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通过生物信息学方法及表达分析对水稻纹枯病菌谷胱甘肽S转移酶基因(Rsgst)的功能进行探索。通过水稻纹枯病菌RSIADB基因组数据库查找Rsgst序列,确定该基因在水稻纹枯病菌基因组中的精确位置。利用生物信息学软件预测Rsgst编码蛋白氨基酸序列的基本信息,并使用MEGA 5.0软件构建同源蛋白的系统发育树,最后用qRT-PCR检测Rsgst在菌核发育过程中的基因表达量,同时测定GST的酶活性。结果表明,Rsgst全长1 207 bp,该基因共编码277个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为30.90 ku,理论等电点为9.42。该蛋白二级结构中以α-螺旋为主,占41.52%。系统发育树表明,水稻纹枯病菌GST蛋白与担子菌类玉米丝黑穗病菌GST蛋白亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明,Rsgst在水稻纹枯病菌菌核发育过程中表达量不断上调,基因最高表达量是在第60小时,为7.64,而Rsgst的最高酶活性是在第5天,其酶活为0.375 U/μg。结果可为预测水稻纹枯病菌中Rsgst基因的功能奠定基础。 相似文献
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在前期研究中,采用RNA-seq技术获得了在水稻纹枯病菌菌核发育过程中差异表达的6个自噬相关基因,为阐明这些基因在水稻纹枯病菌菌核发育过程中的表达模式,提取了菌核发育过程中3个阶段的RNA,根据特异基因的序列设计引物,采用实时荧光定量PCR技术分析这些基因的表达谱。结果表明,丝氨酸/苏氨酸激酶和ssp1、ATG13和Vam6基因的表达量在白色菌核形成阶段的表达量显著升高,而在菌核发育成熟阶段的表达量明显下降。而丝氨酸/苏氨酸-蛋白磷酸酶基因和丝氨酸/苏氨酸激酶受体相关蛋白基因的表达量在菌核发育阶段呈现出连续下降的趋势。研究发现这6个与细胞自噬有关的基因的表达谱与转录组测序的结果一致,表明转录组测序的结果可靠;同时也表明了这些基因高度响应了菌核的发育过程。 相似文献
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自然环境条件下,不同光照强度会使姜荷花不同生理指标发生显著变化,试验选择“红火炬”“蓝莲雪”“紫仙子”“白雪公主”“清迈粉”和“黎明”6种姜黄属不同姜荷花品种植物作为试验材料,采用遮阳网遮光处理方法,研究了不同光照强度对6种姜荷花植物光合特性的影响,通过对可溶性糖含量、叶绿素、生物量等测定,研究其在不同光照强度处理下生长状况及形态观赏特性。得出各品种在不同光照条件下生长的相关数据,结合实际养护观测经验,得出姜荷花适应的大致光照范围。通过对生理指标变化的分析,找出适宜姜荷花生长的光照强度。为分析贵州光照条件是否适宜种植姜荷花提供参考和借鉴。结果表明：随着光照强度的降低,姜荷花叶片可溶性糖含量合成减弱,含量下降,但温度的升高也会影响其可溶性糖含量的合成;“红火炬”“蓝莲雪”“紫仙子”“白雪公主”4个姜荷花品种种植培育时进行适当遮荫可提高叶片叶绿素的合成,但不宜过度遮荫,“清迈粉”和“黎明”的FL处理叶绿素含量最高,说明这2个品种在全日照环境下栽植时叶绿素合成效果最好,“红火炬”栽植培育时可通过提高光照强度扩大叶面积、控制花柄叶柄不徒长等提升“红火炬”的观赏品质;通过对不同光照处理的6种姜荷... 相似文献
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为揭示西藏巴松错浮游植物群落结构的水平和垂直分布特征及其与环境间的关系，于2020年7月对巴松错出入河流及其湖体15个采样点和湖中心B15采样点11个分层的浮游植物进行了调查，同时测定了水体相关理化指标。调查共采集水样275个，分析了浮游植物物种组成、细胞丰度、生物量和物种多样性等群落结构特征，并探讨浮游植物对水平和垂直环境梯度变化的响应。结果表明：（1）巴松错夏季共鉴定浮游植物167种，隶属于5门8纲20目29科66属，物种组成为硅藻-绿藻-蓝藻型；（2）在水平方向上，平均细胞丰度为1.8453×104 cells/L，平均生物量为0.0117 mg/L；在垂直方向上，平均细胞丰度为1.0055×104 cells/L，平均生物量为0.0061 mg/L；（3）巴松错夏季浮游植物群落结构水平分布较为均匀，群落复杂程度相对较高，较垂直分布更稳定；（4）RDA分析结果表明，EC是影响巴松错夏季浮游植物水平群落变异的主要环境因子，TUR是影响垂直变异的主要环境因子。本研究结果为进一步研究高寒湖泊生态系统提供了基础资料。 相似文献
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