The influence of soil properties on the structure of bacterial and fungal communities across land-use types   总被引：3，自引：1，他引：3  

Christian L. Lauber  Michael S. Strickland  Mark A. Bradford  Noah Fierer   《Soil biology & biochemistry》2008,40(9):2407

Land-use change can have significant impacts on soil conditions and microbial communities are likely to respond to these changes. However, such responses are poorly characterized as few studies have examined how specific changes in edaphic characteristics do, or do not, influence the composition of soil bacterial and fungal communities across land-use types. Soil samples were collected from four replicated (n = 3) land-use types (hardwood and pine forests, cultivated and livestock pasture lands) in the southeastern US to assess the effects of land-use change on microbial community structure and distribution. We used quantitative PCR to estimate bacterial–fungal ratios and clone libraries targeting small-subunit rRNA genes to independently characterize the bacterial and fungal communities. Although some soil properties (soil texture and nutrient status) did significantly differ across land-use types, other edaphic factors (e.g., pH) did not vary consistently with land-use. Bacterial–fungal ratios were not significantly different across the land-uses and distinct land-use types did not necessarily harbor distinct soil fungal or bacterial communities. Rather, the composition of bacterial and fungal communities was most strongly correlated with specific soil properties. Soil pH was the best predictor of bacterial community composition across this landscape while fungal community composition was most closely associated with changes in soil nutrient status. Together these results suggest that specific changes in edaphic properties, not necessarily land-use type itself, may best predict shifts in microbial community composition across a given landscape. In addition, our results demonstrate the utility of using sequence-based approaches to concurrently analyze bacterial and fungal communities as such analyses provide detailed phylogenetic information on individual communities and permit the robust assessment of the biogeographical patterns exhibited by soil microbial communities.  相似文献   

植酸酶基因定性PCR检测方法及阳性质粒分子的构建     

李俊  刘信  曹应龙  武玉花  厉建萌  吴刚  张丽  卢长明 《作物学报》2012,38(4):639-647

植酸酶基因在农业生产中具有很高的应用价值,正被广泛用于农作物的基因工程研究。为了满足转植酸酶基因作物安全监管的需要,通过优化PCR检测条件,建立了植酸酶基因特异性定性PCR检测方法。该方法具有良好的扩增特异性和检测灵敏度,可以满足我国植酸酶转基因作物监管需要。此外,我们将6大作物(小麦、水稻、棉花、大豆、玉米和油菜)的内标准基因和植酸酶基因克隆到同一载体上,构建成了阳性质粒分子pBS Endogenous-phytase。该质粒分子适用于这6大作物中植酸酶基因的筛查检测。本研究为转植酸酶基因作物的安全监管提供了阳性材料和检测方法。  相似文献   

牡丹类psDHN-YSK2基因全长cDNA的克隆与表达分析     

张扬盖树鹏  刘春英郑国生华芳霞  张玉喜 《中国农学通报》2012,28(16):219-224

为了获得牡丹类脱水素基因的全长cDNA序列,推测其在休眠解除进程中的生物学功能,以不同低温处理时间的牡丹花芽为供试材料,末端快速扩增方法克隆全长cDNA序列,实时定量PCR分析其表达模式。结果表明牡丹类脱水素基因全长cDNA序列为1187 bp,包括831 bp的开放阅读框,114 bp的5’非编码区和242 bp的3’非编码区。其编码的蛋白具有两个植物脱水素蛋白特征性K片段,根据Close的分类方法,属于YSK2类脱水素蛋白。系统发生分析表明psDHN-YSK2基因与葡萄亲缘关系最近。在花芽内休眠解除前期随着低温处理时间的延长psDHN-YSK2表达呈上调趋势。本研究克隆了牡丹psDHN-YSK2的全长cDNA序列,分析了其在花芽内休眠解除过程的表达趋势,暗示了其参与了牡丹花芽的内休眠过程。  相似文献   

基于染色体单片段代换系的水稻粒形QTL定位   总被引：8，自引：0，他引：8  

王军  朱金燕  周勇  杨杰  范方军  李文奇  梁国华  仲维功 《作物学报》2013,39(4):617-625

水稻的粒形是影响水稻产量和品质的重要因子之一, 是由多基因控制的数量性状。染色体单片段代换系由于减少了个体间遗传背景的干扰, 已经成为鉴定复杂性状QTL的新型遗传材料。本研究以广陆矮4号为受体,日本晴为供体的119个染色体单片段代换系群体为试验材料,通过单因素方差分析和Dunnett’s多重比较,测验单片段代换系与受体亲本之间粒形的差异,鉴定了代换片段上粒形相关的QTL。以P≤0.001为阈值, 共检测到39个粒形相关的QTL。其中,粒长相关的19个,其加性效应值为0.18~1.06 mm,加性效应百分率为2.40%~14.13%;粒宽相关的14个,其加性效应值为0.09~0.31 mm,加性效应百分率为2.71%~9.15%;粒厚相关的6个,其加性效应值为0.05~0.10 mm,加性效应百分率为2.14%~4.46%。这些QTL的鉴定,为进一步精细定位并克隆相应QTL和高产、优质水稻新品种的分子标记辅助选择奠定了基础。  相似文献   

春兰AGL6基因的克隆及实时定量表达分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

孙崇波  向林  施季森  胡凤荣  郭方其  秦德辉 《分子植物育种》2010,8(5)

