基于家族基因分析的甘蓝MLPK互作PUB蛋白的筛选     

高启国  雷镇泽  梁云飞  姜宇鹏  朱利泉 《园艺学报》2019,46(4):714-722

MLPK(M–位点受体激酶)是芸薹属自交不亲和正向调控关键元件,其参与自交不亲和信号传导的分子机制尚不明确,同时自交不亲和下游信号元件也有待于进一步分离。为了探索分离MLPK互作蛋白的思路和方法,构建了不含核定位信号的MLPK短截蛋白(MLPK-T),并利用酵母双杂交检测到MLPK与臂重复蛋白1(ARC1)作用,通过全基因组鉴定分别获得了96个甘蓝、101个白菜、70个琴叶拟南芥和62个拟南芥PUB蛋白,其中含有臂重复序列的PUB蛋白共为127个。通过系统进化分析,筛选到8个含臂重复序列的甘蓝BoPUB蛋白,其8个基因全部在柱头内表达,且成功利用酵母双杂交检测到MLPK与3个含臂重复序列的BoPUB蛋白Bol008579、Bol016165和Bol023511相互作用。  相似文献   

巨桉生长性状、耐寒力与木材品质的遗传变异研究     

蓝贺胜 《江西农业大学学报》2006,28(5):687-692,697

对8年生巨桉种源家系试验林的调查分析表明,巨桉种源、家系间在生长性状和耐寒能力上存在极显著差异,且这些性状主要由遗传因素控制,具有较高的遗传力;巨桉主干通直度、分枝度在种源家系间不存在显著差异;树皮厚度、树皮百分率、木材密度和红心材比率在种源间均不存在显著差异,但在家系间存在显著或极显著差异,其中木材密度和红心材比率具有中等程度的遗传力。通过综合指数选择法,选出了优良速生、耐寒家系和单株,并率先选择了速生、耐寒且木材品质好的优良单株。  相似文献   

三元社会结构下贫困农村"三位一体"的综合养老模式探析     

贾淑品  段巍巍 《河北农业大学学报(农林教育版)》2006,8(3):84-88

随着经济的发展与社会的变迁,流入城市的农民工突破了传统的城乡二元结构,开创了三元社会结构,也使得农村的家庭养老模式面临着严峻的挑战。现阶段,要促进农村经济发展与社会稳定,实现整个国民经济的良性循环和可持续发展,实现全面建设小康社会的宏伟目标,就必须从农民养老保障的客观需求出发,顺应我国农村养老方式的综合化、多元化。  相似文献   

果树木屑黑木耳袋栽基质研究     

司豆豆  李德毓  彭浩  王梦姣  兰阿峰 《陕西农业科学》2024,70(4):23-27

黑木耳产业对栎木资源的依赖是该产业发展和生态文明建设不相适应的突出表现,因而选取果树替代传统栎木是促进黑木耳产业绿色生态发展的潜在途径。本文选取苹果树木屑、桃树木屑、桔树木屑和核桃树木屑为黑木耳主要栽培基质,通过菌丝生长速度、菌丝密度、菌丝色泽以及锁状联合数目等指标考核最佳果木木屑袋栽基质。结果表明,黑木耳菌丝在桃树木屑袋料基质上生长最好,生长速度（5.62 mm/d）比对照组（5.24 mm/d）提高了7.25%;菌丝生长势较好,边缘整齐、浓密、色泽洁白且锁状联合数目较多;选取78%、82%、86%和90%等4个不同桃树木屑配比,通过不同袋料基质对桃树木屑黑木耳袋栽基质进行优化研究,最佳果木黑木耳袋栽基质配方为：桃树木屑78%、米糠19%、红糖1.5%、石膏粉1%、石灰粉0.5%,此时黑木耳菌丝的生长速度(10.06 mm/d)比对照组的生长速度(5.88 mm/d)提高了71.09%,且锁状联合数目最多。本研究结果表明,桃树可替代栎木进行黑木耳袋料栽培,为黑木耳产业的绿色高质量发展奠定基础。  相似文献   

A Novel Gelatinase from Marine Flocculibacter collagenilyticus SM1988: Characterization and Potential Application in Collagen Oligopeptide-Rich Hydrolysate Preparation     

Jian Li  Jun-Hui Cheng  Zhao-Jie Teng  Xia Zhang  Xiu-Lan Chen  Mei-Ling Sun  Jing-Ping Wang  Yu-Zhong Zhang  Jun-Mei Ding  Xin-Min Tian  Xi-Ying Zhang 《Marine drugs》2022,20(1)

Although the S8 family in the MEROPS database contains many peptidases, only a few S8 peptidases have been applied in the preparation of bioactive oligopeptides. Bovine bone collagen is a good source for preparing collagen oligopeptides, but has been so far rarely applied in collagen peptide preparation. Here, we characterized a novel S8 gelatinase, Aa2_1884, from marine bacterium Flocculibacter collagenilyticus SM1988^T, and evaluated its potential application in the preparation of collagen oligopeptides from bovine bone collagen. Aa2_1884 is a multimodular S8 peptidase with a distinct domain architecture from other reported peptidases. The recombinant Aa2_1884 over-expressed in Escherichia coli showed high activity toward gelatin and denatured collagens, but no activity toward natural collagens, indicating that Aa2_1884 is a gelatinase. To evaluate the potential of Aa2_1884 in the preparation of collagen oligopeptides from bovine bone collagen, three enzymatic hydrolysis parameters, hydrolysis temperature, hydrolysis time and enzyme-substrate ratio (E/S), were optimized by single factor experiments, and the optimal hydrolysis conditions were determined to be reaction at 60 ℃ for 3 h with an E/S of 400 U/g. Under these conditions, the hydrolysis efficiency of bovine bone collagen by Aa2_1884 reached 95.3%. The resultant hydrolysate contained 97.8% peptides, in which peptides with a molecular weight lower than 1000 Da and 500 Da accounted for 55.1% and 39.5%, respectively, indicating that the hydrolysate was rich in oligopeptides. These results indicate that Aa2_1884 likely has a promising potential application in the preparation of collagen oligopeptide-rich hydrolysate from bovine bone collagen, which may provide a feasible way for the high-value utilization of bovine bone collagen.  相似文献   

