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Onur Yilmaz Mehmet Kizilaslan Yunus Arzik Sedat Behrem Nezih Ata Orhan Karaca Cengiz Elmaci Ibrahim Cemal 《Zeitschrift für Tierzüchtung und Züchtungsbiologie》2022,139(1):26-39
Sheep are considered as a major contributor of global food security. Moreover, sheep preweaning growth traits as well as in vivo carcass composition traits such as ultrasonic measurements of Longissimus dorsi muscle depth (UMD) and back-fat thickness (UFD) are crucially important indicators of meat yield and hot carcass composition. Despite their relative importance for productivity and profitability of a sheep production system, detected QTL for these traits are quite scarce. Therefore, we implemented GWAS for these traits using animal mixed model-based association approach provided by GenABEL in Esme sheep. Three genome-wide and 14 individual chromosome-wide associated SNPs were discovered. As a result, ESRP1, LOC105613082, ZNF641, DUSP5, TEAD1, SMOX, PTPRT, RALYL, POM121C, PHIP, LOC101106051, ZIM3, PEG3, TRPC7, FBXL4, LOC105610397, LOC105616489 and DNAAF2 were suggested as candidates. Some of the discovered genes and involved pathways were already annotated to contribute growth and development in various species including human, mice and cattle. All in all, the results of this study are expected to strongly contribute to shed a light on the underlying molecular mechanisms behind growth and carcass composition traits, with potential implications on studies aiming faster genetic improvement, targeted low-resolution SNP panel designs and genome-editing studies. 相似文献
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为研究饲料中维生素K3含量对大口黑鲈消化能力、血清代谢指标、肌肉氨基酸和脂肪酸组成的影响,在基础饲料中分别添加不同水平的维生素K3,配制成维生素K3含量分别为0.78(K0组)、5.80(K5组)、10.82(K10组)、15.84(K15组)和20.85 mg/kg(K20组)的5种试验饲料,对初均重为(12.96±0.07)g健康大口黑鲈幼鱼进行为期8周的饲养试验。结果表明:添加维生素K3的各组胃和肠道的蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶活性均显著低于K0组(P<0.05)。K10组、K15组和K20组的表观消化率和蛋白质表观消化率显著低于K0组(P<0.05)。K20组的血清尿素氮含量显著高于其他4组(P<0.05),血清总蛋白、白蛋白、总胆固醇和甘油三酯含量在各组之间无显著差异(P>0.05)。肌肉必需氨基酸、非必需氨基酸和总氨基酸含量以及必需氨基酸指数在各组之间无显著差异(P>0.05),但是随着饲料中维生素K3含量的增加,必需氨基酸和总氨基酸含量呈增加的趋势。K15组的肌肉单不饱和脂肪酸含量显著高于其他4组(P<0.05),其中C16∶1n7和C18∶1n5含量均较其他组显著升高(P<0.05)。肌肉饱和脂肪酸和多不饱和脂肪酸含量在各组之间无显著差异(P>0.05)。综上可知,饲料中添加维生素K3可以改善大口黑鲈肌肉氨基酸组成,但当饲料中维生素K3含量≥5.80 mg/kg时会使大口黑鲈的消化能力下降,并且高剂量的维生素K3会改变大口黑鲈的蛋白质和脂质代谢。 相似文献
