大鲵虹彩病毒流行株的分离及其主衣壳蛋白编码基因序列比较分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

徐进  张辉  肖汉兵  曾令兵 《中国水产科学》2014,21(4):655-661

大鲵虹彩病毒(giant salamander iridovirus, GSIV)是近年中国大陆新发现的引起人工养殖大鲵(Andrias davidianus)大规模死亡的病毒病原。为了揭示大鲵虹彩病毒流行株的基因型差异, 本研究对2010–2012年采集自全国不同大鲵养殖区域的患虹彩病毒病的大鲵样本进行了分子检测、病毒分离培养以及病毒主衣壳蛋白(major capsid protein, MCP)基因测序与比对分析。结果显示, 采自陕西、湖北、湖南、浙江、江西、福建等省的10个样本检测为阳性, 通过细胞培养获得10株病毒流行株。对该10株流行株MCP基因的测序与比对分析发现, 核苷酸序列相似性达到99.7%~100%, 其推测的氨基酸序列无明显差异, 证实中国大鲵虹彩病毒流行株属同一基因型。系统进化树分析结果表明, 所选大鲵虹彩病毒与蛙病毒分别聚为一枝, 但其亲缘关系较近。本研究结果旨为大鲵虹彩病毒病的疫苗研制及其免疫防控技术研究奠定基础。

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北京禽流感死亡病例确定为禽源传染     

《饲料广角》2009,(2):16-16

国家流感中心的病毒分离实验显示．1月5日在北京死亡的染禽疫女孩．身体中的禽流感病毒．仍为禽源．不易造成人与人之间的传播。1月12日．市疾控中心接到中国疾控中心报告．北京人禽流感病例右肺组织分离的病毒基因序列分析结果：该病毒与我国2005—2008年分离的禽流感病毒无本质区别．仅有很小变异：该病毒没有发现与人流感病毒的重配,仍为禽源。该结果表明．  相似文献   

农业部要求各地加大动物感染甲型H1N1流感监测     

《兽药与饲料添加剂》2009,14(6):13-13

11月25日,农业部接到中国农业大学报告,该校动物医学院临床医院从52份发病犬鼻咽拭子样品中,检出2份样品呈甲型H1N1流感病原学阳性。基因序列分析表明,该病毒与当前人群中流行的病毒同源性为99％。对此,农业部要求各地在前一阶段工作基础上,进一步加大防控力度,加强动物甲型H1N1流感监测和流行病学调查,加强病毒比较分析研究,密切关注动物甲型HIN1流感病毒的变异情况。  相似文献   

广东鸽禽Ⅰ型副黏病毒基因Ⅶ型的分离鉴定     

李少方  ;邹永新  ;廖新权  ;张桂红  ;刘思伽 《养禽与禽病防治》2009,(8):40-43

2007年在广东某发病鸽群中分离到一株鸽禽Ⅰ型副黏病毒（GM01）．经测定,其鸡胚平均死亡时间（MDT）为76h,鸡脑内接种致病指数（ICPI）为1．3,在鸡和鸡胚上为中等毒力病毒。应用RT—PCR对F基因片段进行扩增并测序,结果表明该F蛋白裂解位点处氨基酸序列为112R—R—Q—K—R—F 117,是典型的强毒株序列。用DNASTAR软件对GM01株F基因片段与国内外相关的NDV参考株进行比较,结果表明GM01株与Chicken／Gx／14／2005株的核苷酸和氨基酸相似性分别为98．6％和98．4％;与Pigeon-Gxp40毒株核苷酸和氨基酸相似性分别为98．5％和98．7％,在遗传进化树中位于同一个分支,同属于基因Ⅶ型;与国内代表性弱毒疫苗株LaSota毒株和NDV强毒株F48E9的核苷酸及氨基酸相似性分别为84．1％和86．5％及86．3％和88．0％。  相似文献   

BIOLOG碳源筛选与分离技术结合研究新疆哈密南湖嗜盐菌多样性     

董秀黄  杨红梅  王芸  李萍  白雪  娄恺 《新疆农业科学》2013,50(8):1418

[目的]获得新疆哈密南湖的嗜盐菌,并分析其生物多样性,以期为分离培养基碳源设计引入一种快速可行的方法.[方法]利用BIOLOG筛选碳源并结合可培养方法分离哈密南湖中的嗜盐菌,通过16S rRNA基因序列系统发育分析法初步确定所分离菌株的分类地位,获得嗜盐菌的多样性信息.[结果]BIOLOG方法筛选出5种碳源,分别为海藻糖、蔗糖、柠檬酸、甘油和甘露醇.通过将筛选碳源添加至分离培养基的方法,共分离得到细菌和放线菌27株,分属于细菌域中3个门7个科14个属.多数菌株归属于厚壁菌门(Firmicutes),最优势菌株属于薄壁芽孢杆菌属(Gracilibacillus).其中6株菌株的16S rRNA基因序列与最近缘种的同源性在94.24;～96.86;,可能为潜在的新种或新属.[结论]新疆哈密南湖嗜盐细菌和放线菌都具有较为丰富的生物多样性,其嗜盐菌主要以薄壁芽孢杆菌和盐单胞菌为主,并且该地区可能含有丰富的嗜盐菌新物种,具有进一步开发研究价值.  相似文献   

