16S rRNA在海洋微生物系统分子分类鉴定及分子检测中的应用   总被引：30，自引：0，他引：30  

洪义国  孙谧  张云波  李勃生 《海洋水产研究》2002,23(1):58-63

16SrRNA序列分析作为微生物系统分类的主要依据已得到了广泛认同，随着微生物核糖体RNA数据库的日臻完善，该技术成为细菌分类和鉴定的一个有力工具。本文总结了16SrRNA作为海洋微生物系统分子分类鉴定的理论基础和具体方法，分析了用16SrRNA研究海洋微生物的进化关系，并且对16SrRNA在海洋微生物分子检测中的应用作一评述。  相似文献   

海水鱼消化道菌群结构研究进展   总被引：7，自引：0，他引：7  

周志刚  石鹏君  姚斌  何夙旭  苏永全 《海洋水产研究》2007,28(5):123-131

从海水鱼消化道结构、消化道菌群结构、消化道菌群功能及消化道菌群结构研究手段等几个方面综述了海水鱼消化道菌群结构的研究进展。指出海水鱼消化道菌群结构受到生长发育阶段、养殖环境及饵料变化等因素的影响。论述了正常消化道菌群的重要功能,比较分析了目前消化道菌群结构不同研究手段,阐明了消化道微生物分子生态学研究的学术价值。为筛选高效、专一性、可定植性的海水鱼益生菌奠定了基础。  相似文献   

青岛陆源排污口邻近海域异养细菌的组成与分布   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

刘霜  李永霞  刘旭东  崔正国  王亚楠  孙蓓蓓  宋帅 《渔业科学进展》2014,35(6):23-29

对青岛近海度假区、港口区、养殖区、工业区4类排污口邻近海域异养细菌的组成与分布进行了调查研究,采用海洋异养细菌平板涂布培养法分离细菌,基于16S rDNA的扩增性DNA限制性酶切片段分析(ARDRA)进行聚类筛选并测序鉴定。结果显示,青岛排污口邻近海域可异养培养的菌株分布于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)4个细菌类群,变形菌门细菌数量占总测序数量的68%,其中γ-变形菌纲的数量在变形菌门中占88%;不同海域中细菌组成与分布有所不同,放线菌门和拟杆菌门的细菌种类较少且各海域分布有所不同,但γ-变形菌纲的弧菌属细菌(Vibrio sp.)在4类海域中均被发现,占总检测量的18.54%,其中溶藻胶弧菌(Vibrio alginolyticus)占弧菌总量的25%。不同海域也检测到V.parahaemolyticus、V.harveyi、V.campbellii、V.parahaemolyticus等水产养殖业的潜在致病菌。根据16S rDNA系统进化关系和细菌门类聚类分析得到的结论推断,工业区与养殖区海域的细菌组成和分布相似度较高,推断各海域的细菌组成与排污口类型有一定相关性。  相似文献   

海洋贝类配子及胚胎的低温冷冻保存     

张岩  陈四清  于东祥  孙珊 《海洋水产研究》2004,25(6):73-78

综述了海产贝类配子及胚胎的低温冷冻保存技术的发展现状,对目前的文献进行了汇总和分析,讨论了冷冻保存的降温程序、抗冻剂配方以及评价保存效果的指标等方面的问题,并对目前在海产贝类配子和胚胎的低温冷冻研究方面存在的问题和解决的途径进行了探讨。  相似文献   

水产养殖中使用氰化钠毒杀敌害生物对海洋生态环境影响的探讨     

庄宏儒 《福建水产》2006,(2):33-37

在水产养殖中,氰化物被用于毒杀敌害生物,但有关使用氰化物对海洋生态环境影响鲜有报道。本文从氰化钠在海洋环境中的迁移转化,对生物体的毒性效应,对生态系统的影响等方面进行探讨,研究表明:在水产养殖中合理使用氰化钠,对生态环境和人类健康不会造成有害的影响。  相似文献   

