杜洛克与二花脸杂交猪群体SNP偏分离分析     

陈佐权  饶琳  谢磊  姚天雄  张志燕 《畜牧兽医学报》2021,52(9):2384-2393

偏分离（TRD）是生物中普遍存在的现象,本研究拟在高密度基因芯片判断基因型的大规模群体中挖掘猪基因组标记位点的偏分离位点并探究其潜在的遗传机制。本研究用60K Illumina Porcine SNP芯片对1 020头F2资源家系（杜洛克与二花脸杂交F0-F2群体）进行基因型分型,用偏分离分析软件TRDscan （BF>100）和TDT （P<0.01）方法在单个位点上检测偏分离信号,并对二者共有的显著信号位点附近100 kb窗口的基因进行功能分析。此外,本研究还利用单倍型分型的软件包PHASEBOOK采用多位点连锁分析的策略分析了父源和母源配子中的偏分离区域,并在该区域内搜寻潜在的QTLs。结果表明：1）在单位点的偏分离分析中共鉴定到44个显著的偏分离位点,筛选到23个相关基因;对父本和母本特异性偏分离效应进行分析时,分别鉴定到27和35个显著偏分离位点,其中,分别有11和25个位点的100 kb附近有已注释的功能基因。2）基于单倍型多位点连锁的偏分离结果显示,父本显著偏分离位点位于5和13号染色体上,在该偏分离区域内搜寻功能相关的QTL,共搜寻到3个与繁殖性状（木乃伊数、产活仔数、黄体数）有关的QTLs;分析母本偏分离位点时,在4、6和12号染色体上定位到显著偏分离区域,结合已知的猪QTL数据库,共找到了5个与繁殖性状相关的QTLs。本研究利用大规模猪家系数据系统地鉴别了猪基因组的偏分离位点,为解析猪中的偏分离现象和进一步探究其生物学机制提供了一定的参考作用。  相似文献   

镉胁迫下水培杞柳生理特性及镉吸收转运     

尹泽润  罗宝利  罗锋  戴凤宾  诸葛玉平  娄燕宏  王会  潘红  崔秀敏  范利荣 《草业科学》2021,38(10)

为探究镉胁迫对杞柳(Salix integra)生长生理及镉吸收转运的影响,进而明确杞柳应用于镉污染土壤修复的潜力。本研究以杞柳幼苗为试验材料,采用水培试验,研究了不同浓度镉胁迫(0、10、20、30、40 mg·L-1)下杞柳的生长、根系形态、根系和叶片抗氧化酶活性,以及杞柳对镉的吸收转运特性。结果表明,杞柳具有较强的耐镉性,吸收的镉主要集中于地上部,且以叶片含量最高,茎含量最低;转运系数随镉浓度升高而增加,但富集系数随镉浓度增加而逐渐下降;镉胁迫对杞柳根系构型具有一定的诱导作用,节点数与根尖数显著上升(P 0.05),而对根系生长的影响表现为"低促高抑",低浓度(10 mg·L-1)镉胁迫下杞柳根系总长度与地下部生物量显著上升(P 0.05),高浓度(40 mg·L-1)镉胁迫下杞柳根系生物量与根系生长指标均显著下降(P 0.05);镉胁迫诱导杞柳根系与叶片中产生的超氧阴离子活力单位与过氧化氢酶活性上升,显著抑制谷胱甘肽含量与谷胱甘肽还原酶活性(P 0.05),且抑制效果随镉浓度上升而逐渐增加。综上可知,杞柳具有较强的耐镉性和镉富集特性,且通过优化根系构型、激活抗氧化酶促系统缓解自身所受镉胁迫,具有较高的镉污染修复潜力。  相似文献   

锰胁迫下鸡眼草的富集特征及生理响应     

李欣航  肖泽华  匡雪韶  王悟敏  罗亮宇  刘文胜 《草业学报》2021,30(7):139-147

为探明植物对锰胁迫的耐受性机制,以采自重金属污染区与非污染区的鸡眼草为试验材料,在不同锰浓度胁迫下［0 （对照）、1000、5000、10000、15000、20000 μmol·L^-1］ 开展盆栽试验,比较研究锰胁迫对两种来源鸡眼草表型、生理生化特性及锰积累特征的影响。结果表明：随着锰浓度的升高,1） 两种来源鸡眼草的根干重、芽干重、根冠比均呈降低的趋势;当锰浓度达5000~20000 μmol·L^-1时,与对照相比,污染区、非污染区鸡眼草的芽干重分别下降4.34%~27.71%与16.33%~49.77%,根干重分别下降19.00%~66.06%与27.90%~77.54%,污染区下降幅度均较非污染区的小;2） 两种来源鸡眼草的叶绿素、可溶性糖、脯氨酸含量及超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化物酶（POD）活性均呈先升后降的趋势,可溶性蛋白含量逐渐下降,丙二醛（MDA）含量则逐渐升高;3） 两种来源鸡眼草根、茎、叶的锰含量均增加;锰浓度为20000 μmol·L^-1时,污染区和非污染区鸡眼草的叶锰含量分别为对照的16.53和13.41倍。因此,污染区鸡眼草锰耐受能力及富集能力均较非污染区鸡眼草高,较高的抗氧化酶活性是其耐受高锰胁迫的重要生理机制。  相似文献   

