卡特兰ACC氧化酶cDNA片断的克隆与序列分析     

郑宝强  王雁  彭镇华  李晓华  齐靖  李莉 《河北农业大学学报》2008,31(6)

以卡特兰(Cattleya)花朵为试材,首先提取总RNA,并根据其它兰花的ACC氧化酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid oxidase,ACO)基因保守序列设计1对特异性引物,然后通过RT-PCR法,克隆得到一条卡特兰ACC氧化酶的cDNA片断,该片断长度为967 bp,共编码321个氨基酸残基。序列分析结果显示该克隆片断与已发表的其它兰花的ACC氧化酶基因序列同源性很高,均在85%以上,尤其与其近亲C.bicolor、C.inter-media、Laelia anceps的同源性均在95%以上。  相似文献   

Rapid Detection of Zucchini yellow mosaic virus by RT-PCR     

LIAO Fu-rong  LIN Shi-ming  CHEN Qing  CHEN Hong-yun  HUANG Peng-ying  WU Yuan 《江西农业大学学报》2008,30(6)

  相似文献   

猪NPY受体Y1 cDNA的克隆及分析     

周春宝  倪黎纲  丁家桐  包文斌 《安徽农业科学》2008,36(36)

[目的]研究猪NPY-Y1受体在猪激素分泌及发育生理功能中的调节作用。[方法]从初情期的苏姜猪母猪中提取下丘脑组织总RNA,RT-PCR扩增出NPY-Y1 cDNA,扩增产物克隆入pGEM-T easy载体中进行序列测定。[结果]试验扩增产物与GeneBank公布的猪NPY-Y1序列比较,其同源性达到100%。[结论]为下一步研究猪NPY-Y1基因的生理功能和作用机理奠定了基础。  相似文献   

禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4(H5N1)的PB1、PB2和PA基因测序及进化分析     

汪萍  SHAYILAN Gu-li  FU Zi-hua  盛卓君  BAGEDELI  LU Gui-li  成进 《山东农业大学学报(自然科学版)》2008,39(3)

通过RT-PCR技术对禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4(H5N1)的PB1、PB2和PA基因分别进行了扩增及克隆,测序结果表明该毒株的PB2、PB1和PA基因全长核苷酸序列分别为2341 bp、2282 bp和2187 bp.同源性分析表明A/Duck/XJ/4(H5N1)株与禽源、野生鸟类和猪源的禽流感毒株均有很高的同源性(86.3%～99.6%).与人源毒株相比,PB2和PA与A/HK/156/97(H5N1)株的同源性较低(86.3%～88.7%);与A/Vietnam/CL01/2004(H5N1)株和A/human/Zhejiang/16/2006(H5N1)株的同源性较高(93.0%～98.8%);PB1与人源毒株A/HK/156/97(H5N1)、A/Vietnam/CL01/2004(H5N1)、A/human/Zhejiang/16/2006(H5N1)同源性为91.1%～93.2%.  相似文献   

甘蓝型油菜ADP-核糖基化因子基因全长cDNA克隆及表达分析   总被引：2，自引：1，他引：1  

刘薇  赵云  安金玲  王茂林 《中国农业科学》2008,41(12):4008-4015

 【目的】克隆甘蓝型油菜（Brassica napus L.）矮化突变体“NDF-1”和野生型近等基因系亲本“3529”中ADP-核糖基化因子（ADP-ribosylation factor,ARF）基因全长cDNA,分析矮化突变体中该基因在不同组织中的表达水平,探讨矮化突变体中该基因在甘蓝型油菜茎杆发育过程中的作用。【方法】采用SSH（suppression subtractive hybridization）、RACE（rapid-amplification of cDNA ends）和RT-PCR技术,克隆甘蓝型油菜矮化突变体“NDF-1”和野生型“3529”中的ARF基因的全长cDNA序列。分别采集甘蓝型油菜野生型和矮化突变型苗期子叶、薹期根、茎尖和真叶,采用相对定量PCR方法检测矮化突变体中该基因的表达。【结果】获得了甘蓝型油菜矮化突变体“NDF-1”和野生型“3529”的ARF基因的全长cDNA,分别命名为BnARF和BnARF-h。序列分析表明：这两个基因长度分别为837和802 bp,都含有546 bp的完整开放阅读框（ORF）,编码181个氨基酸,与其它植物、动物和酵母的ARF基因有很高的相似性。BnARF基因在野生型和矮化突变体的根、子叶、茎尖和真叶中均有表达,其中在子叶中表达量最高,真叶中次之,根和茎尖中的表达量最少。同时BnARF在矮化突变体的根、子叶和茎尖中的表达量都显著低于野生型,但在真叶中表达量相近。【结论】克隆了甘蓝型油菜矮化突变体“NDF-1”和野生型“3529”中ADP-核糖基化因子基因的全长cDNA,这两个ARF基因的序列上有两处碱基存在差异,其中一处是错义突变,推测这一突变可能与植株矮化有关。而BnARF基因在野生型和矮化突变体的根、子叶和茎尖的表达存在显著性差异,可能参与了甘蓝型油菜的矮秆发育过程。  相似文献   

疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因ME281半定量RT-PCR分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

吕广磊  付坚  和志娇  白现广  蔺忠龙  黄兴奇  杨和生  程在全 《西南农业学报》2008,21(5)

以从疣粒野生稻受白叶枯病菌诱导所建的差减文库中筛选出的一个具有CC-NBS-LRR抗病结构域的基因(克隆号为ME281),用半定量RT-PCR法,以肌动蛋白(β-actin)基因为内参,研究疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因ME281基因mRNA的表达水平。通过对PCR体系中循环次数及Mg2 浓度的优化,最终建立了一个稳定、方便的半定量RT-PCR体系。通过ME281基因与β-actin基因PCR产物的灰度之比,确定ME281为诱导性表达,并进一步推测其为疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因,甚至为抗病基因。  相似文献   

Efficient Extraction and Application of Total RNA in Sisal     

Wang Wei  Zhou Wenzhao 《热带作物学报》2008,29(6)

  相似文献   

奥利亚罗非鱼SOX9基因cDNA全长的克隆及分析     

曹丽萍  俞菊华  殷国俊  李建林  丁炜东 《上海海洋大学学报》2008,(1):6-11

SOX9基因是重要的转录调控因子,与性别分化形成密切相关.以奥利亚罗非鱼(Oreochromis aurea)为研究材料,使用RT-PCR和RACE法分离和克隆了奥利亚罗非鱼卵巢中SOX9基因cDNA的全长序列.序列全长1 582 bp,其中5'端非翻译区长71 bp,3'端非翻译区长75 bp,开放性阅读框长1 437 bp,编码478个氨基酸.其中第98位开始共81个氨基酸为HMG保守盒.将奥利亚罗非鱼SOX9基因与虹鳟等八种动物的氨基酸序列相比较发现,它们同源性达75%左右,表明SOX9基因在进化中较保守.  相似文献   

安吉白茶正常与白化叶片基因表达差异的初步研究   总被引：4，自引：2，他引：2  

王新超  赵丽萍  姚明哲  陈亮  杨亚军 《茶叶科学》2008,28(1):50-55

用mRNA差别显示技术(DDRT-PCR)研究了茶树温敏突变体——安吉白茶正常叶片和白化叶片的基因表达差异。从58个差异表达的片段中通过半定量RT-PCR鉴定出12个阳性片段,其中5个片段在正常叶片中特异表达,4个在白化叶片中特异表达,1个在绿色叶片中上调表达,2个在白化叶片中上调表达。通过与GenBank BLASTX比对分析,5个基因片段比对出相似序列,分别为拟南芥的血红素结合蛋白家族中心区域基因、甜菜的甲硫氨酸合酶基因、苜蓿的一个逆转座子基因、人类20号染色体上的一段3-磷酸甘油醛脱氢酶假基因和玫瑰的ACC合成酶基因,其余7个片段未比对上同源序列,可能为新基因。  相似文献   

辣椒疫霉作用下叶绿素a/b结合蛋白的表达     

林明  ;贺俐  ;徐波  ;官德义  ;牟少亮  ;何水林 《甘蔗(福建)》2008,(4):297-301

从基于cDNA-AFLP分析的辣椒应答疫霉侵染的表达谱中找到1个特异表达基因的序列;利用这个序列设计引物,采用基于PCR技术的96孔文库筛选方法,从疫霉处理的辣椒cDNA文库中筛选出这个应答辣椒疫霉侵染的候选基因的全长cDNA;经生物信息学分析,推测这个长度为1022 bp的候选基因为辣椒叶绿素a/b结合蛋白（chlorophyll a/b binding protein,cab）基因;并利用荧光定量PCR法检测cab在疫霉侵染下的表达情况。  相似文献