肺炎克雷伯氏菌强毒株的分离鉴定及16-23SrRNAITS序列分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

李富祥  李华春  赵德宏  王娟  姚俊  廖德芳  熊和丽  宋建领  胡骑 《中国畜牧兽医》2015,42(2):352-357

为确诊疑似仔猪肺炎克雷伯氏菌(K.pneumonia)感染,并研究其病原的致病性、耐药性、16-23SrRNA ITS系统进化特征,本研究从云南因肺炎、腹泻而大量死亡的仔猪中分离到1株革兰氏阴性短粗杆菌,命名为KP14013,对其进行生化鉴定、16SrRNA鉴定,研究其对小白鼠和仔猪的致病性,并对其16-23SrRNA ITS基因进行测序和遗传进化分析。结果显示,KP14013分离株生化特征与肺炎克雷伯氏菌相符,其16SrRNA与GenBank中23株肺炎克雷伯氏菌代表株之间的同源性均为99%,将KP14013鉴定为肺炎克雷伯氏菌。KP14013对小白鼠半数致死量(LD50)为3×101.8 CFU,腹腔注射3×108 CFU可使仔猪100%致死。16-23SrRNA ITS系统进化关系结果表明,KP14013与GenBank中收录的15株肺炎克雷伯氏菌形成进化树的一个分支,属于同一个亚群,它们之间的核苷酸同源性为98.4%~99.2%。本研究证实了肺炎克雷伯氏菌是该起仔猪腹泻大量死亡的病原;KP14013分离株为毒力极强菌株,具有多重耐药性,其16-23SrRNA ITS与GenBank中收录的肺炎克雷伯氏菌代表株之间核苷酸存在差异,可用于肺炎克雷伯氏菌菌株间的鉴别。  相似文献   

陕西榆林山药根腐病病原菌的分离与鉴定     

陈玉涵  马心瑶  田夏夏  赵杰 《西北农业学报》2022,(11):1521-1534

旨在明确引起陕西省榆林市山药根腐病的致病菌,为该地区山药根腐病的防治提供参考。以受害山药块茎和根际土壤为试验材料,通过组织分离法获得纯培养,结合柯赫氏法则、形态学鉴定、ITS区序列分子生物学鉴定,以及构建系统发育树和序列比对的方法,明确山药根腐病的致病菌。结果表明,引起陕西榆林山药根腐病的病原菌为棕黑腐质霉、燕麦镰孢和尖孢镰孢。陕西榆林山药根腐病由腐质霉属和镰孢属两个属的3种病原菌引起,棕黑腐质霉是首次报道危害山药,镰孢属真菌是该地区山药根腐病的主要致病菌。  相似文献   

广东花生果腐病病原菌鉴定及药剂筛选试验     

邢珏珺  许毓钊  苏钰彤  魏欣莹  江海琪  喻国辉  尹艳 《广东农业科学》2022,49(8):73-80

【目的】鉴定广东花生果腐病病原菌类型并筛选有效的杀菌剂种类,为生产上防控该病害提供参 考。【方法】采用组织分离法从大田采集的患病花生果荚中分离获得果腐病的真菌纯培养物,回接验证分离菌 株的致病性后确认其病原,通过克隆菌株的 ITS 序列并进行系统发育分析鉴定病原菌种类。采用菌丝生长速率 法测定 40% 福美双水悬浮剂、98% 噁霉灵可溶性粉剂、24% 井冈霉素 A 水剂、10% 苯醚甲环唑水分散粒剂和 10% 多抗霉素可湿性粉剂对该病原菌的抑菌效果。【结果】 从韶关采集的花生果腐病样本中分离获得 2 株病原 真菌,回接后均可以引起花生果荚腐烂,严重时导致果仁腐烂。基于菌株 ITS 序列的系统发育分析显示病原菌 为尖孢镰刀菌（Fusarium oxyspourm）和茄病镰刀菌（Fusarium solani）。供试杀菌剂中 40% 福美双悬浮剂对 2 种病原真菌的抑菌效果最好,EC50 分别为 0.001 mg/L 和 0.021 mg/L,其次是噁霉灵,EC50 分别为 0.296 mg/L 和 0.217 mg/L,井冈霉素 A 的 EC50 分别为 20.575 mg/L 和 11.185 mg/L,苯醚甲环唑和多抗霉素对 2 株病原真菌没有抑菌 效果。【结论】广东韶关地区花生果腐病主要由镰刀菌复合感染引起,以茄病镰刀菌为主,病原菌对福美双和 噁霉灵敏感,生产上可以考虑使用这两种杀菌剂防控。  相似文献   

Molecular and morphological characterization of stunt nematodes of wheat,maize, and rice in the savannahs of northern Nigeria          下载免费PDF全文

Sulaiman ABDULSALAM  PENG Huan  LIU Shi-ming  HUANG Wen-kun  KONG Ling-an  PENG De-liang 《农业科学学报》2022,21(2):586-595

