不同鲚属鱼类Cyt b和D-loop序列的比较及其判别早期生活史个体的潜力分析          下载免费PDF全文

孙超  刘洪波  姜涛  轩中亚  杨健 《渔业科学进展》2018,39(5):27-35

使用mtDNA作为分子标记,基于1022 bp和1322 bp左右的部分序列分析刀鲚(Coilia nasus)、湖鲚(C.nasus taihuensis)、七丝鲚(C.grayii)及凤鲚(C.mystus)成鱼之间的遗传关系。结果显示,刀鲚和湖鲚间的遗传距离分别为0.0036±0.0008和0.0038±0.0008,凤鲚与刀鲚、湖鲚的遗传距离分别为0.1215±0.0111、0.1228±0.0111(Cyt b)和0.1075±0.0108、0.1067±0.0107(D-loop),七丝鲚与刀鲚、湖鲚的遗传距离分别为0.0342±0.0056、0.0351±0.0057(Cyt b)和0.0527±0.0069、0.0529±0.0070(D-loop),七丝鲚和凤鲚间的遗传距离分别为0.1158±0.0111和0.1123±0.0111。用Kimura双参数模型构建的2种序列的NJ分子系统树均显示,湖鲚和刀鲚不能形成独立的分支,而是混合聚在一起形成1个分支;七丝鲚和凤鲚则形成另外2个分支。首先根据采样点不同可初步断定未知仔幼鱼为刀鲚,稚鱼为湖鲚,而后对未知种仔幼鱼、稚鱼和刀、凤鲚鱼卵的2种序列的分析发现,不同采集点内部的这些早期生活个体间的遗传距离分别为0.0024~0.0032和0.0025~0.0082。在Kimura双参数模型构建的NJ分子系统树中,未知种仔幼鱼、稚鱼、刀鲚鱼卵与刀鲚、湖鲚聚为一类,凤鲚鱼卵与凤鲚聚为一支。由此可见,Cyt b基因序列和D-loop序列作为分子标记,虽然可以区分刀鲚、凤鲚以及七丝鲚的仔幼、稚鱼及鱼卵,但不能有效区分湖鲚和刀鲚的早期生活个体。  相似文献   

猪繁殖与呼吸综合征病毒云南株的分离鉴定     

《畜禽业》2011,(12)

<正>云南农业大学动物科学技术学院李富祥等用Marc145细胞从云南某猪场分离到两株猪繁殖与呼吸综合征病毒。PCR方法对NSP2基因进行扩增结果表明,分离株缺失了90个核苷酸。对分离株ORF5基因序列进行扩增和测序,进行同源性及遗传特性分析,结果表明,分离到的两株PRRSV位于进化树的同一个小分支上,其核苷酸同源性为  相似文献   

bta-miR-33b对牛前体脂肪细胞体外分化的抑制作用研究     

张文振  张松  王力 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》2020,48(4):1-9

  相似文献   

高致病性猪蓝耳病的流行特点、诊断与综合防制     

许豆艳  马贵贤  郭爱生  刘业勤 《畜禽业》2008,(1):30-31

<正>2006年夏,猪"高热病"首先在我国南方部分省、市发生,给养猪业造成了较大损失。2007年1月,国家农业部通过对分离到的病毒采用全基因序列分析等技术手段,最终确定变异猪蓝耳病病毒是猪"高热病"主要病原,并定名为高致病性猪蓝耳病。  相似文献   

1株奶牛源溶血性曼氏杆菌的分离鉴定与生物学特性研究     

陈昌胜  王丽扬  杨跃飞  王彦红  张信军  成大荣 《黑龙江畜牧兽医》2022,(16):76-81+136

为了对送检奶牛肺脏组织进行病原菌的分离鉴定并研究分离病原菌的生物学特性,试验采用细菌的分离纯化、革兰氏染色镜检、理化试验及16S rDNA序列分析对分离菌进行鉴定,并检测其血清型、多位点序列分型(MLST)、毒力基因、致病性和耐药性。结果表明：该菌株能发酵葡萄糖、乳糖和麦芽糖等,不发酵甘露糖;革兰氏染色镜检显示该菌呈红色的球杆状,为革兰氏阴性菌;16S rDNA序列分析结果显示该菌株为溶血性曼氏杆菌,命名为202102NF,为血清型1型;202102NF的7个管家基因adk、aroE、deoD、gapDH、gnd、mdh和zwf序列号分别为1,2,1,2,1,2,1,序列型为ST1;202102NF携带LKTA、GCP、POMA、NANH、ADHE、HF等多种毒力基因;小鼠腹腔注射202102NF 18 h内死亡,镜检可见攻毒组的小鼠肝脏和肾脏发生肿大、颜色加深,肺部出现出血斑,肠道有大量炎性渗出物;202102NF对诺氟沙星中介,对多黏菌素B、头孢噻肟、左氧氟沙星等17种抗菌药物均敏感。说明202102NF为血清型1型的溶血性曼氏杆菌,其序列型为ST1,携带多种毒力基因,具有较强的毒...  相似文献   