镉在青菜中的富集及对其生理的影响     

梁巧玲  杨晖 《北方园艺》2016,(9):6-10

以3个品种的青菜(Brassica chinensis var.chinensis)"秋田上海青"、"油冬青菜"、"黑叶矮脚油冬"为试材,研究不同浓度镉(Cd)处理对青菜种子发芽以及水培条件下青菜生物量、生理和Cd富集能力的影响。结果表明:Cd对青菜种子发芽的影响呈现低促高抑现象,在Cd浓度为5.0mg/L时,3个品种发芽率达到最高值,分别为91.30%、90.00%和89.30%;在Cd浓度超过20.0mg/L时"秋田上海青"、"油冬青菜"发芽率显著降低(P0.05)。在Cd浓度超过50.0mg/L时,"黑叶矮脚油冬"发芽率显著降低(P0.05)。青菜生物量在Cd浓度超过1.0mg/L时受到显著抑制(P0.05)。Cd对青菜生理生化有胁迫作用,不同品种青菜的叶绿素和可溶性糖含量均随Cd浓度的增加而降低,"黑叶矮脚油冬"在Cd浓度超过1.0mg/L时显著降低(P0.05)。不同品种青菜Cd富集量均随着Cd浓度的增加而升高,但3个品种富集能力差异显著,"秋田上海青"Cd富集能力显著低于其它2个品种。  相似文献   

永登七山羊全基因组选择信号检测分析     

栗登攀  马克岩  韩金涛  白雅琴  李讨讨  马友记 《畜牧兽医学报》2023,(11):4577-4588

旨在检测永登七山羊群体基因组选择信号,挖掘永登七山羊有价值的种质特性基因。本研究以4个绵羊群体(永登七山羊、岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊)共40个个体为研究对象,利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)技术检测全基因组范围内的单核苷酸多态性位点(SNPs)。基于SNPs数据集,通过elgensoft软件进行主成分分析;运用Treemix软件分析基因流事件;利用群体遗传分化指数(Fst)和核苷酸多样性比值(πratio)进行全基因组选择性清除分析,取top 5%Fst和πratio的交集以确定基因组受选择区域,并对候选基因进行GO和KEGG富集分析。结果共得到1 658 596个群体SNPs;主成分分析(PCA)发现永登七山羊能够独立分群,基因流表明永登七山羊和兰州大尾羊存在较弱的基因交流。以永登七山羊为试验群体,岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊为参考群体进行选择清除分析,3个比较组的受选择区域分别检测出424、294、301个候选基因;GO和KEGG分析结果表明,候选基因分别显著富集在65、79、...  相似文献   

临沂市主要绿化树种对大气重金属富集效应的初步研究     

隋超英  孙亚旭  李舒月  杨月莹  时婷婷  陈永亮 《山东林业科技》2022,(4):81-84

对临沂市不同程度污染区域（重度污染区、中度污染区和清洁区）及不同季节（春季、秋季）主要绿化树种叶片中镉（Cd）和铅（Pb）的含量进行了测定与分析。结果表明：黑松（Pinus thunbergii）、雪松（Cedrus deodara）和白皮松（Pinus bungeana）等树种对镉的富集效应较强,女贞（Ligustrum quihoui）、毛白杨（Populus tomentosa）和银杏（Ginkgo biloba）等树对铅的富集效应较强;同一绿化树种叶片中的镉和铅含量,均表现为重度污染区>中度污染区>清洁区,且差异显著（p<0.05）;就同一树种叶片中镉、铅含量的季节变化而言,其规律明显表现为春季较低,秋季较高。  相似文献   

香蕉对砷镉铅的富集转运特征及土壤重金属安全阈值     

潘攀  刘贝贝  吴琳  符旖晴  武春媛  李勤奋  范成五 《热带作物学报》2021,42(1):267-274

建立土壤重金属安全阈值是保障我国农产品质量安全的一道重要屏障.本研究通过盆栽模拟实验研究香蕉对砷(As)、镉(Cd)、铅(Pb)3种重金属的富集转运特点,进一步通过建立香蕉茎叶与土壤As、Cd、Pb总量和有效态含量的关系,推导香蕉种植系统的土壤As、Cd、Pb的安全阈值.结果显示,Cd、Pb对香蕉生物量表现出"低促高抑...  相似文献   

植物修复与超富集植物   总被引：6，自引：0，他引：6  

代全林 《亚热带农业研究》2007,3(1):51-56

本文回顾了我国尤其是珠三角地区重金属污染现状,总结了植物修复、超富集植物及当前研究热点问题。  相似文献   

不同根际促生菌对亚麻镉砷富集及植株生长的影响     

王元昌  李洁  王玉富  赵信林  邱财生  龙松华  郭媛 《中国麻业》2021,(4):198-204

为研究植物根际促生菌(plant growth promoting rhizobacteria,PGPR)对亚麻(Linum us-itatissimum.L)植株富集和转移重金属污染农田中Cd、As元素效率的影响,取湖南省浏阳市永和镇矿山周围农田土壤进行盆栽试验,研究4种根际促生菌处理下亚麻株高、根长、茎粗和干茎、根...  相似文献   

江西省葛种植区中重金属镉调查及其富集特征     

林小兵  周利军  何绍浪  王斌强  黄欠如  武琳 《土壤与作物》2021,(3):344-354

为探明葛种植区域土壤和植株中重金属镉含量,对江西省18个葛种植区进行野外调查和室内分析,揭示葛对镉的富集特征及转运规律,为研究葛安全质量控制技术提供理论依据.结果表明:调查区域土壤有效态镉和全镉含量分别为0.002～0.21 mg·kg-1和0.05～0.25 mg·kg-1,葛根、葛头、主藤、侧枝和叶片中镉含量分别为...  相似文献