合浦珠母贝DNA的抽提和RAPD反应体系的优化   总被引：9，自引：5，他引：9  

郭奕惠  黄桂菊  喻达辉 《南方水产》2006,2(4):59-64

分别从保存于-70℃和95%乙醇的合浦珠母贝组织提取总DNA。结果表明,乙醇保存标本用双蒸馏水预处理后所提的DNA与-70℃保存的标本所提的DNA质量均较好。用抽提的DNA为模板优化RAPD条件,得到适合于合浦珠母贝的RAPDPCR反应条件为:20μL反应体系中包括20ngDNA模板,1×PCRBuffer,0.1mmol·L-1dNTPs,2.5mmol·L-1MgCl2,0.2μmol·L-1引物,1UTaqDNA聚合酶。最佳退火温度40℃。PCR产物用非变性PAGE银染和琼脂糖EB染色检测所得到的主要带型相同,但PAGE能检测到更多的多态带。  相似文献   

Species identification of <Emphasis Type="Italic">Pinctada imbricata</Emphasis> using intergenic spacer of nuclear ribosomal RNA genes and mitochondrial 16S ribosomal RNA gene regions   总被引：2，自引：0，他引：2  

Tetsuji?MasaokaEmail author  Takanori?Kobayashi 《Fisheries Science》2005,71(4):837-846

ABSTRACT:   For pearl production, pearl oyster seeds from foreign pearl oysters as well as hybrids between native and such foreign pearl oysters are produced in Japanese hatcheries. However, it is very difficult to identify these pearl oysters and hybrids based on morphological measurements. Thus, a molecular identification method for distinguishing Atlantic pearl oysters Pinctada imbricata from the Indian-Pacific pearl oyster group including P. martensii and P. fucata , was developed. The polymerase chain reaction (PCR) products of the partial intergenic spacer (IGS) of nuclear ribosomal RNA (rRNA) genes exhibited length polymorphism between P. imbricata (590 bp) and the other two species (427 bp). The restriction fragment length polymorphism analysis of the PCR products (PCR-RFLP) cleaved with Mse  I observed in the IGS of nuclear rRNA genes also gave different profiles between P. imbricata and the other two species. The difference in PCR-RFLP using Alu  I was also detected in the mitochondrial 16S rRNA gene regions between P. imbricata and the other two species. Thus, the method developed enables the distinction of P. imbricata from P. martensii and P. fucata .  相似文献   

Use of a biopsy technique to obtain gonad tissue from the blacklip pearl oyster Pinctada margaritifera (L.)     

Héctor Acosta-salmón  & Paul C Southgate 《Aquaculture Research》2004,35(1):93-96

  相似文献   

利用ITS和AFLP标记探讨中国、日本和澳大利亚3种珠母贝的亲缘关系     

喻达辉  朱嘉濠 《南方水产》2006,2(5):36-44

我国合浦珠母贝 Pinctada fucata 的命名较混乱,与日本的 P.fucata martensii 和澳大利亚的 P.imbricata 的分类关系存在争议。用 ITSs 序列和 AFLP 标记对这3个种的遗传关系进行了分析。结果表明这3个地理种的遗传分化很低,种内和种间的遗传距离相互重叠,AFLP 数据的聚类分析表明澳大利亚种群大部分个体单独聚合成一支,主成分分析结果相似。种问的遗传距离与分化程度与其地理距离呈正相关。分子方差结果也表明种间的差异较小,低于6%。这些结果表明这3个种实际上是同一物种。由于大西洋的 P.imbricata 与澳大利亚的不同,因此根据分类命名的优先原则,正确的种名应为 P.fucata。  相似文献   