本研究采用RT-PCR结合RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到一个AGL6基因。序列分析表明,该基因含有一个729bp长的开放阅读框(ORF),共编码242个氨基酸。系统进化树分析显示,该基因属于MADS-box基因家族AP1/AGL9组的AGL6同源基因,其编码的蛋白与其它植物AGL6类蛋白具有较高的同源性,命名为CgAGL6(基因登录号为HM208533)。实时荧光定量表达分析表明,CgAGL6基因春兰不同组织中均有表达,其中在唇瓣、花芽和子房中的表达量较高,在花瓣和萼片中的表达量次之,在根、叶和蕊柱中的表达量最低,显示了CgAGL6基因可能在春兰成花转变和花器官的形成过程中起着重要作用。  相似文献   

中国耕地资源安全问题及其对策研究   总被引：12，自引：2，他引：12  

张士功  纪纯  邱建军  唐华俊 《中国农学通报》2005,21(12):372-372

耕地资源作为农业最主要的生产资料和农民最直接的劳动对象,是构成粮食综合生产能力的最基本要素之一和实现中国粮食安全的基础和保证。在研究中国耕地资源的数量安全、质量安全和生态安全现状的基础上,提出了保护和提高中国耕地资源安全的4个对策建议。  相似文献   

黄瓜早期若干数量性状遗传研究   总被引：3，自引：1，他引：3  

尹维娜  司龙亭  赵飞  宋秋瑾  王普  张建军 《中国农学通报》2006,22(1):232-232

利用4个黄瓜亲本，按4×4双列杂交法配制16个组合，测定早期产量、单瓜重、瓜条长度、瓜条直径、瓜把长度、果皮颜色6个数量性状。试验根据Hayman双列杂交法进行遗传分析。结果表明：单瓜重、瓜条长度、瓜条直径、瓜把长度、果皮颜色性状符合“加性-显性”效应模型，以加性效应为主，早期产量性状还受到上位性效应的作用，但以显性效应为主，存在超显性。除早期产量和瓜条直径外，其余各性状的广义遗传力和狭义遗传力都很高，表明受环境影响较小，可在早代进行选择；早期产量和瓜条直径的狭义遗传力较小，以非加性效应为主。  相似文献   

杂交粳稻几个数量性状的配合力分析     

马洪文  王昕  代晓华  殷延勃  王坚  强爱玲  刘炜  史延丽 《种子》2006,25(2):28-31

利用6个粳型不育系和6个恢复系，采用不完全双列杂交法配制了36个杂交组合，对其8个数量性状的一般配合力及亲本间组合的特殊配合力效应进行了分析。结果表明，株高、穗长、穗总粒数、穗实粒数、稳秕粒数、千粒重这几个性状受亲本一般配合力的影响，单株粒重受特殊配合力的影响，单株稳数的一般配合力和特殊配合力作用相近。其中不育系552A的穗总粒数、稳实粒数、单株粒重等一般配合力的相对效应值较大，恢复系FR796、2002FR24的穗总粒数、穗实粒数、单株粒重的一般配合力的相对效应值较大。  相似文献   

利用籼粳交探讨水稻株高和抽穗期的遗传基础     

曾晶  姜恭好  何予卿  张端品 《分子植物育种》2006,4(4):527-534

广亲和基因的发现,克服了籼粳交杂种不育的矛盾,但杂种后代株高过高、抽穗期延迟等问题仍然限制着籼粳亚种间杂种优势的利用。本试验利用一个籼粳交(珍汕97/武育粳2号)双单倍体群体(doublehaploidpopulation,DH系)及其分别与两亲本回交构建的两个回交群体,考查了株高和抽穗期的遗传,将三个群体的表型值和两个回交群体的中亲优势值进行了数量性状位点(quantitativetraitlocus,QTL)检测及效应分析,并对结果进行了比较。2个性状在3个相关群体中一共检测到了21个主效QTL和10个上位性QTL,主效QTL的数目和贡献率都比上位性QTL大,而且,在10个上位性QTL中,发生在2个主效QTL间的互作有3个,主效QTL与背景位点间的互作有6个,2个互补位点间的互作仅有1个,进一步说明了主效QTL在株高和抽穗期遗传中的重要作用。比较加性和非加性QTL的作用,发现加性效应、显性效应和上位性效应是籼粳亚种间杂种株高和生育期变化的共同遗传基础。  相似文献   

猪圆环病毒Ⅱ型PCR检测方法的研究   总被引：5，自引：0，他引：5  

王宪文  刘兴友  梁美兰  郑玉姝  刘丽艳 《中国农学通报》2007,23(9):28-31

【目的】建立快速、简便、特异的检测猪圆环病毒II型的PCR方法;【方法】根据已发表的猪圆环病毒II型基因序列设计合成了一对引物,用酚-氯仿法抽提可疑病料中的病毒DNA,应用PCR技术对猪圆环病毒进行基因扩增,PCR产物进行序列测定;以猪瘟病毒、猪伪狂犬病毒、猪细小病毒为对照,进行特异性试验;取部分病料进行重复性试验;【结果】PCR方法扩增出了长度为702bp的片段,扩增产物经测序和序列分析表明扩增的序列为PCV2序列;猪瘟病毒、猪伪狂犬病毒、猪细小病毒的PCR扩增均为阴性,与预期结果一致;部分病料PCR重复检测5次,检测结果完全一致;【结论】PCR检测方法可以对猪圆环病毒病作出敏感、特异、准确地诊断,该方法检测的基因最低模板量为2×10-5ng/ml。  相似文献