基于转录组信息的黑果枸杞MYB转录因子家族分析   总被引：4，自引：2，他引：2  

严莉  王翠平  陈建伟  乔改霞  李健 《中国农业科学》2017,50(20):3991-4002

【目的】MYB基因家族是植物中最大的一类转录因子家族,广泛参与植物的生长发育和代谢调控过程。目前仍没有针对枸杞等木本作物MYB转录因子家族的系统分析。基于转录组数据鉴定分析黑果枸杞MYB基因家族,可为该类基因生物学功能和代谢调控机制的研究提供参考。【方法】基于黑果枸杞转录组测序(RNA-Seq)数据,利用NR、NT、Swiss-Prot和PFAM 4个数据库和NCBI网站,对黑果枸杞MYB基因进行筛选注释;利用Web Logo3、Prot Comp 9.0、MEGA5.0软件进行保守结构域、亚细胞定位和系统进化等生物信息学分析。基于转录组数据分析MYB基因在黑果枸杞果实不同发育期的差异表达模式,并采用荧光定量PCR方法进行验证。【结果】基于转录组测序数据,注释得到83个黑果枸杞MYB类转录因子基因,根据结构特性将其分为4大类:R2R3-MYB、1R-MYB、3R-MYB和4R-MYB。结构域分析表明:R2R3-MYB类转录因子的R2 MYB基序中包含3个极度保守的色氨酸残基,R3 MYB基序中的第一个色氨酸残基被疏水氨基酸替代。比较分析黑果枸杞MYB家族和拟南芥MYB家族共同构建的进化树发现,黑果枸杞的MYB家族在进化上包括3个大类,6个亚类。亚细胞定位预测结果显示,44个MYB转录因子定位于细胞质中,37个定位于细胞核中。基于转录组数据的MYB差异表达模式分析表明,黑果枸杞MYB基因可能参与了果实不同发育时期花青素变化的调控;基于荧光定量PCR的差异表达数据进一步验证了部分MYB转录因子在果实不同发育时期的花青素合成中可能起到调控作用。【结论】黑果枸杞MYB基因家族注释得到83个黑果枸杞MYB类转录因子基因,为进一步研究MYB家族的基因结构和生物学功能奠定了基础。  相似文献   

推行“四跟四走”新模式 抓好产业拔穷根     

陈建伟  段骁 《湖南农业》2018,(1)

正产业是强县之本、致富之源、脱贫之基。炎陵县积极推行"四跟四走"模式,紧紧抓住产业扶贫这个根本,通过建基地、强龙头、抓联结、树品牌,形成产业优势,辐射千家万户。立足资源优势合理规划布局炎陵县立足生态资源优势,合理布局,制定了《炎陵县特色农业"一带八基地"发展规划》,即乡村旅游风光带和特色水果、高山茶叶、笋竹林、油茶、炎陵白鹅、高山蔬菜、花卉苗木、中药材8个  相似文献   

不同种植密度与施肥水平对玉米产量的影响分析     

邹辉  陈建伟 《农民致富之友》2018,(2)

正伊犁河谷玉米的种植面积较大,2017年河谷面积面积达到250万亩以上,玉米也是当地重要的农作物之一。影响玉米实际生长情况的因素有很多,尤其玉米对生长环境有较高要求,要实现玉米高产,需要对玉米生长的相关因素进行全面分析。玉米产量高低和种植密度与施肥水平存在直接影响,本文通过试验的方式,设计不同种植密度和不同施肥水平,对不同试验区的玉米产量进行科学分析,确定出获得最大玉米产量的最合适种植密度和施肥水平。  相似文献   

野生和栽培明党参的RAPD分析     

于光  马宇翔  席蓓莉  陈建伟 《江苏农业科学》2009,(2)

通过RAPD分子标记方法,从DNA水平上分析野生型明党参和栽培得到的明党参植株之间的遗传变异。通过设立MgCl2、dNTP、模板浓度梯度优化了RAPD反应条件;筛选了60个随机引物,其中有37个随机引物能够扩增出条带,从中选取5个多态性强、重复性好的引物进行扩增,试验共检测到23个位点,10个多态性位点,多态位点比率为43．5％。研究结果表明RAPD分子标记方法可以鉴定野生和栽培明党参。  相似文献   

