奶牛附红细胞体16S rRNA基因的克隆、测序及系统发育进化树的建立     

陈明  黄维义  张为宇  李莉萍  韦家周  周春明 《黑龙江畜牧兽医》2006,(3):8-10

为了从分子水平上证实奶牛附红细胞体的存在及研究其分类学地位,利用原核生物16S rRNA基因通用引物对分离纯化的疑似奶牛附红细胞体进行16S rRNA基因的PCR扩增及克隆测序。结果扩增出长约1.5 kb的目的片段,测序结果表明:目的片段长度为1 439 bp,其核苷酸序列与国外已发表的牛温氏附红细胞体(E.wenyoni)的16SrRNA基因片段同源性高达97.1%,暂称为中国广西株(E.wenyoniCGX)。系统发育进化树显示:E.wenyoni和其他血营养菌在系统进化关系上组成了一个大的进化分支,与支原体科、支原体属的病原最接近(75%),而与立克次体科的病原较远(55%)。分析结果支持了Nei mark等和Messick等提出的将这类血营养菌划归支原体科、支原体属的建议。  相似文献   

玉米BEL1-like基因家族的鉴定、表达和调控分析     

曹征  李曼菲  孙伟  张丹  张祖新 《作物学报》2015,41(11):1632-1639

BEL1-like(BELL)家族蛋白是植物中普遍存在的一类具有同源异型结构域的转录因子。拟南芥中BELL家族蛋白能与KNOTTED1-like蛋白互作形成异源二聚体,并结合到特异顺式作用元件来调控基因的表达,从而影响植物生长发育进程。本文采用隐马可夫(HMM)模型,在玉米基因组中鉴定到15个BELL家族基因(Zm BELL),分布于7条玉米染色体。通过与拟南芥BELL基因的序列比较将这些基因分为两大类。在玉米8种组织中Zm BELL有不同的表达模式,具有明显的组织表达特异性。基于基因共表达分析及BELL-like蛋白特异结合的顺式元件分析,预测到86个可能受Zm BELL调控的下游靶标基因。这86个基因和12个Zm BELL表达模式相同,并且在基因启动子区存在与BEL1-like蛋白结合的顺式元件。这些结果为进一步解析玉米BELL家族基因的功能和作用机制积累了有价值的资料。  相似文献   

胨冻样芽孢杆菌(Bacillus mucilaginosus YNUCC0001)絮凝剂生产、絮凝特性及其系统发育学分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

李文鹏  刘士清  廖昌珑 《土壤通报》2005,36(4):583-587

对BacillusmucilaginosusYNUCC000116SrDNA的1481bp片段与GenBank中最相似的16个分类单位进行了比较。UPGMA,NJ,ME和MP方法构建的系统发育树显示B.mucilaginosusYNUCC0001与B.mucilaginosusHSCC1605T、B.mucilaginosus1480D及Paenibacillussp.NBT形成一个单系群分支。在50L全自动发酵罐中30℃发酵52h后,菌株YNUCC0001产生的胞外生物多聚絮凝剂(EBF)达到最大产率(粘度:3420C.P.)。在pH4.0、用量为0.25mlL-1的条件下,这种EBF对高岭土悬浊液的絮凝活性最大(99.8%);121℃高压灭菌60min后絮凝活性维持在98.6%。Hg2+,Ca2+,Mg2+,K+,Zn2+对其絮凝活性有促进作用,而Fe3+、Al3+、EDTA和Cu2+则有强烈抑制。  相似文献   

红酵母系统发育及番茄红素的测定     

赵山山  石楠  张利平 《安徽农业科学》2008,36(12):4955-4957

[目的]介绍了红酵母分离纯化的方法,菌株系统发育分析及发酵产物番茄红素的测定。[方法]从土壤及落花样品中分离纯化出7株红酵母,对其进行18S rDNA序列分析,并用高效液相色谱法对7株野生菌株的胞内色素产物进行了初步分析鉴定。[结果]18SrDNA序列分析可初步鉴定这7株菌分别属于红冬孢酵母菌属和红酵母属。用高效液相色谱测定7株菌种胞内抽提物中的番茄红素含量,发现仅有菌株06944的胞内抽提物中含有番茄红素。将菌株06944发酵产番茄红素的HPLC图谱与番茄红素标准品的对比,可初步鉴定所筛出的菌株06944产番茄红素,产量为2.96μg/ml。[结论]菌株06944为红冬孢酵母属,无致病性,可直接作为工业生产菌种。  相似文献   