河南地区猪戊型肝炎病毒的检测及基因序列分析     

张小霞  许锋  梁振普  乔冠华 《河南农业大学学报》2011,45(3):302-306

对从河南省郑州、洛阳、新乡、焦作、周口等5地市采集的133份血清样品进行戊型肝炎病毒( Hepatitis EVirus,HEV) IgG抗体分析;通过反转录聚合酶链式反应的方法(RT-PCR)对从郑州、中牟、新郑、济源、濮阳等5个地市采集的200份粪便样品进行HEV RNA检测.检测结果表明,79.70％的血清为HE...  相似文献   

杧果小条实蝇分子鉴定     

田明  叶军  刘娣  易建平  周国梁  郑建中 《植物检疫》2008,22(2):67-69

通过对截获于澳门入境旅客携带芒果中的实蝇（SH78）进行线粒体COⅠ、COⅡ和COⅢ基因序列的扩增测序,并与GenBank中相关的序列进行比对,结果表明截获实蝇样品线粒体COⅠ基因序列和柱果小条实蝇Ceratitis cosyra（AY788421）相似性为98.87%;COⅡ基因序列与柱果小条实蝇（C.cosyra） （AY805310）和C.cosyra（AY805311）相似性分别为99.27%和98.11%;COⅢ基因序列和C.cosyra （DQ462338）相似性为89.10%。基于COⅠ和COⅡ序列构建的系统发育树中,截获实蝇样品和杧果小条实蝇最为接近。根据序列分析和系统发育关系分析的结果,将截获的实蝇鉴定为杧果小条实蝇（Ceratitis cosyra）。鉴定结果与形态鉴定结果相同。  相似文献   

Phylogeny of Limenitidinae Butterflies （Lepidoptera： Nymphalidae） Inferred from Mitochondrial Cytochrome Oxidase I Gene Sequences     

ZHANG Min  CAO Tian-wen  ZHONG Yang  GUO Ya-ping  MA En-bo 《中国农业科学(英文版)》2011,10(4):566-575

The phylogenetic analyses of the subfamily Limenitidinae are performed based on 1471 bp of mtDNA cytochrome oxidase subunit I (C01) gene sequence data which were obtained from 21 individuals spanning 9 genera, along with those of 17species obtained from GenBank, using Apatura iris, Aglais urticae, and Polyura dolon as outgroup species. Although the transitions at the third codon positions of the COI data set were highly saturated, they were still retained for analysis as they contain the majority of the phylogenetic information, and thus, the maximum pasimony (MP) under different weighting schemes and maximum likelihood (ML) trees were reconstructed in this study. The results showed that within this subfamily, the results based on the COI gene sequences are approximately identical to the traditional classification results. However, the clustering of Lexias pardalis and Tanaecia julii within the genus Euthalia as well as the clustering of Phaedyma aspasia within the genus Neptis with weak support are different from that of the current classification scheme made by Chinese scholars. The genus Limenitis is splited into two subelusters in the trees constructed by using MP and ML methods. These results support one of the strongest hypotheses for the tribe relationships within Limenitidinae.  相似文献   

河南省猪等孢球虫的分子变异规律研究     

刘光辉  程俊贞  宁长申 《安徽农业科学》2017,45(11)

[目的]掌握河南省猪等孢球虫的分子变异规律。[方法]从河南省豫东、豫南、豫西、豫北及豫中地区的部分规模化猪场采集粪便样品,进行猪球虫卵囊的分离与纯化;从分离到的8株猪球虫分离株中提取核酸并进行测序,并与猪等孢球虫扩增株基因序列及其他相关原虫基因序列进行比对。[结果]河南省不同地区的8个猪球虫株均为猪等孢球虫,并且没有明显遗传差异。I.suis与其他7种原虫差异较大,不属于同一个生物型,同一种动物所感染的不同种类原虫之间的同源性较低。[结论]该研究结果可为有效预防和控制仔猪球虫病提供科学依据。  相似文献   

Isolation and Characterization of Transcriptionally Active Ty1-copia Retrotransposons in Fragaria × ananassa     

MA Yue HE Ping SUN Hai-yue ZHAO Gui-ling DAI Hong-yan ZHANG Zhi-hong 《中国农业科学(英文版)》2010,9(3):337-345

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