基于16S rRNA序列探讨我国海鳝科鱼类分子系统进化关系     

陈铭  范蔓桦  谢瑞琳  陈玉佩  李清清  李江涛  黄燕华  林蠡  梁日深 《水产学报》2022,46(2):183-195

为从分子水平分析海鳝科鱼类分子系统分类关系,澄清物种分类争议,实验通过PCR扩增获得我国海鳝科9个属26种鱼类16S r RNA序列片段,结合GenBank下载的其他海鳝科鱼类的序列进行分析。结果显示,进化树上,海鳝科主要形成裸海鳝亚科与海鳝亚科两个分支,裸海鳝亚科包括尾鳝属与鞭尾鳝属,海鳝亚科包括裸胸鳝属、裸海鳝属、勾吻鳝属、蛇鳝属等8个属,与形态分类结果一致。裸海鳝亚科分支中,尾鳝属与鞭尾鳝属形成平行的姐妹分支;海鳝亚科分支中,斑马裸海鳝单独形成一支,位于该分支基部,其他种类聚为另一支。分支I中裸胸鳝属、勾吻鳝属、蛇鳝属、海鳝属等属均无法形成单系,揭示这些种属可能是多系起源,与近期的分子水平研究观点相似。研究结果支持将斑马裸海鳝归为裸海鳝属,为单型属物种;虎斑鞭尾鳝归为鞭尾鳝属,与尾鳝属平行进化;拟蛇鳝从长海鳝属分离出来,归为拟蛇鳝属等分类观点。豹纹勾吻鳝与海鳝属关系十分接近,但其形态上还具有多个勾吻鳝属的基本特征,至于是否归为海鳝属,还需后续更多的分子与形态学研究加以验证。  相似文献   

中国对虾皮下及造血组织坏死杆状病毒（HHNBV）DNA探针的制备及应用   总被引：5，自引：2，他引：5  

刘萍  张岩 《海洋水产研究》1995,16(1):59-62

ＨＨＮＢＶ是１９９３年中国对虾暴发性流行病的主要病原之一。从纯化的病毒中提取ＤＮＡ，用ＥｃｏＲｌ限制性内切酶酶切成ＤＮＡ片段，与ＰＵＣ１８体外重组，建立ＨＨＮＢＶＤＮＡ文库。从中筛选出三个重组质粒（５＃、８＃、９＃），它们所插入的片段大小分别为：２．８Ｋｂ、０．８Ｋｂ、１．６Ｋｂ，它们分别用光敏生物素标记成探针，与感染ＨＨＮＢＶ的病虾ＤＮＡ呈阳性反应，以此利用制备的ＨＨＮＢＶＤＮＡ探针的高敏感性和特异性来检测虾病。  相似文献   

鳙小卫星DNA的克隆   总被引：4，自引：2，他引：4  

简纪常  夏德全 《中国水产科学》1999,6(4):18-20

鳙基因组ＤＮＡ 经内切酶Ｓａｕ３ＡⅠ完全酶切后,与Ｂａｍ ＨⅠ－ ｐＵＣ１８ 质粒连接,转化ＤＨ５α后,获得９３３ 个重组体。用人源小卫星探针３３ ．１５ 对重组体进行原位杂交筛选,获得１４ 个阳性克隆,取其中的１ 个阳性克隆（ 即小卫星ｐＢＣ１７４） 作探针,与５ 尾鳙和４ 尾鲢基因组ＤＮＡ 杂交,能产生具有高度变异性的、个体特异性的ＤＮＡ 指纹图,表明克隆的鳙小卫星ｐＢＣ１７４ 可用于鱼类ＤＮＡ 指纹分析。  相似文献   

