田猪殃殃的理想药剂,本文进行了不同药剂防除小麦田猪殃殃的田间药效试验。结果表明,3%双氟·唑草酮悬乳剂、36%唑草·苯磺隆可湿性粉剂对猪殃殃防效好、见效快,施用时应避开寒流天气;20%双氟·氟氯酯水分散粒剂、16%双氟·氯氟吡悬乳剂及20%氯氟吡氧乙酸乳油对猪殃殃有较好的防效且使用安全;苯磺隆对猪殃殃防效差,生产上不宜单独使用。  相似文献   

《贵州林业科技》论文量与科技成果量的关系初探     

杜宇 《贵州林业科技》1998,26(1):44-46

对贵州省１９８０－１９９５年间所取得的林业科技成果量和《贵州林业科技》论文量进行研究表明：贵州林业科研的重点是营林,成果量与文量存在相关性。  相似文献   

肾状线虫属重要种类的鉴定和特征描述   总被引：1，自引：0，他引：1  

杜宇 《植物保护》2008,34(2):101-106

记述了目前世界上认可的肾状线虫属(Rotylenchulus sp.)已知的10个种的重要鉴定特征、世界分布和寄主范围。这10个种包括越南肾状线虫(R.anamictus)、短管肾状线虫(R.brevitubulus)、北方贝肾状线虫(R.borea-lis)、短尾肾状线虫(R.clavicaudatus)、离异肾状线虫(R.leptus)、大囊肾状线虫(R.macrodoratus)、长肾状线虫(R.macrosoma)、微小肾状线虫(R.parvus)、肾形肾状线虫(R.reniformis)和甘蔗肾状线虫(R.sacchari)。并对其最具经济意义的两种线虫的特征进行了描述。  相似文献   

10kV母线电能量不平衡率偏高解决方案一例     

陈新雪  张志琴  杜宇 《农村电工》2010,18(8):41-42

母线的输入电能量、输出电能量之间的差值称为不平衡电能量,不平衡电能量与输入电能量的比值称为母线电能量不平衡率。开展母线电能量不平衡率的统计和分析．是防止各类计量差错发生、检验线损计量系统是否准确的重要手段。降低母线电能量不平衡率是变电站节能降损,防止跑、冒、滴、漏,保证计量准确的一项重要举措。  相似文献   

国际金融危机产生的根源及对中国金融业的影响与机遇     

杜宇 《湖南农机》2010,(2):109-110

近两年来,由美国次贷危机引发的国际金融危机对世界经济产生了重大冲击,在造成美国经济增长明显减缓的同时,一些发达国家和新兴经济体经济也深受其害中国作为全球第四大经济体,金融业也在一定程度上受到本次金融危机的影响,其影响也超过了人们的初步预期。本次危机对中国金融业发展而言也是一次重大机遇,认识本次全球金融危机的根源及对中国的影响对于我国金融业把握机遇实现进一步发展有重大启示。  相似文献   

开家农味店铺好赚钱     

杜宇 《农村百事通》2010,(5):10-10

野菜馄饨店时下,人们基于健康的需要和对返璞归真的追求,对各种野菜怀有特殊的情怀。因此,以营养价值和怀旧情结作为卖点而推出系列野菜馄饨,一定会吸引很多食客,生意经久不衰。  相似文献   

农村工作会议解读之一 城镇化不能侵害农民权益     

董峻  杜宇  王立彬  徐博 《北京农业》2012,(5):6-7

正国务院总理温家宝在2011年12月27日举行的中央农村工作会议上指出,要更加重视维护农民在土地、财产、就业、社会保障和公共服务等方面的权益。一些专家表示,在工业化城镇化加快发展的新阶段,必须适应利益关系的深刻变化和社会进步的要求,以新的思路、新的举措更好地维护农民权益。  相似文献   

我国发布《食品中苏丹红染料的检测方法——高效液相色谱法》国家标准     

杜宇  刘菊花 《中国禽业导刊》2005,22(7):44-44

国家质量监督检验检疫总局和国家标准委29日联合发布《食品中苏丹红染料的检测方法-高效液相色谱法》国家标准，这项标准自发布之日起实施。  相似文献