合浦珠母贝Pf-Cnot2基因的克隆与表达分布     

王雨亭  徐广锐  梁健  谢军  谢莉萍  张荣庆 《上海海洋大学学报》2014,23(5):649-655

采用RACE技术从合浦珠母贝外套膜组织中克隆得到了CCR4-NOT复合体第二亚基(Cnot2)基因,命名为PfCnot2。该基因全长2 616 bp,开放阅读框为1 725 bp,编码574个氨基酸,理论分子量为61 ku,理论等电点为6.25。蛋白序列分析表明它富含丝氨酸、甘氨酸和苏氨酸,具有保守的NOT2_3_5结构域。系统进化分析显示Pf-Cnot2蛋白与脊椎动物的Cnot2蛋白进化关系较远。Pf-Cnot2在合浦珠母贝的外套膜边缘、外套膜缘膜、足、生殖腺、内脏团、闭壳肌和鳃等组织中均有表达,在生殖腺中表达量最高。该基因从担轮幼虫期至幼贝期均有表达,担轮幼虫期表达量最少,D型期比担轮幼虫期有显著增高。上述研究结果为进一步了解Pf-Cnot2在合浦珠母贝中发挥的作用提供了基础数据。  相似文献   

Donor effect on cultured pearl nacre development and shell matrix gene expression in Pinctada margaritifera reared in different field sites          下载免费PDF全文

Chin‐Long Ky  Floriane Broustal  Manaarii Sham Koua  Virgile Quillien  Benoît Beliaeff 《Aquaculture Research》2018,49(5):1934-1943

Understanding the respective roles played by donor and recipient pearl oysters in pearl quality determination in relation to the environment is a challenge for the pearl industry. In most Pinctada species, pearl size is mainly related to recipient oyster growth performance but also relies to some extent on the biomineralisation activity of the pearl sac, a tissue that originates from the donor oyster mantle. We examined donor effect on pearl size in response to culture in the lagoons on Arutua and Apataki atolls. Overall, nacre weight and thickness were greater in Arutua than in Apataki, but sensitivity to the environment differed between donors. Some donors were associated with significantly heavier and thicker nacre in Arutua (I group), while others had similar results at the two sites (NI group). On average, up to 20% of the pearl size could be attributed to the donor but, in group I, donor effect was responsible for up to 36% of nacre weight determination. Additionally, a real‐time PCR expression study of eight matrix protein genes related to biomineralisation in the pearl sac showed that MSI60, pearlin and pif177 were significantly and positively correlated with nacre weight and thickness, with the latter two genes explaining the larger pearl size observed in Arutua. Donor oysters in P. margaritifera therefore play a key role in pearl size improvement, related to the role of the shell matrix protein genes. Understanding such contributions could help in the design of genetic selection plans for specific and adapted donor oyster lines.  相似文献   

马氏珠母贝4种壳色选育系F₃的生长特性和遗传多样性比较     

陈静  刘志刚  孙小真  王辉  杜晓东 《上海海洋大学学报》2010,19(5):588-595

以随机扩增多态性DNA (RAPD)分析为实验手段,结合形态学特征统计,对经过3代壳色及生长速度群体选育的马氏珠母贝(Pinctada martensiiDunker)黑、白、红、黄4种壳色选育系的生长及遗传多样性进行研究,为进一步选育提供理论依据。结果显示:马氏珠母贝4种壳色F₃选育系的壳色纯化率分别达到黑壳色95.83%、白壳色88.33%、红壳色100%、黄壳色95.0%;各选育系的生长速度均大于普通养殖群体,系间的生长速度也存在显著差异。4种壳色选育系平均多态性位点比率(P)分别为82.51%,81.93%,75.30%,77.03%;平均Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.233 6,0.213 4,0.196 5,0.201 9;平均Shannon信息指数(Hi)分别为0.351 6,0.323 0,0.279 9,0.305 9;各系间的遗传分化系数(G_st)为0.214 3~0.318 6,遗传距离(Dxy)分别为黑白0.113 5,白黄0.130 3,黑黄0.134 9,白红0.154 6,红黄0.158 4,黑红0.196 8;聚类分析表明各选育系间的亲缘关系由近及远顺次为黑壳色、白壳色、黄壳色和红壳色。研究表明4种壳色选育系均具有较高的遗传多样性,选育系间遗传分化明显。研究结果为4种壳色马氏珠母贝的定向选育奠定了理论基础。  相似文献   

