家蚕黄血近等基因系SSH文库的构建及部分EST的序列分析   总被引：5，自引：3，他引：2  

陈兆羽  徐安英  李木旺  赵云坡  周博  孙平江  钱荷英  张月华  李刚  郭锡杰 《蚕业科学》2009,35(1)

以家蚕黄血品系KY和白血品系HB构建家蚕黄血近等基因系。用回交18代的家蚕黄血基因(Y)近等基因系群体中的黄血个体和白血个体中肠为材料,构建了家蚕黄血近等基因系抑制消减杂交(SSH)cDNA文库。从该抑制消减杂交cDNA文库随机挑选出46个阳性克隆进行测序,并用CAP3软件聚类拼接,得到4个假定基因(contig)和9个已知功能基因(unigenes)。通过BLAST比对和对所得表达序列标签(EST)的同源分析表明,这些基因主要涉及能量代谢因子、RNA分子水平相关调节因子、酶类、结构蛋白等,由此初步探明了参与黄血基因(Y)协同作用的相关基因表达蛋白的种类和数量,可为进一步研究蚕茧着色的分子机制及通过遗传选择培育天然有色茧品种提供基础信息。  相似文献   

家蚕黄茧近等基因系SSH文库的构建及部分EST序列分析   总被引：2，自引：1，他引：1  

李刚  徐安英  李木旺  陈兆羽  张月华  钱荷英  孙平江  郭锡杰 《蚕业科学》2009,35(3)

以家蚕黄茧品系KY(YYCC)和白茧品系C108(+Y+Y+C+C)组配黄茧(C)近等基因系。挑取回交11代的黄茧(C)近等基因系群体中的黄血个体的黄色和浅黄色中部丝腺作为实验材料,构建家蚕黄茧近等基因系抑制消减杂交(SSH)cDNA文库。通过对SSHcDNA文库中随机挑选的104个阳性克隆测序和聚类拼接,得到15个假定基因(contig)、25个已知功能基因(unigenes)和5个未知功能基因(unknown)。获得的表达序列标签(EST)经Blast比对和同源性分析,初步发现这些基因参与家蚕体内能量代谢、基因转录、信号传导、物质转运、细胞生长分裂、细胞结构形成、蛋白质合成与降解、核酸及蛋白质加工、机体防御等诸多生物学过程。分析结果可作为深入研究家蚕茧着色分子机制的基础信息。  相似文献   

利用SSR及EST标记对鲤鱼饲料转化率的QTL分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

张丽博  张晓峰  曹顶臣  杨晶  储致远  孙效文 《农业生物技术学报》2010,18(5)

利用137个SSR(simplc sequence repeat)及EST(expressed sequence tag)标记,对柏氏鲤(Cyprinus pelle grini)/荷包红鲤(Cyprinus carpio wuyuanensis)抗寒品系的BC1F1群体93个个体进行了基因型检测.利用Windows Map Manager2.0的标记回归法进行了饲料转化率数量性状单标记回归分析.检测结果得到了8个微卫星标记(HLJ133、HLJ360、HLJ380、HLJ562、HLJ740、HLJ852、HLJ930和HLJ1420)和2个EST标记(HLJE318和HLJE417)与鲤鱼饲料转化率相关,对性状的表型贡献率为4%～11%.对同一标记的不同基因型间饲料转化率性状进行了显著性比较,通过ANOVA检验找到了相关基因型,标记HLJ360、HLJ380、HLJ562座位上,分别对应基因型212/212、236/224、220/220与饲料转化率性状正相关.本研究检测出的与鲤鱼饲料转化率性状相关的标记及基因型,为鲤鱼的QTL定位及分子标记辅助育种(MAS)提供了有效的依据.  相似文献   

油茶EST文库中不饱和脂肪酸合成关键酶基因的序列分析     

张党权  谭晓风  谢禄山  曾艳玲  陈鸿鹏  王晓红  胡孝义  王保明  蒋瑶  李魏  田华 《经济林研究》2007,25(2):5-8

采用生物信息学方法,从随机测序而构建的油茶优良无性系湘林1号种子EST文库中初步鉴定了与茶油脂肪酸形成相关的大部分关键酶基因,并对其中几个直接控制不饱和脂肪酸的形成与转化的基因进行了相应的序列分析．  相似文献   

