基因组水平的选择信号及其检测方法研究进展          下载免费PDF全文

王宇占  赵毅强 《家畜生态学报》2019,40(5):1-6

在进化过程中,自然或人工选择在基因组上留下了各种选择信号的印迹。探究不同物种或同一物种不同种群之间的选择信号有助于我们研究物种的进化历史,筛选优势等位基因并应用于遗传育种之中。本文详细介绍了各种经典的选择信号检测方法及其适用场景,并讨论了各自的优缺点和未来的发展方向。  相似文献   

等位基因特异性表达形成机制及其应用的研究进展     

戴豪杨  白雪  王建蒙  柴圆  付绍印  刘永斌  张文广 《畜牧与饲料科学》2019,40(6):37-40

基因作为遗传信息的介质,决定了生物的性状表现。基因序列变异的发生是生物体适应环境变化的必然趋势。在二倍体生物中等位基因是一对控制着相对性状的基因,因此,等位基因特异性表达效应根据细胞类型和发育阶段的不同而变化,表现出不同个体之间的差异。等位基因差异表达对基因的表达起到重要的调控作用,并最终可能与生物的表型多态性联系起来。等位基因特异性表达分析已经在动物研究中得到广泛应用,有助于提高鉴定调控遗传变异的能力。对等位基因特异性表达的形成机制及其应用研究进展进行了综述,以期为进一步揭示等位基因特异性表达的遗传学机制,以及加快其在动物生产中的应用提供理论依据。  相似文献   

HSL基因的研究进展     

HSL基因的研究进展 《畜牧与饲料科学》2019,40(12):51-53

激素敏感性脂肪酶(hormone-sensitive triglyceride lipase,HSL)是脂肪分解的限速酶,其编码基因HSL的表达也与脂肪的沉积密切相关。从分子结构、表达调控及多态性等方面对HSL基因的研究进展进行了综述,以期为进一步研究该基因的结构及功能提供参考。  相似文献   

猪SLA基因多态性研究进展     

韦思婷  程一飞  舒星富  韦体  梁丽彬  刘丽霞 《猪业科学》2019,36(4):102-103

猪的MHC也叫猪的白细胞抗原(SLA),不仅在抗原递呈、机体器官移植、免疫应答与调控方面有重要的作用,而且还与其他的生物学功能如抗病力、生长、繁殖等有关。文章主要论述猪SLA基因多态性研究进展,包括猪SLA基因结构和生物学功能、SLA-Ⅰ基因多态性研究、SLA-Ⅱ基因多态性研究,希望为今后的研究提供理论依据和参考。  相似文献   

发病季节对美国中西部猪场猪蓝耳病达到稳定状态时间的影响     

李艳青 《猪业科学》2019,36(1):34-34

猪场从猪蓝耳病(PRRS)暴发到持续性实现断奶仔猪猪蓝耳病PCR检测抗原阴性所需时间,被称为“达到稳定化时间”(TTS)。一些因素如猪群的感染状态是否一致、是否之前猪场发生过猪蓝耳病、引起暴发猪蓝耳病的限制性片段长度多态性(RFLP)等均能影响达到稳定状态所需时间。文中对美国中西部猪场猪蓝耳病发生季节对TTS的不同影响进行了分析。  相似文献   

猪FRZB、ABCF1基因多态性与生长性状的关联分析     

杨华  徐珍  陈佳  姜佳佳  毛翠  毛慧敏  左波  徐在言 《中国畜牧杂志》2018,(1)

FRZB基因通过抑制Wnt信号途径调控细胞生长,ABCF1(也称为ABC50)结合e IF2,在翻译起始中发挥着重要的作用,可作为猪生长性状相关的候选基因。本研究采用直接测序法检测FRZB基因和ABCF1基因5'非翻译区中单核苷酸多态性(SNPs)基因型分布,并分析基因型与生长性状的相关性。结果表明:在美系大白猪中,FRZB基因位点ins(A-532G)多态性与背膘厚呈极显著相关(P0.01),与体长接近显著水平(P=0.05);ABCF1基因254A/G多态性与背膘厚、左乳头数和右乳头数均呈显著相关(P0.05);在法系大白中,ABCF1基因254A/G多态性与初生重呈显著相关(P0.05)。结果表明,FRZB和ABCF1基因是潜在的影响猪生长性状的候选基因。  相似文献   

大白猪PTGS2基因外显子2多态性及其与繁殖性状的关联分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

聂光伟  李明杨  毛翠  毛慧敏  王国水  左波 《中国畜牧兽医》2018,45(1):140-146

试验旨在研究前列腺素内过氧化物合酶2（prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2）基因的单核苷酸多态性,并将其与大白猪的繁殖性状进行关联分析,为猪分子遗传标记提供依据。以美系及法系纯种大白猪基因组DNA为模板,构建DNA混合池,通过克隆测序比对,检测猪PTGS2基因的遗传变异;采用PCR-RFLP技术对多态性位点进行基因分型,并与目标性状进行关联分析。结果显示,在猪PTGS2基因外显子2上存在1个g.86A>G碱基突变,并具有Msp Ⅰ酶切位点多态性,且在大白猪群体中检测到AA、AG和GG 3种基因型;哈迪-温伯格平衡检验结果显示,在法系大白猪群体中,PTGS2基因g.86A>G多态性分布达到遗传平衡状态（P>0.05）。关联分析结果表明,在美系大白猪群体中,AA基因型初产母猪弱仔数显著少于AG基因型（P<0.05）,AA基因型经产母猪初生窝重显著高于AG基因型（P<0.05）;在法系大白猪群体中,GG基因型个体总产仔数、健仔数和初生窝重均高于AA和AG基因型,但未达到显著水平（P>0.05）。PTGS2基因外显子2 g.86A>G多态性位点显著影响初生窝重和弱仔数,可作为猪分子标记辅助选择育种的潜在位点。  相似文献   

