斑节对虾Sox基因HMG盒的PCR扩增及SSCP分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

汪桂玲 《水产学报》2005,29(4):478-481

SRY基因是人类及哺乳动物睾丸决定因子的最佳候选基因,HMG盒是SRY基因编码蛋白质的唯一功能区,在性别决定中极其重要且高度保守,许多进化程度上明显不同的物种中都能检测出SRY基因的HMG盒,即Sox基因。斑节对虾是一种重要经济虾类,其性别决定机制研究薄弱,至今未找到性染色体。本研究根据人的SRY基因的HMG盒保守区的核苷酸序列,设计了1对兼并引物,通过PCR扩增出斑节对虾的Sox基因,并对扩增产物进行SSCP分析。结果表明,斑节对虾雌雄个体均存在Sox基因,从雌雄个体中均扩增出约350bp和220bp两条基因片段,推测其中350bp片段含内含子,SSCP结果显示斑节对虾内存在Sox基因家族的不同成员,且雌雄存在差异最后我们讨论了对虾性别决定可能的机制。  相似文献   

生长素基因Ghrelin对高邮鸭产蛋性能的遗传效应   总被引：1，自引：0，他引：1  

朱文奇  李慧芳  宋卫涛  徐文娟  王强  陈宽维 《四川农业大学学报》2009,27(3):354-359

运用PCR-SSCP和DNA测序的方法检测高邮鸭Ghrelin基因多态性,分析其对产蛋性能的遗传效应。结果表明:①Ghrelin基因内含子1的157 bp处发生了9 bp缺失,发现了AA、BB、AB 3种基因型,A、B等位基因频率分别为0.24和0.76。B等位基因对产蛋数、开产体重表现为正效应,BB、AB基因型个体的产蛋数显著高于AA基因型个体(P<0.05)。②内含子2的431 bp处发生了T→C的突变,发现了CC、DD、CD 3种基因型,C、D等位基因频率分别为0.41和0.59。C等位基因对开产体重具有正效应,CD基因型个体开产体重显著高于DD基因型(P<0.05)。③外显子3的909 bp处发生了A→G的突变,同时产生了苏氨酸→丙氨酸的变化,发现了EE、FF、EF 3种基因型,E、F等位基因频率分别为0.33和0.67。F等位基因对开产体重、蛋重、最大连产天数具有正效应,EF基因型个体的最长连产天数显著高于EE、FF基因型(P<0.05)。  相似文献   

猪LPL基因多态性及其部分DNA片段的测序   总被引：8，自引：0，他引：8  

吴珍芳  熊远著  邓昌彦 《华中农业大学学报》1999,18(5):461-465

脂蛋白脂肪酶是影响动物脂肪沉积的关键酶之一。本利用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ法,对猪的ＬＰＬ基因进行了多态性分析,发现其５端区域存在ＤＮＡ多态性。脂肪型猪种梅山猪和通城猪表现出３种等位基因型（ＡＡ、ＡＢ、ＢＢ）,其等位基因Ａ和Ｂ的频率分别为０．７６、０．２４和０．７７、０．２３;而瘦肉型猪种长白猪和大白猪表现出另外不同的３种等侠基因型（ＣＣ、ＣＤ、ＤＤ）,其等位基因Ｃ和Ｄ的频率分别为０．７６、０．２４和７  相似文献   

Phylogenetic relationships between purple and tea-green individuals of the blue swimming crab Portunus trituberculatus by PCR-SSCP analysis     

CHI Da-li  ;GAO Huan  ;SHEN Song-dong  ;YAN Bin-lun 《农业科学与技术》2009,(1):54-62

Given the morphological characters of purple crabs identical with that of the tea-green ones except the body color, it is expected that the purple crabs and the tea-green ones were from the same species. In order to identify the phylogenetic relationships between them at the molecular level, we amplified and compared two conserved mitochondrial gene fragments of purple and tea-green crabs through PCR-SSCP and DNA sequencing analyses. The results showed that there was no distinct variation of DNA bands of both the CO1 and 16srRNA genes detected in polyacrylamide gels through SSCP analysis between purple and tea-green crab samples, and the following sequence analysis of color-different crab individuals presented 99.81% and 99.91% nucleotide sequence identity of the CO1 and 16srRNA genes respectively. These indicated that there was no species or subspecies differentiation between purple and tea-green crabs, meaning that they belonged to the same species, Portunus trituberculatus.  相似文献   

PCR-SSCP分析条件的优化   总被引：13，自引：0，他引：13  

魏太云  林含新  谢联辉 《福建农林大学学报(自然科学版)》2002,31(1):22-25

聚合酶链式反应及单链构象多态性 (PCR-SSCP)技术作为一种区分检测基因组之间微小差异的有效方法 ,具有快速、简便、灵敏和适用于大样品量筛选的特点 .本研究从变性剂类型、电泳缓冲液的离子强度、交联度、电泳温度、甘油浓度及变性剂类型等方面对影响 PCR-SSCP的电泳条件进行分析 ,以期对该方法的应用提供参考  相似文献   

水牛催乳素基因第3外显子群体遗传特征分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

袁峰  苗永旺  李大林  刘丽仙  熊飞  刘伟  贡潘偏抽 《云南农业大学学报(自然科学版)》2011,5(3):312-317

 催乳素基因（PRL）第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛共12个群体275个个体PRL exon 3的遗传变异,结果表明：水牛PRL exon 3由108个核苷酸组成,编码36个氨基酸,在水牛群体中未检测到单核苷酸多态性位点（SNPs）,PRL exon 3与水牛产奶量之间没有直接相关性。通过序列比对发现在不同物种中PRLexon 3具有高度保守性。但在PRL第2内含子（intron 2）的2265nt和2335nt分别检测到G>A突变和C>T突变,其中2335nt位点突变仅在2头槟榔江水牛中检测到。  相似文献   