龙池鲫DNA含量、倍性分析及其形态学特征研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

徐钢春  殷文健  顾若波  周国勤  茆健强 《淡水渔业》2015,(3):9-13

以鸡(Gallus sp.)红细胞DNA含量(2.5 pg/N)为标准对照,利用流式细胞术测定了龙池鲫(Carassius auratus in Long Lake)的红细胞核DNA含量,采用T型标技术标记了2倍体与3倍体龙池鲫并研究了2倍体与3倍体龙池鲫的形态特征,为阐明龙池鲫的遗传背景及资源增殖保护提供科学依据。结果显示,实验检测的265尾龙池鲫中,42尾龙池鲫样品红细胞核的相对DNA含量接近76,占15.85%,223尾样品接近110,占群体数的84.15%;二倍体龙池鲫的DNA含量为3.83 pg/N,三倍体龙池鲫的DNA含量为5.38 pg/N。龙池鲫是由二倍体和三倍体两种类型的鱼组成的混合群体;侧线鳞数量可作为二倍体龙池鲫与三倍体龙池鲫的辨别参考指标。T型标暂养1周后龙池鲫的成活率达到100%,脱牌率为1.13%。  相似文献   

鲍活体倍性检测技术的研究     

林美金 《福建水产》2012,34(3):225-230

在生物有机体中,一个细胞核中所含的DNA总量对于某种类有机体是一定的。利用流式细胞仪(FCM)测量细胞中的DNA含量,可以用来鉴别有机体的倍性。本研究分别取杂交鲍[即皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)×盘鲍(Haliotis.discus discus)]的一小块触手、足肌,设计不同的振荡时间、不同的DAPI染色时间、不同的取样部位,制备成不同的细胞悬液检查样品;用PA-Ⅱ型倍体分析仪测定其倍性,以探讨其对倍性检测效果的影响。试验结果表明:振荡的最适时间为1.5～2.0 min,染色的最适时间为4.0～5.0 min;取材部位的不同对检测结果无显著影响。  相似文献   

基于线粒体细胞色素b基因片段序列变异探讨3种鲳属鱼类系统进化   总被引：4，自引：1，他引：4       下载免费PDF全文

马春艳  赵峰  孟彦羽  施兆鸿  庄平  赵云龙 《渔业科学进展》2009,30(5):20-26

对鲳属3种鱼类共19个个体的细胞色素b（Cytb）基因进行PCR扩增,经比对校正得到1123bp的基因片段,共检测到141个变异位点,总变异为12.56%,5个简约信息位点,未出现插入和（或）缺失,序列中转换（Transition）明显多于颠换（Transversion）。鲳属3种鱼类19个序列共检测到11种单倍型,其T、C、A和G平均含量分别为29.1%、30.5%、27.4%和13.0%。（A＋T）%为56.5%,大于（G＋C）43.5%。结合来自GenBank中的鲳科的中间低鳍鲳Peprilus medius和星斑真鲳Stromateus stellatus的相应同源序列,并以长鲳科的刺鲳Psenopsis anomala作为外群,构建系统进化树。结果显示,翎鲳和中国鲳亲缘关系较近,二者与银鲳亲缘关系较远,同为鲳科的鱼类聚类后再与作为外群的刺鲳相聚。系统进化树显示,银鲳为3种鲳属鱼类中较早分化出的种,刺鲳位于进化树的基部,是较鲳属鱼类更为原始的类群,与形态分析结果一致。  相似文献   

野生和“黄海1号”中国明对虾不同组织基因组DNA的MSAP分析   总被引：2，自引：2，他引：2  

杜盈  何玉英  李健  刘磊  孙铭  王清印 《中国水产科学》2013,20(3):536-543

为了从表观遗传学角度讨论中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体和人工选育新品种“黄海1号”不同组织间甲基化水平和多态性差异,应用甲基化敏感扩增多态性(mehylation sensitive amplified polymorphism, MSAP)分别对野生群体组中国明对虾和“黄海1号”肌肉、鳃、血液3种组织样品基因组DNA的CCGG甲基化水平进行对比分析,试图从表观遗传学角度探讨影响中国明对虾生长性状的分子机制.采用30对引物进行选择性扩增,经聚丙烯酰胺凝胶电泳(Polyacrylamide Gel Electrophoresis, PAGE)带型结果显示,野生群体组中国明对虾肌肉、鳃和血液的甲基化比例分别为23.1%,22.3%和19.7%;而“黄海1号”肌肉、鳃和血液的甲基化比例分别为21.4%、19.6%和18.9%.野生群体组中国明对虾和“黄海1号”同一组织间的甲基化水平和甲基化多态性水平不同,肌肉、鳃和血液不同组织间的甲基化水平和甲基化多态性水平亦不同.DNA 甲基化多态性带型分析显示,鳃组织的甲基化水平和多态性水平在野生群体组中国明对虾和“黄海1号”间变化趋势最大,肌肉最稳定.本研究旨为甲基化修饰与中国明对虾生长性状间的相关性研究提供依据.  相似文献   