杧果PEPC基因家族全基因组鉴定及表达分析     

彭文丽  刘照宇  李晓波  杨成坤 《中国果业信息》2021,50(6)

PEPC家族蛋白在植物光合碳同化过程中起到重要作用,同时具有多种非光合生物学功能,目前杧果中尚未报道。本研究对杧果MiPEPCs进行了全基因组鉴定,并分析了它们在不同组织（包括成熟叶片、成熟树皮、种子、根、花、果肉和果皮）和两个品种（高糖品种‘台农1号’和低糖品种‘热农1号’）中的表达情况。结果获得4个杧果MiPEPC基因家族成员,其理化特征较为相似,且所有MiPEPCs蛋白亚细胞定位预测均存在与细胞质中。基因组定位发现杧果MiPEPCs分布于4条不同的染色体。联合拟南芥,水稻,菠萝的PEPCs进行系统进化分析显示可分为2个亚组,MiPEPCs分布在第I（PTPC）和II亚族（BTPC）。杧果植物型MiPEPCs和细菌型MiPEPCs分离时间早于单子叶植物和双子叶植物的分离时间,两者蛋白序列差异大,但仍具有一定的保守性。顺式作用元件分析显示,MiPEPCs含有数量较多的光响应元件和激素响应元件。转录组表达分析结合qPCR实验验证发现,MiPEPCs在不同杧果组织中的表达具有偏好性,可能参与杧果的多个生物学过程（包含光合和非光合过程）,并初步推测MiPEPC1、MiPEPC3可能与杧果果实成熟过程。本研究为进一步探究MiPEPC家族在杧果中的生物学功能奠定了基础。  相似文献   

冬瓜 WRKY 基因家族鉴定及表达分析     

赵添悦  蔡金森  王敏  谢大森  杨松光  崔晓娟  高苏娟 《广东农业科学》2024,51(2):39-52

【目的】WRKY转录因子家族在植物生长发育、抵御胁迫等过程起着至关重要的作用。挖掘参与冬瓜（Benincasa hispida Cogn.）非生物胁迫的WRKY基因家族成员,探究其生物学功能。【方法】基于冬瓜基因组数据库鉴定冬瓜WRKY成员,利用生物信息学的方法系统分析其WRKY基因家族成员的蛋白理化性质、系统发育、保守基序、顺式作用元件,通过qPCR分析冬瓜WRKY的表达情况。【结果】冬瓜WRKY基因家族有57个成员,氨基酸数目在126～650之间,相对分子质量在13.92～71.68 kD之间;蛋白等电点在4.61～9.69之间。根据系统进化树将该家族分为3个类群,第二类群又分为5个亚组。冬瓜WRKY外显子有2～6个。染色体定位分析发现,有56个基因定位在12条染色体上,1个基因未定位在染色体上。保守基序分析显示,Motif 1和Motif 3存在于56个基因,且同一类群具有类似的保守基序结构。同时,冬瓜WRKY基因的启动子上均含有应激反应相关元件、激素响应元件。WRKY在冬瓜不同组织和果实发育时期特异表达。RT-PCR结果表明非生物胁迫和激素处理冬瓜可诱导部分WRKY基因的表达。...  相似文献   

春榆优良家系的苗期选择     

张雪松 《吉林林业科技》2006,35(3):1-4,10

本文对大兴安岭地区的春榆在苗期进行了优良家系的初步选择。结果表明:家系平均遗传力为0.61;从50个供试群体中选择出5个优良家系,分别是21号、40号、2号、39号、16号家系,遗传增益为17%。  相似文献   

甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析     

昝领兄  李开祥  贾永鹏  杜德志 《西北农业学报》2020,30(9):1351-1363

为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征,通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子,分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列;这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域;系统发育进化树将该家族成员聚为4大类;共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性,而且在各自染色体组内也存在串联重复事件;基因表达分析发现,大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达,并且在根中表达的基因多于叶片,受到盐胁迫处理时,大部分基因表达量会增加。初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能,为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础,为油菜抗性育种工作提供科学依据。  相似文献   

玉米XYLPs基因家族表达模式及其蛋白结构分析     

钟静  谭芬  张洪权  熊校勤  黄丽霞 《浙江农业学报》2020,32(10):1741

通过生物信息学的方法对玉米木质形成素类阿拉伯半乳糖蛋白(xylogen-like arabinogalactan proteins,XYLPs)基因家族的表达模式和蛋白结构进行了分析。ZmXYLPs基因家族成员在染色体上的分布具有一定的偏好性。基因复制事件不仅在基因家族成员数量的扩张和进化中发挥重要作用,同时还可能引起基因表达部位的扩张。根据ZmXYLPs蛋白结构特点,可将其分为两大类。其中仅ZmXYLP10/13/14蛋白存在N连接的糖修饰位点,其余ZmXYLPs蛋白均为O连接糖修饰位点。结果显示,玉米ZmXYLPs的生物学功能可能与其糖基侧链有关,并且其作用并不局限于维管组织发生过程,可能也参与生殖发育过程。  相似文献