Development of a DNA microarray for species identification of quarantine aphids     

Won Sun Lee  Hwalran Choi  JinSeok Kang  Ji‐Hoon Kim  Si Hyeock Lee  Seunghwan Lee  Seung Yong Hwang 《Pest management science》2013,69(12):1399-1406

  相似文献   

国际生命条形码计划—DNA Barcoding   总被引：3，自引：0，他引：3  

程佳月  王丽华  彭克美  张宁波  唐中林  杨述林  李奎 《中国畜牧兽医》2009,36(8):49-53

中国拥有数目庞大、种类繁多的动植物,也有很多珍贵、濒危生物,这些更是异常宝贵的科学资源。DNA条形码技术的出现可以更好的帮助鉴别这些物种,了解其分支来源,甚至可以预知其进化方向。笔者简述了DNA条形码的技术原理与操作步骤及这项技术的产生与发展情况;简要列出了DNA条形码发展过程中的重要进步与研究相对集中的物种;概述了DNA条形码的应用途径及目前DNA条形码研究中存在的主要问题、矛盾、研究思路与发展方向,并对其发展前景做出展望。  相似文献   

毛乌素沙地切叶蜂科8种类COI基因序列比较分析     

胡红岩  陈欢  徐环李 《中国农业大学学报》2012,17(3):22-27

采用PCR扩增和序列测定技术,对内蒙古毛乌素沙地切叶蜂科的8种野生蜂线粒体DNA细胞色素氧化酶Ⅰ(COI)基因片段进行了研究。结果表明:扩增得到658bp的基因片段长度,碱基组成的A+T为75.8%,含量显著高于G+C(24.2%)含量。共检测到203个变异位点,占总位点的30.9%。变异位点转化数明显少于巅换数,巅换主要以A-T之间为主。采用邻接法(NJ)、最大似然法(MP)和UPGMA法构建系统进化树,结果显示:海切叶蜂Megachile maritima和大和切叶蜂M.japonica亲缘关系最近;北方切叶蜂M.manchuriana、双斑切叶蜂M.leachella和凹足切叶蜂Megachile sp.聚为一类;戎拟孔蜂Hoplitis princeps和花黄斑蜂Anthidiumflorentinum与其他6个种间的遗传差异最大,亲缘关系最远。研究结果与传统分类一致,对利用COI序列建立快速、准确野生蜂的分子鉴定具有一定参考价值。  相似文献   

Contrasting mitochondrial DNA diversity estimates in Austrian Scutovertex minutus and S. sculptus (Acari, Oribatida, Brachypylina, Scutoverticidae)     

Sylvia Schäffer 《Pedobiologia》2010,53(3):203-211

Important insights into the evolutionary and demographic history of species can be obtained from inter-specific comparisons of patterns and from determing the degree of genetic diversity. Analysis of sequences of the mitochondrial cytochrome oxidase I (COI) gene revealed remarkable differences in mtDNA diversity estimates and the distribution of mitochondrial lineages between the two closely related oribatid mite species Scutovertex sculptus and S. minutus in Austria. Divergence time estimates revealed an age of approximately 48-74 Myr for the split between the two Scutovertex species and age estimates of about 2-3 and 8-12 Myr for the most recent common ancestors of Austrian S. minutus and S. sculptus, respectively. Genetic diversity was considerably lower in S. minutus than in S. sculptus. A clear geographic sub-division into samples originating from north and south of the Central Alps became evident in S. minutus, whereas no phylogeographic structure was found in S. sculptus. Together with a high genetic diversity this is suggestive of a panmictic population and exceptional dispersal ability, most probably facilitated by phoresy on birds. The lack of sub-structure with regard to habitat types in S. sculptus suggests that this species can cope with a wide range of environmental conditions.  相似文献   

基于DNA条形码的广西苦瓜中实蝇幼虫分子鉴定研究*   总被引：2，自引：0，他引：2  

姜帆  刘佳琪  李志红  吴佳教  赵朔 《植物保护》2011,37(4):150-153

实蝇是多种热带、亚热带水果和蔬菜的重要害虫,其卵、幼虫、蛹难以通过形态特征进行种类鉴定。DNA条形码是近年来出现的物种分子鉴定技术,能够实现对昆虫非成熟虫态的快速鉴定。本研究利用DNA条形码技术和BOLD系统,选取线粒体DNA细胞色素氧化酶I（COI）基因片段,针对采自于广西南宁地区苦瓜中的实蝇幼虫样品进行了序列测定、比对和分析。结果显示,在所检测的10头实蝇幼虫样品中,有4头为瓜实蝇［Bactrocera cucurbitae (Coquillett)］、6头为南亚果实蝇［Bactrocera tau (Walker)］。  相似文献   