3 种野生珍珠贝表型性状比较及通径分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

邓正华  陈明强  李有宁  赵旺  郑兴  刘芊  王继金  王雨 《广东农业科学》2019,46(1):122-132

【目的】为开发具有优良生产性能的珍珠贝新品种,并为亲贝的挑选提供科学依据。【方法】取 自然海区捕捞的野生合浦珠母贝、黑珠母贝和射肋珠母贝各 100 只,测量其形态性状（壳长、壳高、壳宽、绞 合线长）和经济性状（湿重、软体重、壳重）。对其各表型性状进行比较,并应用通径分析和多元回归等方法 进行数据分析。【结果】合浦珠母贝各表型性状的均值和极大值均大于其他两种珍珠贝,而射肋珠母贝的壳高、 壳宽、绞合线长及含肉率大于黑珠母贝。各性状相关系数中,除射肋珠母贝的壳高与壳宽之间相关性不显著外, 其他种类性状间均达到极显著水平。3 种野生珍珠贝中,影响合浦珠母贝、黑珠母贝和射肋珠母贝湿重的直接 作用最大的形态性状分别为壳宽（0.362）、壳高（0.517）和壳长（0.337）;影响软体重直接作用最大的分别 为壳宽（0.379）、壳高（0.388）和壳宽（0.340）;影响壳重直接作用最大的形态性状均是壳高。【结论】3 种珍珠贝间影响其湿重的最大形态性状不同,影响其壳重的形态性状都相同。  相似文献   

马氏珠母贝育珠前后矿物元素的变化     

刘娟花  纪丽丽  李晓菲  宋文东  苗东亮  马孝甜 《广东农业科学》2011,38(7):132-133,139

采用电感耦合等离子体发射光谱法对育珠前后马氏珠母贝外套膜和珍珠囊中的Ca、Cu、Fe、Mg、Zn等8种矿物元素的含量进行分析测定,旨在通过对育珠前后外套膜和珍珠囊中8种重要的矿物元素含量的变化来探究珍珠形成机理。比较结果得出:外套膜中,Ca、Fe、Mg、Mn、Zn等5种元素在育珠后都发生了显著变化,Ca、Mg和Zn上升率分别为46.6%、30.12%和132.80%;珍珠囊中,Cd、Fe、Mg、Mn、Zn、Co等元素的含量在育珠前后存在显著差异,Zn含量变化最明显,上升达155.18%。  相似文献   

换水频率和附着基对大珠母贝育苗效果的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

梁飞龙  林伟财  邓岳文  谢绍河 《中国农学通报》2015,31(29):33-38

为了提高大珠母贝育苗生产的效率,2013 年4 月10 日—6 月27 日,设立3 个试验分别比较了换水频率、附着基的类型和附着基的颜色对大珠母贝育苗效果的影响。试验Ⅰ：换水频率对大珠母贝幼虫生长发育和存活的影响,设立A1、A2、A3、A4和A0共5 个组,其中A1、A2、A3、A4分别为每3、6、9、12 天换水1次,A0为对照组每日换水1 次;试验Ⅱ：附着基的种类对大珠母贝幼虫附着变态的影响,设立B1、B2、B3、B4共4 个组,其中B1、B2、B3、B4分别为尼龙网布、黑色粗糙面塑料片、黑色光滑面塑料片、遮阳网;试验Ⅲ：附着基颜色对幼虫附着变态的影响,设立C1、C2、C3、C4共4 个组,其颜色分别为红色、黑色、黄色和绿色。结果表明,换水频率、附着基的种类和颜色对大珠母贝的育苗效果存在显著影响(P＜0.05)。试验中每6~9 天换水一次的幼虫生长和成活率最高,粗糙面塑料片和深色（红色、黑色）附着基附苗量最大,大珠母贝生产中适合在此条件下育苗。  相似文献