尼罗罗非鱼鼠李糖凝集素 (RBL-1)在非特异性细胞防御病原菌感染中的功能     

木亮亮  白皓  李嘉东  邱丽  尹晓雪  叶剑敏 《水产学报》2022,46(5):730-740

为了探究鼠李糖凝集素（Rhamnose-binding lectin, RBL）在硬骨鱼非特异性细胞防御病原菌感染中的作用,本研究以尼罗罗非鱼为研究模型,首先通过分离头肾单核/巨噬细胞进行体外菌应激实验,发现在罗非鱼两种重要的致病菌-无乳链球菌（Streptococcus agalactiae）和嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）应激后,尼罗罗非鱼L-鼠李糖凝集素1（OnRBL-1）的表达量显著上调。然后,通过荧光定量PCR（qRT-PCR）检测发现OnRBL-1重组蛋白能够调节病原菌诱导细胞炎症因子的表达,包括显著抑制菌诱导的IL-6、IL-8和TNF-α的表达,和促进IL-10和TGF-β的表达。此外,通过流式细胞术检测证实OnRBL-1具有促进单核/巨噬细胞的吞噬作用,同时增强呼吸爆发水平和上调活性氧的释放。以上研究结果表明,OnRBL-1在罗非鱼单核/巨噬细胞非特异性细胞防御中发挥重要的调节作用。本研究为探讨RBL-1在硬骨鱼宿主防御病原菌感染中的功能提供了参考,并有助于完善和丰富硬骨鱼类RBL的功能和在抗菌免疫应答中的基础理论体系,具有重要的科学意义。  相似文献   

尼罗罗非鱼铁调素调节蛋白在宿主抵御病原菌侵染和调节铁稳态中的功能     

尹晓雪  綦伟伟  木亮亮  王安利  叶剑敏 《水产学报》2021,45(9):1530-1544

为了研究铁调素调节蛋白(hemojuvelin,HJV)在硬骨鱼中抵御病原菌感染和维持自身铁稳态过程中的作用,实验扩增了尼罗罗非鱼铁调素调节蛋白基因(Onhjv)的开放阅读框(ORF),分析其在健康尼罗罗非鱼各组织中的分布模式及在抵御病原菌感染和调节铁稳态中的相关作用。结果显示,Onhjv的ORF全长由1 248个碱基组成,编码415个氨基酸,在不同物种之间具有一定的保守性。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,Onhjv在尼罗罗非鱼各组织中广泛分布,并在肝脏中的表达量最高。在无乳链球菌或嗜水气单胞菌感染后,Onhjv在肝脏、脾脏、肠和鳃中的表达量均显著上调。体外头肾单核/巨噬细胞和肝细胞中Onhjv表达量在受到这2种病原菌应激下也显著上调。此外,在1和10μmol/L FeCl_3溶液刺激后,Onhjv表达量在肝脏、脾脏、肠和鳃等组织,以及头肾单核/巨噬细胞和肝细胞中的表达量也呈显著上调。受重组罗非鱼IL-6蛋白[(r)OnIL-6]刺激后,头肾单核/巨噬细胞中Onhjv表达量显著上调,表明炎症因子可以促进Onhjv表达。研究表明,尼罗罗非鱼铁调素调节蛋白在宿主抵御病原菌感染和维持铁稳态的过程中发挥作用。本实验为探究HJV在硬骨鱼中的生物学功能提供了参考,同时为进一步研究铁代谢在宿主防御病原菌感染过程中的重要作用提供理论指导。  相似文献   

采用通用引物PCR配合SSCP和RFLP技术检测鱼病病原菌   总被引：8，自引：0，他引：8  

彭宣宪 《水产学报》2000,24(4):345-348

采用通用引物PCR（UPPCR）、PCR－RFLP、PCR－SSCP技术,研究快速鉴别鱼病病原菌的分子生物学诊断技术。结果发现,采用细菌16S rRNA基因保守区特异性引物,以嗜水气单胞菌、鲁克氏耶尔森菌、鳗弧菌、柱状曲挠杆菌、乙型链球菌、荧光假单胞菌等部分常见鱼病病原菌为对象,可以建立一种UPPCR技术。该技术能在保证实验条件不变的基础上,检出上述所有细菌,并还可检出大肠杆菌和双歧杆菌等非鱼病病原菌。并且认为,该法与SSCP配合即采用UPPCR－SSCP技术能较好地鉴别被检菌而用于鱼病病原菌的快速诊断。  相似文献   