长白猪prepro-orexin基因多态性及其与采食和生长性状的关联分析     

胡伟  李明丽  张燕林  严达伟  李中昌  董新星  计春律  兰国湘  潘玉春  鲁绍雄 《中国畜牧兽医》2018,45(3):712-720

为揭示食欲素前体（prepro-orexin）基因对长白猪采食和生长性状的影响,试验采用PCR产物直接测序法对132头长白猪prepro-orexin基因的C62T和G426A位点多态性进行检测,并对各位点与30~100 kg阶段的采食及生长性状进行关联分析。结果表明,长白猪prepro-orexin基因C62T和G426A位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态,等位基因频率表现为野生型（C、G）高于突变型（T、A）;两个位点的4种单倍型和7种单倍型组合中,CG、TA为主要单倍型,CG/CG、TA/CG和TA/TA为主要单倍型组合。C62T位点的CC基因型、G426A位点的GG基因型及CG/CG单倍型组合均可显著减少日采食次数、延长每次采食时间和提高每次采食量（P < 0.05）;其中CG/CG组合的日采食次数、每次采食时间、每次采食量分别较TA/CG组合显著减少1.22次、延长0.79 min和提高32.18 g（P < 0.05）,而与TA/TA组合的差异未达到显著水平（P > 0.05）。C62T位点的TT基因型、G426A位点的AA基因型及TA/TA单倍型组合可显著或极显著缩短达100 kg体重日龄、提高30~100 kg平均日增重（P < 0.05;P < 0.01）;TA/TA组合达100 kg体重日龄分别较CG/CG、TA/CG组合分别显著缩短6.23和6.69 d（P < 0.05）,平均日增重分别极显著提高47.91和50.04 g/d（P < 0.01）。结果表明,prepro-orexin基因C62T和G426A位点对长白猪采食和生长性状的影响具有明显的协同效应。  相似文献   

番鸭下丘脑组织的RNA-Seq特征分析     

王旭平  杨胜林  柳诚刚  陆曼  杨汝才  谭斌  周美迪  王达娜  李潇蒙 《中国畜牧兽医》2018,45(3):604-611

为筛选番鸭下丘脑组织中的基因组信息,本研究以NCBI数据库中已标注的绿头鸭基因组（登录号：BGI_duck_1.0）为参照,利用RNA-Seq技术对番鸭下丘脑组织基因表达水平,以及可变剪切事件、SNPs及InDel进行筛选。结果显示,共鉴定出14 619个基因表达（FPKM ≥ 1）,占筛选出总基因数的72.7%。共有5 034个基因发生了7 528次可变剪切,其中外显子跳跃占92.76%,第一个外显子可变剪切和内含子滞留所占比例最小,共占总数的0.027%。通过RNA-Seq技术,本研究还筛选到646 423个SNP位点和77 712个InDel位点。对SNPs和InDel所在的基因进行功能注释发现,这些基因主要参与分子功能、生物过程和细胞组成过程。通过KEGG通路分析发现,出现SNPs和InDel所在基因主要富集在内分泌调节和神经行为调节的相关通路上,表明下丘脑既可参与内分泌调节,又参与动物的神经行为调节。本研究筛选出的数据不仅丰富了番鸭的遗传信息,而且也建立了番鸭相关基因的SNPs和InDel的数据库,这为番鸭的遗传育种工作及相关功能基因的具体定位提供了可靠依据,同时也为以后番鸭行为的研究提供了一定的参考价值。  相似文献   

绵羊抗菌肽GNLY基因多态性分析及合成多肽的生物学功能研究     

宋佳玮  杨霞  肖盛中  李岩  蔡卓轩  周子恒  盛金良  剡根强 《中国畜牧兽医》2018,45(5):1319-1330

试验旨在分析绵羊抗菌肽颗粒溶素（granulysin,GNLY）基因多态性,检测合成多肽的抑菌活性和抑制肿瘤细胞活性,明确绵羊抗菌肽GNLY的生物学功能。通过对GNLY基因RT-PCR产物进行测序,分析GNLY基因多态性,推导其氨基酸序列信息合成功能区多肽,利用径向扩散试验和MIC试验检测合成多肽对大肠杆菌、沙门氏菌、葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的抑制作用;利用MTT试验观察合成多肽对人食管癌细胞（EC109）、人肾癌细胞（X786-0）的抑制作用。结果发现,MIC试验中浓度>250 μg/mL的G16对大肠杆菌、葡萄球菌均有抑制作用;浓度 ≥ 7.82 μg/mL的GS16对大肠杆菌抑制作用明显,对沙门氏菌、葡萄球菌和金黄色葡萄球菌无明显抑制作用;62.5 μg/mL GC16对大肠杆菌、沙门氏菌和金黄色葡萄球菌均有抑制作用,其中对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌抑制作用较为明显;G22对4种细菌均无明显的抑制作用。MTT试验结果表明,合成多肽G16、GS16对癌细胞无抑制作用,G22和GC16对EC109、X786-0具有显著抑制作用,其中1 mg/mL G22和1 mg/mL GC16对EC109生长抑制率分别为88.21%和57.21%,对X786-0生长抑制率分别为96.37%和81.87%。研究显示,合成GNLY多肽对细菌和肿瘤细胞具有一定的抑制活性,本研究结果为绵羊抗菌肽作为候选抗菌药物的开发奠定了基础。  相似文献