实时荧光PCR快速检测苹果蠹蛾     

白桦  魏晓棠  梁炜  尼秀媚  张京宣  宋涛 《植物检疫》2011,(2)

苹果蠹蛾(Cydia pomonella L.)是重要的国际检疫性害虫。本文根据苹果蠹蛾线粒体COI基因序列设计引物和探针,对苹果蠹蛾及其相似种进行实时荧光PCR检测,结果表明,不同虫态的苹果蠹蛾均能够与近似种类区分开来。该技术可快速准确地鉴定苹果蠹蛾,为检疫性害虫苹果蠹蛾的检疫提供了一种新的方法。  相似文献   

火蚁属部分种类DNA条码技术研究初探     

陈岩  张秋娥  宋曼殳 《植物检疫》2011,(5)

选取火蚁属(Solenopsis)部分重要种类——红火蚁、黑火蚁、热带火蚁与巴西火蚁等22个种群为研究对象,以COI基因片段作为分子标记,扩增了部分种类的目标片段。结合GenBank上发表的火蚁属种类的序列信息,应用序列比对与构建系统树等生物系统学的研究方法,重建了火蚁属部分种类的系统发育关系。邻接系统发育树(Neighbor-Joining tree)分析结果表明,COI基因片段适合作为火蚁属种类鉴定的条码基因。  相似文献   

三个群体罗氏沼虾线粒体COI基因的遗传多样性分析   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

杨学明  郭亚芬  蒋钦杨  陈福艳  梁万文  蒋和生 《上海海洋大学学报》2006,(2):144-149

运用PCR方法,扩增罗氏沼虾缅甸原种F1代、广西选育群体和江苏养殖群体的线粒体DNA上的细胞色素氧化酶(Cytochrome oxidase subunit I,COI)基因,在此基础上选用10种限制性内切酶对扩增产物进行限制性片段长度多态(RFLP)分析。三个群体共发现2个多态位点,11种酶切图谱,3种基因型。三群体的多态座位比例、平均杂合度和基因型多样性指数分别为:缅甸原种F122.2%、0.0556、0.0472,广西选育群体22.2%、0.0400、0.0398,江苏养殖群体11.1%、0.0106和0.0083,群体间遗传差异未见显著。根据群体间遗传距离构建UPGMA聚类关系图,显示广西选育群体和江苏养殖群体间的遗传关系较近,而与原种F1群体的遗传关系较远。  相似文献   

拟南芥COI 1互作基因的分离   总被引：1，自引：1，他引：1  

戴良英  李栒  罗宽 《湖南农业大学学报(自然科学版)》2002,28(5):359-363

为进一步阐明茉莉素调控植物生长发育的分子机理，为作物抗性和雄性不育基因工程提供新思路，以COI1为诱饵，利用酵母双杂交分析体系筛选拟南芥cDNA文库，得到300多个阳性克隆，经PCR，RsaⅠ酶切PCR产物以后归为12群，从代表菌落提取pB42AD cDNA重组质粒进行了测序，完成了序列分析，得到ASK1，COAP2，COAP3，COAP4等12个基因，其中ASK1，COAP2，COAP3等基因与Skp1等重要基因有较高的同源性。  相似文献   

Molecular systematics of bisexual Artemia populations     

Lin Hou  Xiangdong Bi  Xiangyang Zou  Chongbo He  Lei Yang  Ruozhu Qu  & Zhanjiang Liu 《Aquaculture Research》2006,37(7):671-680

To help resolve phylogenetic relationships among bisexual Artemia populations, phylogenetic analysis was conducted using DNA sequences from the nuclear DNA internal transcribed spacer 1 (ITS‐1) and portions of the mitochondrial genome corresponding to the cytochrome oxidase I (COI). DNA sequences were generated for nine bisexual Artemia populations living in different regions of the world. Phylogenetic trees based on ITS‐1 and COI sequences indicated that bisexual Artemia populations consist of four groups. The bisexual Artemia populations from Tibet and Kazakstan always clustered with Artemia urmiana in the same group; there is small sequence divergence and genetic distance among them. Therefore, we deduced that bisexual Artemia populations from Tibet and Kazakstan may belong to the A. urmiana group. Our study did not support that bisexual Artemia populations from Tibet are a new, separate species A. tibetiana. We also found that A. sinica and A. urmiana have a small genetic distance. Based upon these findings, we conclude that A. urmiana may have played an important role in the evolution of A. sinica.  相似文献