Proteomic analysis of the mango anthracnose pathogen Colletotrichum gloeosporioides treated with borate highlights distinct mitochondrial response mechanisms     

S. T. He  T. T. Chen  X. B. Xu  Z. K. Zhang  H. C. Song  H. M. Song  L. H. Meng  P. Zhou  X. Q. Shi 《Plant pathology》2019,68(7):1369-1380

  相似文献   

棉铃虫膨胀线粒体基因组的鉴定与分析     

张屾  谷少华  李显春 《植物保护》2019,45(1):135-141

以已公布的棉铃虫线粒体DNA序列对来自4头棉铃虫雄蛹的DNA的三代测序数据进行筛选,获得了11条与线粒体DNA有同源性的三代read序列,并根据其中的read 66003鉴定出了一种膨胀的线粒体基因组。该线粒体基因组大小为27 113 bp,其保守区域包含13个蛋白编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因以及1个AT富集区,与已公布的棉铃虫线粒体基因组的结构相似。膨胀区域位于cox1基因编码区内部,大小为11 467 bp,经预测含有一个完整的真核基因(依赖ATP的RNA解旋酶)以及多种转座元件的片段,但与线粒体DNA无同源性,也无I类或Ⅱ类内含子存在的证据。对田间和室内棉铃虫DNA样品的PCR扩增未能检测到膨胀线粒体基因组的存在。以上结果表明膨胀片段可能是细胞核DNA序列通过偶然的水平转移事件而整合到线粒体基因组中的,且该种膨胀方式的发生概率极低。本文报道的膨胀线粒体基因组为日后动物线粒体基因组学的研究提示了一种独特的变异方式。  相似文献   

红富士苹果芽变系DNA甲基化研究     

杜晓云  宋来庆  赵玲玲  刘美英  唐岩  孙燕霞  姜中武    束怀瑞 《园艺学报》2019,46(1):107-120

以35份富士苹果(Malus×domestica Borkh.‘Fuji’)芽变材料为试材,利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation Sensitive Amplified Polymorphism,MSAP)分析和UPGMA聚类方法,对其基因组甲基化修饰水平、变异模式以及表观遗传变异关系进行研究。结果表明:(1)不同富士系得到不同的MSAP扩增,总DNA甲基化水平27.90%～36.16%,平均32.87%,双链全甲基化为主要甲基化方式;(2)富士芽变材料绝大多数位点保持了原有甲基化模式;(3)绝大多数芽变(68.57%)检测到全部的甲基化变异模式(12种),去甲基化频率极显著高于甲基化频率(P <0.01),且CG去甲基化极显著高于CHG;(4)36份种质遗传相似系数平均值0.89(0.79～0.92),在聚类图上,富士原种分布在芽变系集中区外,新近发生的芽变系更倾向于聚在一起,着色系片红型和条红型芽变呈分散排布状态。总的来看,富士芽变的甲基化变异模式丰富,超甲基化和去甲基化相伴发生,但以去甲基化为主;‘富士’着色芽变与其最原始品种富士,以及芽变之间发生了较大表观遗传变异;片红和条红型芽变聚类未表现明显偏好性。本研究将为进一步开展富士着色系芽变机理研究提供指导,可以CG去甲基化为切入点展开深入研究。  相似文献   

CUDC-907 induces DNA damage and autophagy in glioma cells     

JIAO Peng  HUANG Zhen-zhou  ZHANG Xiao-jing  LONG Yan-jun  LI Zhao-jun  WANG Feng-ze 《园艺学报》2019,35(2):260-266

AIM:To investigate the effect of CUDC-907, a dual histone deacetylase (HDAC) and phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) inhibitor, on the DNA damage, cell cycle distribution and autophagy in human glioma U251 cells. METHODS:U251 cells were treated with CUDC-907 of different concentrations, and the cell viability was detected by MTT assay. The quantitative γ-H2AX foci were determined by laser scanning confocal microscopy. The cell cycle distribution of U251 cells was examined by flow cytometry. The protein expression was determined by Western blot analysis. RESULTS:CUDC-907 inhibited the cell viability and the phosphorylation of Akt and p70 ribosomal protein S6 kinase (p70s6K) in the U251 cells (P<0.05). In CUDC-907-treated cells, the number of γ-H2AX foci and protein expression of γ-H2AX were increased significantly (P<0.05). CUDC-907 also induced cell arrest in the G₂/M phase by up-regulating the expression of p21, and inhibiting the protein level of cyclin B1 and the phosphorylation of cell division cycle protein 2 (Cdc2). In addition, CUDC-907 triggered cell autophagy, and inhibition of autophagy increased CUDC-907-induced DNA damage of U251 cells. CONCLUSION:CUDC-907 significantly inhibits PI3K/Akt signaling pathway, induces DNA damage and arrests cell cycle in G₂/M phase. Blockage of autophagy promotes CUDC-907-induced DNA damage of U251 cells.  相似文献   