毛壳属(Chaetomium Kunze)真菌的分类研究     

郭云忠  孙广宇  李振岐  高保卫 《西北林学院学报》2005,20(1):132-136

综述了毛壳属(Chaetomium kunze)真菌自建立以来的发展历史和当前研究现状，论述了该属的分类特征，分析了当前毛壳菌分类存在的问题，并提出了解决方法。  相似文献   

小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白基因片段序列分析     

张荣  崔晓艳  孙广宇 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》2006,34(11):194-198

采用nested-PCR技术对小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白基因片段进行扩增,并对扩增片段进行了序列测定及分析。结果表明,nested-PCR扩增得到约1.2kb的特异片段,经核苷酸序列测定获得小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白基因序列(1136bp);小麦蓝矮病植原体(WBD)与16Sr组中的各亚组代表植原体亲缘关系均达到96%以上,其中与三叶草变叶病植原体(CPh株系)亲缘关系最近,核苷酸同源性为99.7%,归为翠菊植原体(CandidatusPhytoplasmaasteris)16Sr-C亚组,该结果与以前报道的利用16SrDNA的分组结果一致,从亚组水平上进一步确定了小麦蓝矮病植原体的分类地位。  相似文献   

蝽科Strachia属群的系统发育分析(半翅目)     

徐志强 《中国农业大学学报》1993,(Z1):71-81

作者对Strachiini 族中Strachia 属群的6个属级单元的代表种做了形态学研究,选取了外部形态特征以及雌、雄外生殖器以及雌性受精囊等方面的20项形态特征,运用PAUP程序进行支序分析,得出该属群的属级关系支序图.同时对Strachia 属群的系统发育及一些雌、雄外生殖器特征的演化趋势作了讨论.  相似文献   

中国叩甲科昆虫12亚科的支序分类研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

江世宏  卓晨雷 《华中农业大学学报》2001,20(4):329-332

选取中国叩甲科昆虫12亚科间的13个特征，经量化处理并判定特征的极化方向后得到数据矩阵，再利用计算机支序分类软件PAUP4．0进行数据处理，得出中国叩甲科昆虫12亚科的谱系图。研究结果表明：叩甲科可明显地划分为3个自然类群，它们的亲缘关系可表示为（7，8），（（2，4）3）9），（（（11，12）10）5（1，6）），其中齿胸叩甲亚科（7）与露唇叩甲亚科（8），槽缝叩甲亚科（2）与萤叩甲亚科（4），小叩甲亚科（11）与心盾叩甲亚科（12），尖鞘叩甲亚科（1）与异角叩甲亚科（6）是4对姊妹群，每对姊妹群中的2个亚科间亲缘关系最近；单叶叩甲亚科（3）和叩甲亚科（9）与第2对姊妹群（2，4），梳爪叩甲亚科（10）与第3对姊妹群（11，12），胖叩甲亚(5)与第4对姊妹群（1，6）亲缘关系较近；齿胸叩甲亚科（7）与露唇叩甲亚科（8）是最原始的1对姊妹群，小叩甲亚科（11）与心盾叩甲亚科（12）是最进化的1对姊妹群。  相似文献   

鲢鳙打印病豚鼠气单胞菌主要特性及系统发育学分析     

chencuizhen@.com 《勤云标准版测试》2006,(5)

对从鲢(Hypophthalmichthysmolitrix)鳙(Aristichthysnobilis)打印病病死鱼中分离到的豚鼠气单胞菌(Aeromonascaviae),进行了形态与理化特性等方面较系统的表观分类学指征鉴定。同时择代表菌株(HC960704-1)进行了16SrRNA基因的分子鉴定,测定了16SrRNA基因序列、分析了相关细菌相应序列的同源性,构建了系统发生树;HC960704-1的16SrRNA基因序列长度为1416bp(GenBank登录号:AY966888),与GenBank数据库中的气单胞菌16SrRNA基因序列的相似性在98%和100%。  相似文献   

杨树分派的分子系统学与派间杂交研究进展   总被引：2，自引：0，他引：2  

张金凤  朱之悌 《安徽农学通报》2007,13(1):48-51

杨树是主要的工业用材树种和生物模式树种,具有重要的实用和理论研究价值.但杨树种内变异丰富,种间杂种较多,形态学系统分类很困难.分子生物学为杨树的系统分类研究提供了新的研究途径.杨树分子系统学研究为杨树种间和派间杂交奠定了较好的理论基础.本文概述了同工酶和DNA分子标记在杨树系统学研究中的应用和杨属内黑杨派与青杨派杂交、白杨派、胡杨派各自与其它派间杂交的研究进展,讨论了杨树系统学研究与派间杂交的关系和杨树派间杂交存在的问题,并对今后的研究提出了建议.  相似文献