犬细小病毒新乡株的分离鉴定及其VP2 基因的序列分析          下载免费PDF全文

徐彦召  申月华  董亚楠  钟秋月  宋会帅  谈晓梅  安志兴  王青 《广东农业科学》2023,50(10):174-180

【目的】探究河南省新乡地区犬细小病毒（Canine parvovirus，CPV）的流行和遗传变异进化情况，为有效防控区域性 CPV 流行提供参考。【方法】对从新乡地区宠物医院收集的 23 份疑似患犬细小病毒病的病犬粪便样品和眼、鼻、口、肛拭子预处理后进行 PCR 检测。将 PCR 检测结果为阳性的样品采用浸泡、过滤除菌处理后接种于单层猫肾细胞 CRFK 进行病毒增殖培养，将分离的病毒置于透射电子显微镜下观察。参考 GenBank中已收录的国内外 CPV 不同亚型的毒株序列，经 PCR 分段扩增、测序后拼接获得病毒全长基因，利用分子生物学软件对病毒基因进行序列分析和氨基酸序列同源性分析。【结果】从送检的样品中成功分离出 1 株 CPV，命名为 XX-2022 株。该病毒株能使 CRFK 细胞产生明显病变，导致细胞出现变圆、拉网和脱落。通过透射电镜可观察到典型的病毒粒子，呈圆形或六边形，直径约 25 nm，无囊膜。通过 PCR 分段扩增拼接后获得的病毒全基因组序列全为长 4 588 bp，CPV 系统进化分析结果显示，XX-2022 株与 Canine/SH/1/2019（MN840830.1）株的亲缘关系较近。利用 MegAlign 软件对 XX-2022 株 VP2 基因推导的氨基酸序列进行分析，该毒株与 YANJI-5（MW715601）的 VP2 氨基酸序列在同一小分支，氨基酸同源性为 99.7%。根据 CPV 的基因分型原则，最终确定 XX-2022 株 CPV 属于 CPV-2a 型。【结论】从临床病料中成功分离出 1 株 CPV，经分析确定为 CPV-2a 型，研究结果可为新乡地区 CPV 的流行病学、致病性及生物学特性研究提供依据，为 CPV 的区域流行及有效防控提供参考，为新疫苗的研发提供地方种毒。  相似文献   

基于rDNA ITS1基因序列的贵州山香圆平背粉虱遗传分化分析     

孟泽洪  王威锐  罗林丽  李帅  张金峰  万圆虹  蒲运丹  周玉锋 《贵州农业科学》2023,(12):59-65

【目的】探明茶树害虫山香圆平背粉虱不同地理种群的遗传多样性，掌握其遗传分化现状，为其科学防治提供依据。【方法】基于贵州茶园山香圆平背粉虱10个地理种群的rDNA ITS1基因序列片段，采用MEGA-X、DnaSP 5.10、Arlequin 3.5.2.2及SAMOVA 2.0等研究其种群遗传分化、基因交流、分子变异及种群遗传多样性。【结果】贵州茶园山香圆平背粉虱10个地理种群的rDNA ITS1基因序列共获得68条基因序列片段，其序列长度为434 bp,包含保守位点306个，变异位点78个，简约信息位点48个，其中9个位点发生转换，9个位点发生颠换，具有明显的G+C偏倚性；其共定义47个单倍型，包括5个共享单倍型和42个独享单倍型；总群体遗传多样性较高，表现出高单倍型多样性(H_d=0.968)和高核苷酸多样性(P_i=0.036 28);总群体遗传分化程度高(F_st=0.724 60),基因交流水平低(N_m=0.10);遗传变异主要来自组间(F_ct=0.646 20);单倍型系...  相似文献   

青岛地区3株犬细小病毒全基因组分析     

原昆鹏  曲雪婷  孙军昌  王旭  齐昊南  陈淑贞  王冬冬  尹月  臧立钰  衣玉颖  刘均华  尹燕博  温建新 《中国兽医杂志》2023,(2):1-6

为了探明青岛地区免疫过犬细小病毒(CPV)疫苗的犬因犬细小病毒感染死亡的原因，本研究采用全基因序列测定、系统进化树构建、基因分型和氨基酸分析的方法，对从临床发病犬中分离的3株CPV进行分析。结果显示，本实验室于2012年和2015年分离到的2株病毒(CPV-QD12和CPV-QD15)为new CPV-2a型，本研究分离到的1株病毒(CPV-QD20)为CPV-2c型；3株CPV在VP2的第5、267、297、324、370、426、440位氨基酸，NS1的第60、544、545、572、624、630位氨基酸发生了非同义替代。目前广泛使用的进口CPV弱毒活疫苗的基因型为原始的CPV-2型，与CPV流行毒株的基因型存在差异，这可能是造成CPV临床免疫失败的重要原因。因此，为了提升CPV疫苗的保护效率，建议使用CPV流行毒株研发CPV疫苗。  相似文献   

香蕉枯萎病菌1号和4号生理小种内切多聚半乳糖醛酸酶基因的比较     

曾蕊  王莉  范煜  周而勋 《中国南方果树》2023,(2):84-88

通过基因克隆和测序方法，对来自国内外尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f. sp.cubense(简称Foc) 1号和4号小种的6个菌株endo-PG基因同源性、与其他真菌的亲缘关系以及endo-PG基因和氨基酸序列进行分析，为香蕉枯萎病菌致病机制的研究奠定基础。结果表明，同小种的endo-PG序列同源性高，亲缘关系近，不同小种的同源性较低，亲缘关系较远；总体来说，4号小种比1号小种同源性更高，亲缘关系更近。在全基因序列分析中，没有发现明显的基因差异可以作为区分2个小种致病性差异的依据。根据预测的CDS序列翻译成氨基酸序列比对，发现6个菌株的endo-PG基因编码的氨基酸变异并没有引起相关保守结构域的变化，推测6个菌株的致病性可能与endo-PG基因的调控相关。  相似文献