核桃叶片基因组DNA的4种提取方法比较   总被引：2，自引：0，他引：2  

韩继成  徐平  李春敏  陈湖  张新忠 《河北农业科学》2007,11(1):68-71

以核桃叶片为材料,比较了高盐低pH法、SDS法、改良CTAB法和适合酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法提取基因组DNA的效果;通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计、RAPD、ISSR等方法进行PCR扩增和用EcoRI、PstI内切酶酶切对所提取的DNA样品进行检测,比较所得DNA的产量和质量.结果表明,4种提取方法从叶片中得到的DNA产量和质量有所不同,其中酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法产量最高,纯度适中.4种方法提取的DNA对以后的PCR和酶切均没有影响.  相似文献   

"自杀性"DNA疫苗研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

向菁  王红宁  鲜凌瑾  张夏兰  周庆哲 《动物医学进展》2007,28(5):83-87

DNA疫苗作为第三代全新的疫苗,具有传统疫苗和其他基因工程苗不可比拟的优点.但由于其安全性方面存在着一些尚待解决的问题,使得实际应用受到限制."自杀性"DNA疫苗是基于常规的DNA疫苗和自主复制型RNA疫苗而发展起来的一种新型疫苗.由于其制备原理和过程与常规DNA疫苗相类似,所以它具备常规DNA疫苗在制作、运输储存以及免疫等各方面的优点.同时由于它以甲病毒复制子为基础能诱导转染细胞自主凋亡,故比常规DNA疫苗更为安全有效.文章针对"自杀性"DNA疫苗载体的构建、作用机理、优点以及国内外研究情况作一介绍.  相似文献   

一种土壤微生物总DNA的高效提取方法   总被引：21，自引：0，他引：21  

黄婷婷  曹慧  王兴祥  崔中利 《土壤》2004,36(6):662-666

获得高浓度、大片段、多样性程度高的土壤微生物总DNA 是研究土壤微生物群落结构的分子生态学基础。本文采用间接法(菌体细胞回收法)提取红壤地区两种土壤类型的土壤微生物总DNA,定量计算其回收率,并与直接法(细胞原位裂解法)比较了提取效率和纯度。结果表明:红壤地区2种土壤每克干土的总DNA提取量,间接法约为0.34和0.53礸/g干土,直接法约为13.62和24.32礸/g干土;间接法的提取效率低于直接法,但所得DNA片段较大,且Sau 3AⅠ 酶切和16 S rDNA通用引物PCR扩增结果显示,间接法比直接法更能有效地去除土壤中的某些抑制剂,所得总DNA的纯度更高,有利于后续操作。  相似文献   

提取野生向日葵DNA的新方法     

许素莲  朴铁夫  赵林淑 《核农学报》2003,17(1):78-78

本文报道了提取野生向日葵菊芋DNA的方法。  相似文献   

胨冻样芽孢杆菌(Bacillus mucilaginosus YNUCC0001)絮凝剂生产、絮凝特性及其系统发育学分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

李文鹏  刘士清  廖昌珑 《土壤通报》2005,36(4):583-587

对BacillusmucilaginosusYNUCC000116SrDNA的1481bp片段与GenBank中最相似的16个分类单位进行了比较。UPGMA,NJ,ME和MP方法构建的系统发育树显示B.mucilaginosusYNUCC0001与B.mucilaginosusHSCC1605T、B.mucilaginosus1480D及Paenibacillussp.NBT形成一个单系群分支。在50L全自动发酵罐中30℃发酵52h后,菌株YNUCC0001产生的胞外生物多聚絮凝剂(EBF)达到最大产率(粘度:3420C.P.)。在pH4.0、用量为0.25mlL-1的条件下,这种EBF对高岭土悬浊液的絮凝活性最大(99.8%);121℃高压灭菌60min后絮凝活性维持在98.6%。Hg2+,Ca2+,Mg2+,K+,Zn2+对其絮凝活性有促进作用,而Fe3+、Al3+、EDTA和Cu2+则有强烈抑制。  相似文献   

猪瘟DNA疫苗的临床免疫实验   总被引：1，自引：0，他引：1  

舒秀伟  李素  孙金福  查云峰  扈荣良  郭焕成  涂长春 《农业生物技术学报》2006,14(6):845-849

在前期研究工作筛选出2种DNA疫苗质粒的基础上,采用3种免疫策略(DNA疫苗单独免疫法、DNA疫苗初免蛋白免疫加强的prime-boost方法以及沙门氏菌(Salmonella)载体介导法),于某规模化猪场对猪瘟病毒(CSFV)的DNA免疫效果进行了临床应用研究。随机选择未经猪瘟疫苗免疫的断奶仔猪60头,分6组进行免疫接种,检测免疫猪抗体产生情况并对各组免疫猪进行攻毒试验。免疫猪血清抗体ELISA检测结果表明,pcDSW组、pIRE2IL2组、pcDSW E2protein组和pIRE2IL2 E2protein组均产生了较高的抗体水平,而沙门氏菌介导的2种DNA疫苗质粒诱导的抗体水平不显著。攻毒试验结果表明,pcDSW和pIRE2IL2单独免疫组或prime-boost组能够抵抗致死剂量的CSFV石门强毒攻击,保护率87.50%￣90.00%。其中pcDSW效果好于pIRE2IL2。而沙门氏菌介导的DNA疫苗组不能产生有效保护。不同接种途径的免疫效果比较结果表明,颈部肌肉注射免疫后产生的抗体水平较后肢胫前肌注射免疫产生的抗体水平高。  相似文献