Evolutionary implications of two rainbow trout growth hormone genes     

T. T. Chen  L. B. Agellon  C. M. Lin  H. J. Tsai  Peijun Zhang  L. I. González-Villasénor  D. A. Powers 《Fish physiology and biochemistry》1989,7(1-6):381-385

The primary structures of two rainbow trout growth hormone mRNAs (GH1 and GH2) have been deduced by direct sequencing of their respective cDNA clones and portions of the mRNA. Both GH1 and GH2 mRNA contain open reading frames comprised of 630 nucleotides and encode 210 amino acid residues of which 11 are variant. The translated regions of both mRNA are flanked by a short but rather conserved 5′-end, and a relatively long but highly diverged 3′-end. The differences at translated and 3′-untranslated regions suggest that the GH1 and GH2 mRNA originate from different loci. The GH1 and GH2 mRNA are likely transcribed from two distinct loci which were duplicated during tetraploidization of salmonid genome between 50 to 100 million years ago. The GH2 gene has been isolated and sequenced from a rainbow trout genomic library. This gene spans a region of approximately 4 kilobases. The trout GH gene is comprised of 6 exons and 5 introns, in contrast to 5 exons and 4 introns in mammals. The additional intron in the trout gene interrupts the translated regions that are analogous to the last exon of the mammalian counterpart. The alleged internally repeating sequences in mammalian GH, prolactin (Pr1) and placental lactogen (PL) are not observed in the predicted polypeptide sequence of trout GH. In addition, direct repeats that flank exons I, III and V of mammalian GH, Pr1 and PL genes are absent in trout gene. These findings indicate that the rainbow trout GH gene structure does not support the current hypothesis that internally repeated regions in GH, Pr1 and PL arose from a small primordial gene.  相似文献   

锦鲤尾鳍细胞系(KF-H)的建立     

薛淑群  孙中武  孙效文 《水产学杂志》2012,25(4):16-18,23

本研究建立了锦鲤(Cyprinus carpio)尾鳍细胞系。染色体数目、核型及DNA含量等实验,发现锦鲤体细胞和锦鲤培养细胞无显著性差异,染色体数目和DNA含量符合比例关系,建立的锦鲤尾鳍细胞系已形成了稳定的遗传性状,命名为KF-H。  相似文献   

池塘养殖尾水经稻田生态工程净化后的浮游细菌群落特征     

陶玲  李晓丽  朱建强  李谷 《淡水渔业》2017,47(1):71-77

为利用稻田生态工程对精养池塘尾水进行循环利用,采用Illumina Mi Seq第二代测序技术比较分析了稻田生态工程进出水中浮游细菌群落结构和多样性差异,以探讨稻田生态工程净化回用水中浮游细菌群落变化对池塘养殖的影响。结果显示,稻田生态工程进出水中优势浮游细菌在门水平上的组成相同,均为蓝细菌门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)。但优势门类的相对丰度发生变化,蓝细菌门的相对丰度由进水中的46.72%显著降低至表面流出水中的41.82%和渗流出水中的34.77%;而放线菌门的相对丰度由3.90%增加至表面流出水中的5.65%和渗流出水中的6.45%。属水平上优势浮游细菌组成也相同,但微囊藻属(Microcystis)的相对丰度由0.83%显著降低至渗流出水中的0.46%(P0.05)。另外,稻田生态工程表面流出水中浮游细菌物种丰富度指数(Chao 1)显著提高,渗流出水中Shannon多样性指数显著提高,且Simpson指数显著降低(P0.05)。  相似文献