猪圆环病毒2b型病毒样颗粒表面可用于外源肽展示的位点分析     

李国攀  荣俊  谢明  匡红艳 《黑龙江畜牧兽医》2022,(17):12-18+140

为了分析猪圆环病毒2b型病毒样颗粒(virus-like particles of Porcine circovirus type 2b, PCV-2b VLPs)表面具有外源肽展示潜力的位点,试验通过PyMol软件分析了PCV-2b VLPs表面的位点分布,并以高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)Gp5的中和表位B(Epitope B, EpB)为外源肽,通过重叠PCR方法将表面位点替换为EpB,构建EpB嵌合的PCV-2b衣壳蛋白(Cap),利用原核表达系统诱导表达后进行凝胶层析纯化和Western-blot检测,并利用透射电子显微镜分析VLPs的组装状态。结果表明：在PCV-2b VLPs表面共筛选到8个可用于外源肽展示的位点,分别为S1(Y⁵⁰TIKRTTVKTP⁶⁰)、S2(L⁷⁵PPGGGSN⁸²)、S3(F¹²⁴VTKATAL¹³¹)、S4(V¹⁶¹LDSTIDY¹⁶⁸)、S5(Q  相似文献   

利用Cyt b基因序列研究翘嘴红鲌的系统发生     

黄丽英  丁诗华  张海琪  杜建明  何中央 《西南大学学报》2005,27(6)

线粒体细胞色素b基因序列分析可显示种间及种内遗传差异,广泛用于种类鉴定和系统发生研究.为了阐明翘嘴红鲐与其他鳊亚科鱼类的亲缘关系,扩增并测定了翘嘴红鲐的414 bp细胞色素b基因片段序列.所获序列与4种鳊亚科鱼类细胞色素b基因的相应序列进行比较,发现共有61个多态性核苷酸位点(14.73%),大多数位点出现在密码子的第3位且主要为碱基转换.翘嘴红鲐与鳊之间的序列同源性最高,为93.48%,与广东鲂、三角鲂和团头鲂的序列同源性则分剐为90.58%,90.82%,91.30%.以鲤为外群,分别利用MP法和NJ法分析上述序列数据,获得相似的系统发生树.该结果显示,翘嘴红鲐和鳊聚为1个支系,广东鲂、三角鲂以及团头鲂则聚为另1个支系,说明翘嘴红鲐与鳊的亲缘关系较近,而与广东鲂、三角鲂及团头鲂的亲缘关系则较远.  相似文献   

极低密度脂蛋白受体的研究     

刘厚森  唐胜球  董小英  邹晓庭 《安徽农业科学》2006,34(13):2984-2987

极低密度脂蛋白受体(VLDL-R)是一种存在细胞表面的、可识别多种配体的跨膜蛋白,是含有载脂蛋白E(ApoE)的脂蛋白颗粒的受体,在动物体内富含三酰甘油(TG)的脂蛋白的代谢中发挥重要作用。该受体在禽类机体内发挥着介导卵子发生发育的重要生理功能,在哺乳动物机体中主要是参与脂蛋白代谢,可能还有其他生理功能有待于进一步研究。就极低密度脂蛋白受体的分子结构、分布部位、生物学功能以及其基因序列作了简要综述。  相似文献   

杏树花芽分化期叶绿素含量·比叶重和叶绿素a/b的研究     

李利红  李先芳  马锋旺 《安徽农业科学》2006,34(19):4917-4918,4920

测定了杏树17个品种在7月份和9月份的叶绿素含量、比叶重变化和叶绿素a/b比值,结果表明,9月份大部分品种的叶绿素含量下降,比叶重和叶绿素a/b比值增加。3个指标的数值变化与品种的败育率之间没有关系。  相似文献   

蓝鳃太阳鱼与绿色太阳鱼细胞色素b（Cytb）基因序列片段分析     

李行先  冯晓宇谢楠许宝青  郭水荣 《杭州农业科技》2007,(5):10-12

用酚／氯仿提取法提取了蓝鳃太阳鱼、绿色太阳鱼肌肉组织的总DNA，利用特异引物进行PCR扩增，得到1119bpCyt b基因片段，纯化后送上海生工测序。所得序列用Mega3．1软件分析，并结合GenBank中其余9种太阳鲈属鱼类Cytb基因序列用NJ法构建太阳鲈属鱼类系统发育树。结果表明：（1）蓝鳃太阳鱼与绿色太阳鱼序列相似度为82．3％，变异位点198个，平均转换／颠换比为2．1；（2）蓝鳃太阳鱼与L．humilis亲缘关系较近，绿色太阳鱼与L．symmetricus亲缘关系较近，蓝鳃太阳鱼与绿色太阳鱼遗传距离为0．206。  相似文献