13/17罗伯逊易位猪生长抑素基因的多态性研究   总被引：1，自引：1，他引：0  

赵雯  姜丽花  何晓波  张廷荣  孙金海 《中国畜牧兽医》2009,36(1):53-56

采用微量全血培养法制备染色体标本,对13/17罗伯逊易位猪的3种杂交组合的309头后代进行核型鉴定,结果样本中存在3种核型的猪：正常核型猪（2n=38）、易位杂合子猪（2n=37）和易位纯合子猪（2n=36）;利用PCR SSCP技术检测发现生长抑素基因外显子1不存在多态性;其内含子的266～602 bp片段存在2个突变位点(T520C,G521T),但仅检测到2种基因型：AA和AB。遗传多态性分析结果表明,不同杂交组合后代及不同核型的猪群中AA基因型频率（频率范围为0.58～0.77）和A等位基因频率（频率范围为0.79～0.90）均显著高于其AB基因型频率（0.23～0.42）和B等位基因频率（0.10～0.21）;易位杂合子猪的AB基因型频率（0.42）均高于正常猪（0.25）及易位纯合子猪（0.40）。经卡方检验,差异不显著（P>0.05）,群体的基因型频率处于哈代－温伯格平衡状态。  相似文献   

5个绵羊品种CAST基因多态性及其与肉品质的相关性     

王华  王建福  王欣荣  成述儒  李晓梅  王志明  樊庆山  富丽霞  李双  周晓霞 《浙江农业学报》2016,28(8):1309

为从分子水平研究甘肃境内典型养殖模式下甘肃高山细毛羊、小尾寒羊、藏羊、蒙古羊和滩羊5个绵羊品种的CAST基因多态性与肉品质的相关性,探讨以CAST为候选基因,提高绵羊肉品质的可能性。采用PCR SSCP技术对5个绵羊品种的CAST基因内含子3多态性进行检测,并就CAST基因多态性与9月龄肉品质进行相关性分析。根据比对结果发现,与等位基因A相比,等位基因B发现G62T以及C110T突变,等位基因C发现C92T突变,形成AA、AB、BB和AC 4种基因型;经检验表明,5个绵羊品种均处于非 Hardy Weinberg 平衡状态;群体遗传多态性分析表明,5个绵羊品种的多态信息含量均为中度多态;关联分析表明,5个绵羊品种 CAST基因变异位点的4个基因型间失水率AC基因型显著高于其他基因型（P<005）,对于剪切力AC基因型显著低于其他3种基因型（P<005）;不同绵羊品种间基因型分析表明,对于5个绵羊品种AC基因型的失水率显著高于其他3种基因型,除蒙古羊外,AC基因型的剪切力显著低于其他基因型;变异对眼肌面积没有显著性影响。这些关联说明CAST 基因可作为候选基因用于绵羊产肉性能和肉品质的分子标记辅助选择。  相似文献   

荷斯坦牛HSP70-1基因遗传多态性与乳腺炎抗性关系分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

程维杰  李秋玲  王洪梅  孙延鸣  王长法  李建斌  仲跻峰 《新疆农业科学》2008,45(6):1187

利用PCR-SSCP和PCR-RFLP相结合的方法检测HSP70-1基因在253头中国荷斯坦牛中的多态性,并分析其多态性与体细胞评分(SCS)的相关性.结果表明,HSP70-1基因扩增片断的1 623 bp处产生G-A的突变,1 623bp处产生G-A-C的突变.两位点都是沉默突变,未引起氨基酸序列的改变.HSP70-1基因分别经EcoRⅡ、BglⅠ、FokⅠ消化后表现多态性.经χ2 适合性检验,中国荷斯坦牛在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态.同时,群体基因座不同基因型与SCS相关分析的结果表明,2 409位点基因型与SCS相关性不显著,1623位点与SCS相关性显著,CC型SCS指标显著低于AG、GG型(P＜0.05),CC基因型可作为乳腺炎抗性的有利基因型,可将HSP70-1基因作为奶牛乳腺炎候选基因,将应用于分子标记辅助选择育种,为乳腺炎抗性牛群的选育奠定一定的理论基础.  相似文献   

宁夏地区葡萄卷叶伴随病毒遗传变异的PCR-SSCP分析          下载免费PDF全文

李文学  吕苗苗  胡丽杰  闫思远  孙牧笛  顾沛雯 《西南大学学报(自然科学版)》2019,41(10):1-10

宁夏贺兰山东麓酿酒葡萄卷叶病病株率较高,严重影响了酿酒葡萄产业的健康发展,但有关其病原葡萄卷叶伴随病毒(Grapevine leafroll-associated virus, GLRaVs)的遗传变异情况则鲜有报道.利用RT-PCR技术对宁夏酿酒葡萄不同种植区的7个主栽品种的GLRaV-1和GLRaV-3进行分子检测,利用SSCP技术对扩增片段进行遗传变异分析.试验结果共获得8个GLRaV-1和13个GLRaV-3的阳性样本. 8个GLRaV-1分离物基于CP基因分析差异明显,可分为3类; 13个GLRaV-3分离物基于RdRp基因分析差异明显,可分为3类,而基于CP和HSP70基因分析可分为2类.说明宁夏酿酒葡萄不同种植区、不同品种的GLRaV-1和GLRaV-3种群分子特性存在差异且遗传变异明显.这有助于宁夏地区酿酒葡萄GLRaVs流行学调查和分子诊断分析,为该病害的防控提供理论依据.  相似文献