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Mumu Wang Zuofeng Zhu Lubin Tan Fengxia Liu Yongcai Fu Chuanqing Sun Hongwei Cai 《Breeding Science》2013,63(2):227-232
To understand the genetic diversity and indica-japonica differentiation in Bangladesh rice varieties, a total of 151 accessions of rice varieties mostly Bangladesh traditional varieties including Aus, Boro, broadcast Aman, transplant Aman and Rayada varietal groups were genotyped using 47 rice nuclear SSRs. As a result, three distinct groups were detected by cluster analysis, corresponding to indica, Aus and japonica rice. Among deepwater rice varieties analyzed some having particular morphological features that mainly corresponded to the japonica varietal group. Some small seeded and aromatic varieties from Bangladesh also corresponded to the japonica varietal group. This research for the first time establishes that the japonica varietal group is a prominent component of traditional varieties in Bangladesh, particularly in deepwater areas. 相似文献
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DNA分子标记与动物遗传育种 总被引:1,自引:0,他引:1
DNA分子标记技术的出现,对动物遗传育种产生了深远的影响,利用DNA标记可以研究动物整个基因组水平的遗传变异,进行动物遗传资源研究、标记辅助选择、标记辅助导入、杂种优势预测、选配、品种与品系确认、构建高分辨率遗传连锁图谱、QTL搜寻定位等。目前在动物遗传中广泛使用的标记主要有mtDNA、RFLP、RAPD、AFLP、SSR、SNP和EST标记。本文综述了这些标记技术的原理、特点,并根据其特点,分析其在动物遗传育种中的应用,并通过维普数据库搜索比较分析研究者对各种技术的使用情况。 相似文献
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番茄资源对叶霉病的抗性鉴定和SSR标记遗传变异分析 总被引:1,自引:0,他引:1
对62份番茄种质资源进行了抗番茄叶霉病鉴定, 共筛选出抗病材料17份, 其中对全部生理小种(1.2.3、1.2、2.3、1.2.3.4、1.2.4)均表现抗病或免疫的材料9份;抗3个生理小种的材料4份;抗2个生理小种的材料2份;抗4个生理小种的材料2份。并应用SSR标记技术对62份种质资源进行了遗传多样性分析, 50对SSR引物中筛选出11对多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物, 共扩增出94条谱带, 平均每个引物扩增出8.55条带, 多态性条带比例达63.94%, 遗传相似系数在0~1之间, 表现出丰富的遗传多态性, 可将番茄野生种和栽培种分开, 反映了种间的遗传差异。 相似文献
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SSR和SNP在畜禽育种中的应用进展 总被引:1,自引:0,他引:1
本文简要综述了国内外近两年微卫星标记(SSR)和单核苷酸多态标记(SNP)在动物育种研究包括遗传多样性、品种鉴定及血缘分析、遗传图谱构建、标记辅助选择中的应用进展,以期为我国畜禽分子育种的深入发展提供借鉴。其中遗传多样性的研究主要是利用SSR,我国对各种畜禽大部分品种群体遗传结构的研究已经趋于完成,这有利于更好的保护和利用我国固有的品种资源。国际上已经对猪、牛构建了标记密度较大的遗传图谱,在这些标记中,SSR占了绝大多数,其中鸭和马的遗传图谱构建在最近取得了较大进展。目前畜禽的QTL定位使用的标记主要为SSR。对候选基因的研究已经趋向于SNP的关联研究,许多新的候选基因被发现与畜禽的某些经济性状相关。 相似文献
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选用晋大62×诱处4号杂交亲本和后代群体为试验材料,通过微卫星(SSR)标记分析,利用SPSS软件对其进行了聚类分析,探讨了亲本及后代群体间的遗传特性和亲缘关系,研究了大豆群体的遗传多样性,为大豆杂交育种亲本的选配、杂交后代的筛选、种质创新及大豆遗传多样性研究提供了理论和实践依据。结果表明,以亲本的基因组DNA为模板,选用40对不同的引物进行电泳共筛选出23对位于多条染色体上的差异引物,其多态性比例为55.0%。通过聚类分析所有材料可聚类为以下几类:母本晋大62(CK1)和后代6~13号材料聚为第一大类,父本诱处4号(CK2)和后代25~31号材料聚为第二大类,而1~5、14~20聚为第一小类,21~24、32~35聚为第二小类,这两小类材料与亲本的亲缘关系较远。 相似文献
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选用2个叶面积大的黄瓜品种(D9320、D2005)和2个叶面积小的黄瓜品种(D0455、D0401)配制杂交组合,筛选叶面积差异较大的亲本组合D0401×D9320构建F2分离群体,采用加性-显性(AD)模型进行遗传分析。结果表明:黄瓜叶面积是由多基因控制的数量性状,以显性效应为主,存在一定的加性效应,狭义遗传力和广义遗传力较高。采用SSR分子标记构建遗传连锁图谱,利用复合区间法对黄瓜叶面积进行QTL定位。结果表明:CSWACC03、CSWCT05BZ和CSCTTT15a位于同一个连锁群上,连锁群总长度为68.3 cM;检测出1个与黄瓜叶面积有关的QTL,与最近标记的距离为3.6 cM,且变异贡献率为8.65 %。 相似文献