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【目的】基于网络药理学及分子对接技术研究黄芪调控仔猪肠道菌群失调性腹泻的有效活性成分及其作用机制。【方法】从TCMSP数据库搜集黄芪中药化合物成分,并获取其潜在靶点。利用GeneCards和OMIM数据库搜集肠道菌群失调性腹泻(flora imbalance diarrhea)的作用靶点,将两者预测的潜在作用靶点进行映射,获得共同作用靶点。运用STRING数据库构建靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)关系,用Cytoscape_3.8.0软件对其网络进行拓扑分析,用DAVID数据库对共同作用靶点进行富集分析,用AutoDuck_4.2.6软件对其核心成分与核心靶点进行分子对接。【结果】黄芪含有11个调控仔猪肠道菌群失调性腹泻核心成分,其对应靶点基因65个,疾病靶点854个,交集靶点25个。PPI网络中显示肿瘤坏死因子(TNF)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、白细胞介素-6(IL6)、NF-κB抑制剂α(NFKBIA)、IL1B、IL10、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、C-C基序趋化因子2(CCL2)为关键靶点。GO功能和KEGG通路富集分析发现,黄芪有效成分主要通过美国锥虫病、炎症性肠病、阿米巴病、细胞因子-细胞因子受体相互作用、A型流感、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路参与转录调控、免疫反应、细胞对脂多糖的反应等生物过程。分子对接结果显示,槲皮素、山奈酚、芒柄花素等核心成分与TNF、IL1B等关键靶点结合紧密,亲和力较好。【结论】黄芪可能通过槲皮素、山奈酚、芒柄花素等主要活性成分作用于TNF、IL1B等靶点,通过参与美国锥虫病、炎症性肠病、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路进而治疗仔猪肠道菌群失调性腹泻。 相似文献
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本研究对9个燕麦(Avena sativa)品种的主要农艺性状、种子产量和籽粒营养品质进行了比较,以期筛选出适宜在陇中黄土高原半干旱区生产利用的燕麦品种。结果表明:供试燕麦品种均属于中熟型,在当地均能成熟;9个燕麦农艺性状、种子产量及籽粒营养品质之间存在显著差异(P<0.05),‘迪燕1号’的株高和穗长最高,分别为150.00cm和30.50cm,但种子产量最低,为1734.20kg·hm-2,穗粒数和穗粒重均以‘魏都莜5号’最高,分别为128.4粒和2.84g,‘晋燕17号’的种子产量和淀粉含量最高,分别为2500.00kg·hm-2和53.68%,但粗蛋白含量最低,仅为15.95%,‘张莜8号’的千粒重最高,为28.20g,粗蛋白含量以‘张莜9号’最高,达18.75%,‘坝莜18号’的β-葡聚糖和粗脂肪含量最高,分别为4.37%和6.35%。应用灰色关联度理论方法对9个燕麦品种的主要农艺性状、种子产量与籽粒营养品质指标进行综合分析得出,‘晋燕17号’‘魏都莜5号’‘迪燕1号’综合性状较好,适宜在陇中黄土高原半干旱区种植及推广。 相似文献
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广东康禾自然保护区植物区系研究 总被引:1,自引:0,他引:1
根据对保护区的植被调查,分析了该保护区的植物区系、生活型谱和植被类型,结果显示该保护区植物区系组成以泛热带和热带亚洲成分最为丰富,各占30.5%和13.8%;生活型谱以高位芽植物占绝对优势,但比例略低于近纬度带的阴那山等地区;植被类型主要为亚热带常绿阔叶林,但因人为破坏较严重,现有植被主要为次生性较强的常绿阔叶林和针阔叶混交林。 相似文献
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对中国伊犁天山野果林表征植物的组成、特点及性质进行了系统的研究,探讨野果林的来源和发展,结果表明:野果林区系成分是多元的,各类成分在此相互渗透,分布区重叠,使野果林区系没有绝对的本地特色.其中温带成分占有最高的比例(33.33%);西伯利亚-天山过渡成分(17.54%)是野果林植物区系连接北方安加拉(西伯利亚)植物区系的桥梁;天山-沿喜马拉雅成分(10.53%)又把野果林与华夏植物区系紧密联系在一起;新疆的大部分地区过去曾是特提斯海(Tethys)的一部分,所以现代野果林植被仍保留有古地中海成分的残迹(5.25%);天山是新疆境内植物属种最为丰富的地区,天山成分在各分布区类型中的比值也最高(33.33%),尤其是东天山特有的成分,则代表着野果林的土著部分,这一成分无疑是本地发生的适生种.野果林的区系发生是多方面的,主要有安加拉成分、古北极成分、古地中海成分、华夏区系成分和新疆本土成分. 相似文献
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转基因植物对环境生态平衡的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
根据近年来国内外关于转基因植物的研究进展,结合维持生态平衡的3个主要因素,即物种组成、环境因素及信息系统,论述转基因植物对环境生态平衡的影响. 相似文献