人工选育池蝶蚌的EST和MDH同工酶分析     

罗洁  盛军庆  邱齐峻  王军花  徐毛喜  戴银根  洪一江 《水生态学杂志》2008,29(2):48-52

采用聚丙烯酰胺梯度凝胶电泳的方法, 对人工选育池蝶蚌的3 个世代的8 种组织( 心、肝、肾、外套膜、性腺、鳃、斧足、闭壳肌) 的酯酶( EST)和苹果酸脱氢酶(MDH )进行研究, 比较了不同组织的相对迁移率及酶活性大小。结果表明, 池蝶蚌的EST 和MDH 同工酶具有明显的组织差异性, 不同世代间没有明显的差异性, 表明其经人工选育后已初步成为一个纯系, 遗传性状趋于稳定。  相似文献   

EST及EST-SSR分子标记应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

黄心尧  卢茵 《畜禽业》2010,(8):40-43

EST是对cDNA文库随机挑取的克隆进行大规模测序获得的序列,长度一般为150～500bp。EST携带信息量较大,含有潜在的表达序列信息,与一些已知和未知的功能基因连锁。EST中SSR结构及分布广,不仅可以存在与内含子,也存在于编码区、非编码区和调控区,数量庞大的SSR在基因组中分布均匀,可代表整个基因组。综述了EST-SSR标记的开发过程及在动物及动物寄生虫上的应用。  相似文献   

羊草叶片cDNA文库的构建及部分表达序列标签的分析   总被引：5，自引：2，他引：5  

王丽娟  金治平  王能飞  李晓峰  刘公社 《草业学报》2009,18(1):65-71

采用SMART技术,以品质优良羊草“吉生一号”叶片为材料,构建了高质量cDNA文库。原始文库滴度达到10⁶cfu/mL,扩增文库滴度接近10¹¹cfu/mL。随机抽样检查结果表明,插入片断大小在0.5~3.0kb,主要集中在1kb左右,其中检测到插入片断大于1kb的占70%,最大达到2.5kb,其重组率达到98%。同时在扩增文库中检测到了羊草维生素E合成途径中的关键酶基因α-生育酚环化酶(TC)及γ-生育酚甲基转移酶(γ-TMT)的特异信号,挑选307个筛选出了285条EST序列,将得到的117条非重复序列与GenBank中已知序列比对,获得了如3-磷酸甘油醛脱氢酶、光系统Ⅱ蛋白D1、翻译起始因子蛋白、翻译延生因子蛋白、RNaseS-likeproteinprecursor蛋白等基因。羊草高质量的cDNA文库的构建为进一步从分子水平研究羊草及开发利用这一基因资源提供了条件。  相似文献   

2009年河北省小麦叶锈菌群体EST-SSR遗传多样性分析   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

赵盼盼  张林亚  贾胜娟  闫红飞  刘大群 《西北农业学报》2014,23(2):61-67

通过对小麦叶锈菌群体毒性多态性和EST-SSR多态性分析,为河北省小麦抗病品种的培育和合理利用提供依据。利用34个小麦抗叶锈近等(单)基因系和21对EST-SSR引物对河北省唐山、秦皇岛、沧州、保定、石家庄、邢台和邯郸的30个单孢子分离纯化小麦叶锈菌株进行毒性和DNA多态性分析。结果表明:30株小麦叶锈菌菌株间毒性相似性较高,相似系数为0.70~1.00,分子遗传多态性的相似系数为0.80~1.00。部分地理来源相同的菌株聚在同一亚组,表明小麦叶锈菌株地理来源与毒性多态性和遗传多态性有一定的相关性,但毒性多态性和SSR分子多态性相关性不明显。  相似文献   

Determination of the effect of iatrogenic blood contamination on lactate dehydrogenase and creatine kinase activity in canine cerebrospinal fluid     

Jourdan E. Brune  Annie V. Chen  Todd Coffey 《Veterinary clinical pathology / American Society for Veterinary Clinical Pathology》2023,52(1):64-70

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