The Pelagos Sanctuary for Mediterranean marine mammals     

Giuseppe Notarbartolo‐di‐Sciara  Tundi Agardy  David Hyrenbach  Tullio Scovazzi  Patrick Van Klaveren 《水产资源保护:海洋与淡水生态系统》2008,18(4):367-391

• 1. In February 2002, France, Italy and Monaco agreed to establish an international sanctuary for Mediterranean marine mammals. The resulting Pelagos Sanctuary encompasses over 87500 km² of the north‐western Mediterranean Sea, extending between south‐eastern France, Monaco, north‐western Italy and northern Sardinia, and surrounding Corsica and the Tuscan Archipelago.
• 2. The Pelagos Sanctuary illustrates how the tenets of Marine Protected Area (MPA) design can be reconciled with the dynamic nature of oceanic systems, because its spatial scale was defined by oceanographic and ecological considerations, specifically the location of the Ligurian permanent frontal system.
• 3. By expanding protective measures beyond national waters, the Pelagos Sanctuary also sets a precedent for the implementation of pelagic protected areas in the high seas. The Pelagos Sanctuary will contribute to the conservation of the Mediterranean Sea at two scales: (i) locally, by protecting important cetacean foraging and breeding grounds in the Ligurian Sea, and by providing ‘umbrella’ protection to other marine predators in this area; and (ii) regionally, by empowering other conservation measures, such as the Specially Protected Areas Protocol of the Barcelona Convention and the wider goals of the Agreement on the Conservation of Cetaceans of the Black and Mediterranean Seas (ACCOBAMS).
• 4. However, because few cetacean species are resident within the Sanctuary, their effective long‐term conservation will require large‐scale management and coordinated monitoring throughout the Mediterranean basin.

Copyright © 2007 John Wiley & Sons, Ltd.  相似文献   

Artemia enriched with high n-3 HUFA may give a large improvement in performance of Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus L.) larvae     

Kristin Hamre  Torstein Harboe 《Aquaculture (Amsterdam, Netherlands)》2008,277(3-4):239-243

Atlantic halibut larvae were fed Artemia enriched with two different oil emulsions (cod liver oil and 2050TG) from first feeding to 70 days after first-feeding (dpff). Larvae fed 2050TG enriched Artemia had better growth, survival and eye migration than larvae fed the cod liver oil enriched Artemia, while pigmentation rate was similar in the two groups. In addition to the difference in fatty acids, the two emulsions differed in lipid class composition, since 2050TG is a synthetic oil and a mixture of mono-, di- and tri-acylglycerol, while cod liver oil is a tri-acylglycerol. Total lipid level, estimated as fatty acid methyl esters (FAME) was similar in the two Artemia types, but sum of n-6 and n-3 fatty acids, arachidonic acid (20:4n-6, ARA), docosahexaenoic acid (22:6n-3, DHA) and eicosapentaenoic acid (20:5n-3, EPA) were higher in Artemia enriched with 2050TG than in the cod liver oil enriched Artemia. However, the main difference in fatty acid composition in the larvae, was a higher DHA (% of total fatty acids) in 2050TG larvae than in cod liver oil larvae. The lipid level measured as FAME was up to four times higher in the 2050TG larvae than in the cod liver oil larvae, and the reason for this may have been a better bioavailability of the partly digested lipid in the 2050TG emulsion. The correlation between a high level of lipid in the larval tissues (e.g. high energy status) and improved eye migration in larvae fed the 2050TG enriched Artemia supports the hypothesis that energy limitation on the larval stage may be a cause of the impaired eye migration commonly observed in farmed Atlantic halibut juveniles.  相似文献