Stunt nematodes (Tylenchorhynchus spp.) are obligate migratory root ecto-parasitic nematodes found in the fields of many cultivated crops. These nematodes, with phyto-sanitary potential, are frequently ignored or misdiagnosed as pests, and this may pose a threat to food security. The accuracy of its identification based on a morphological approach has been challenged recently, due to the overlapping of the morphological and morphometric characters of the species. Consequently, the objective of this study is to identify and characterize stunt nematodes present in 54 fields cultivated with cereal crops (wheat, maize and rice) in the savannahs of northern Nigeria, using integrative taxonomy and molecular approaches. The molecular and morphological studies identified and confirmed the presence of T. annulatus as the occurring specie in the savannahs of northern Nigeria. The phylogenetic analysis was carried out using the internal transcribed spacer (ITS) and 28S genes of ribosomal DNA further confirmed the presence of T. annulatus. The first molecular characterization and sequences of the ITS and 28S rDNA gene for T. annulatus from Nigeria were provided by this research. Also, according to our literature search, this is the first report on T. annulatus in wheat, maize and rice in the savannahs of northern Nigeria. Further study to test the pathogenicity of the parasitic nematode species found in this survey is recommended for the prioritization and development of efficient management strategies.  相似文献   

锦香草及其近缘种的亲缘关系ITS序列分析     

陆彭城  张文春  陈建芳  黄学敏  叶菁  彭东辉 《浙江农业学报》2021,33(8):1436

为厘清锦香草及其近缘种的亲缘关系,为其杂交育种提供数据基础,收集我国锦香草及其近缘种短毛熊巴掌与长柄熊巴掌等样品46份,对供试样品核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列进行分析,并构建系统进化树,对其系统发育关系进行研究。结果表明:供试材料的ITS1、ITS2和5.8S的序列长度分别为246、230、160~161 bp;ITS1与ITS2序列存在变异位点426个,信息位点232个;5.8S序列存在202个变异位点,信息位点84个。根据ITS序列构建进化树:供试材料可分为2支,锦香草与短毛熊巴掌在进化树中聚为一支,分支内部互相嵌入;长柄熊巴掌单独聚成一支。以上结果显示,锦香草、短毛熊巴掌亲缘关系较近,它们与长柄熊巴掌亲缘关系较远,该结果支持《Flora of China》将短毛熊巴掌处理为锦香草的异名,长柄熊巴掌为独立种。  相似文献   

仿刺参3个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析     

姬南京  常亚青  高银雪  赵冲  宋坚 《大连海洋大学学报》2014,(5)

利用核糖体DNA第一内转录间隔区(Internal transcribed spacer 1, ITS1)序列,对中国大连(CD)、朝鲜罗津( KN)和俄罗斯海参崴( RV)仿刺参Apostichopus japonicus 3个群体的遗传结构进行分析。结果表明：经PCR扩增、克隆测序,获得长度为517~519 bp、524 bp两种类型的ITS1核苷酸序列,平均G+C含量(64.5%)显著高于A+T含量(35.5%);在仿刺参30个个体61条序列中共检测到49个变异位点,多态位点比例为9.33%,其中有4个简约信息位点,共有40种基因型,群体共享基因型为2个;遗传多样性分析表明,3个群体的遗传多样性丰富;分子方差分析显示,88.65%的变异来自于群体内部,群体间遗传分化较弱或中度分化;根据群体间遗传距离进行的聚类分析发现, KN群体与RV群体的亲缘关系较近, CD群体与KN、 RV群体的亲缘关系较远。  相似文献   

甘肃甘南野生羊肚菌rDNA的ITS序列分析     

王龙  秦鹏  王生荣  赵玉卉 《草原与草坪》2014,(6):41-44

根据形态学特征挑选了7株采自甘肃甘南境内的野生羊肚菌,应用rDNA-ITS序列进行了比对技术分析。结果表明,7株野生羊肚菌归属为4个种：粗柄羊肚菌Morchellav crassipes、羊肚菌M.esculenta、黑脉羊肚菌M.angusticeps和高羊肚菌M.elata。根据分子系统树发现,粗柄羊肚菌和羊肚菌属于黄羊肚菌类群,而黑脉羊肚菌和高羊肚菌属于黑羊肚菌类群。  相似文献   

南方红豆杉紫杉醇产生菌的分离与鉴定     

余响华  沈玉平  刘小文  张祖娇 《湖北农业科学》2014,53(19):4552-4555

从南方红豆杉(Taxus chinensis var.mairei)根部树皮内表皮中分离得到69株内生真菌,通过HPLC检测发酵液中紫杉醇含量,共获得7种紫杉醇产生菌,同时,通过形态学分析以及ITS序列分析确定分别属于链格孢属(Alternaria)、葡萄孢盘菌属(Botryotinia sp.)、刺盘孢属(Colletotrichum)、拟茎点霉属(Phomopsis)和枝孢菌(Cladosporium),其中链格孢属真菌紫杉醇产量最高,平均为271.54μg/L,是目前见诸报道的产量最高的链格孢菌,亦是从红豆杉根部树皮中筛选出的紫杉醇产量较高的野生菌株之一。该菌株的发现为紫杉醇高产菌的选育提供了又一优良的种质资源。  相似文献   

秤锤树叶片内生真菌的分离鉴定及其对植株生长的影响     

李霞  曹昆  丛伟 《广西农业生物科学》2010,(1):75-81

本研究从秤锤树叶片中分离内生菌进行分子鉴定,并接种到无菌组培苗中研究其对植株生长的影响。研究结果显示,从秤锤树叶片中共分离获得7株真菌。扩增出的6个菌株经ITS测序,在NCBI网站上进行基因序列比对,鉴定出其中5株菌株均属于球毛壳菌（Chaetomium globosum）,1株属于子囊菌（As-comycete）。进一步实验表明：分离的菌株多数对组培苗的株高生长影响不大,可初步鉴定其为内生菌,其中的属于球毛壳菌的F和H菌株对无菌苗的株高有明显的促进作用。  相似文献   

Discussion of Emergencies and Safety in Highway Transportation     

《保鲜与加工》2003,(9):126-129

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