白灵菇多糖及总氮含量的测定   总被引：6，自引：0，他引：6  

许金国  郑泉  刘俊  江曙  陈建伟 《食用菌》2003,25(5):8-9

应用721分光光度计，凯氏定氮仪对干燥的白灵菇中多糖及总氮含量测定，结果表明其含量较高，开发价值较大。  相似文献   

我国西部地区生物多样性热点地区的评定与划分   总被引：4，自引：0，他引：4  

刘广超  陈建伟 《西部林业科学》2004,33(3):18-25

生物多样性热点地区的评定与划分是西部地区自然保护区建设的一项基础工作。经研究,依据一定的区划原则,把我国的西部地区划分为35个景观区域,然后采用"综合指数法"对划分出的各景观区域作生物多样性热点地区的等级评价,进而确定出西部地区的10个一级生物多样性热点地区的景观区域,为西部地区自然保护区的规划和建立提供了依据。  相似文献   

中国森林,美丽而多样     

陈建伟 《森林与人类》2015,(2):38-45

<正>从大兴安岭的茫茫林海到雅鲁藏布大峡谷的森林,从阿尔泰山的泰加林到西沙红脚鲣鸟栖息树,几十年自然保护的工作经历让我看到了中国各处美丽多样的森林。加上工作和爱好的原因,我也到过当今世界五大洲的不少森林分布地。这些经历都激发了我对中国森林的热爱,中国森林的多样性和美丽景观在世界诸国中是独一无二的。  相似文献   

黄芪对大鼠睾丸间质细胞凋亡相关基因表达的影响     

曹霞  陈建伟  姜晓龙  赵妙妙  姚晓磊  黄洋  吕丽华 《黑龙江动物繁殖》2015,23(1):3-5,24

为探讨黄芪对大鼠睾丸间质细胞凋亡的影响,本试验通过向大鼠睾丸间质细胞的体外培养体系中添加终浓度为20μg/m L的黄芪提取液,利用荧光定量PCR技术研究黄芪对大鼠睾丸间质细胞凋亡相关基因Bax、Bcl-2表达量的影响。结果:添加终浓度为20μg/m L黄芪提取液的实验组与不添加黄芪提取液的对照组相比,间质细胞内Bax基因表达量显著降低(P0.01),Bcl-2基因表达量无显著差异,Bax/Bcl-2比值显著下降(P0.05)。结论:黄芪在一定程度上能够通过抑制凋亡基因Bax的转录,抑制大鼠睾丸间质细胞凋亡。  相似文献   

PCR一步法检测水稻蜡质基因第一内含子剪接供体+1位碱基     

毛兴学  肖昕  陈建伟  罗文永  刘彦卓  李晓方 《中国水稻科学》2005,19(3):285-287

 报道了一种利用PCR快速检测水稻蜡质基因第一内含子剪接供体+1位碱基的方法，并用这种方法分析了一批广东籼稻材料。结果显示，该方法简便易行，结果可靠，可广泛用于育种筛选中的直链淀粉含量选择。  相似文献   

蛋鸡卵巢PRSS23基因CDS序列分析     

孟金柱  李鹏飞  姜小龙  陈建伟  刘岩  黄洋  吕丽华 《广西农业生物科学》2014,(1):77-81

为获得蛋鸡丝氨酸蛋白酶23（PRSS23）的CDS序列并分析其结构域,试验根据NCBI中公布的其它物种PRSS23的mRNA序列,设计了特异性引物,采用RT-PCR技术扩增PRSS23 CDS全序列。BLAST比对发现,与其它物种PRSS23预测序列以及氨基酸序列同源性分别为99%、92%、91%、86%和100%、96%、96%、90%;通过分析该序列的三级结构,发现在第117到362位氨基酸之间含有一个典型的Tyrp-SPc结构域,该结构域具有典型丝氨酸肽链内切酶活性;通过对其蛋白信号肽预测分析,发现序列中含有信号肽,信号锚定的可能性为72.8%。  相似文献