合浦珠母贝3个养殖群体遗传多样性的微卫星分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

曲妮妮  龚世园  黄桂菊  喻达辉 《水生态学杂志》2009,30(4):89-93

采用微卫星分子标记对我国广东大亚湾、广西北海、海南三亚的合浦珠母贝养殖群体进行了遗传多样性分析.从49对引物中筛选出31对有效扩增引物,种群扩增获得9个多态位点,多态位点比例为29.03%.它们在3个群体共96个个体中产生了44个等位基因,平均每个位点产生4.889个.3个群体的平均期望杂合度分别为0.590、0.600、0.615;平均观察杂合度分别是0.393、0.425、0.325;平均多态信息含量PIC值分别是0.530、0.551、0.556.表明3个群体的遗传多样性处于较高水平.平均遗传偏离指数分别为-0.324、-0.336、-0.304;哈代-温伯格平衡检测发现,3个群体27个位点中21个位点偏离平衡状态.遗传分化和遗传距离分析表明,海南群体与广东群体之间的亲缘关系较近,而与广西群体的亲缘关系较远.  相似文献   

加工番茄骨干自交系的遗传变异     

任唯  任杰  王建江  杨相昆  张占琴  颉健辉  李艳  杨文才 《中国蔬菜》2023,(3):37-46

采用137个In Del标记和1个SSR标记,对近年来选育的60个加工番茄骨干自交系的遗传变异进行分析。结果表明：60个加工番茄骨干自交系的平均遗传距离在0.097～0.183之间,成对比较的最小遗传距离为0.022,最大遗传距离为0.272。群体结构分析将60个骨干自交系分为2个或4个亚群,亚群分类与自交系的生物学性状之间没有明显的关联性。与2012年以前育成的25个加工番茄自交系比较发现,这60个骨干自交系的遗传变异范围相对较窄。  相似文献   

浦市黑猪保种群体基于SNP芯片的遗传结构分析     

邓缘  崔清明  陈四海  左剑波  刘莹莹  朱吉  任慧波  胡雄贵  李华丽  喻国均  陈晨  彭英林 《福建农业学报》2023,(11):1312-1320

【目的】通过SNP芯片技术分析浦市黑猪群体遗传多样性和家系结构,为保护和利用浦市黑猪资源提供支撑。【方法】利用“中芯一号”50K SNP芯片,对79头成年浦市黑猪（10头公猪、69头母猪）进行SNP测定,采用多种分析软件（Plink、 Gmatix及Mega X）对群体遗传多样性和亲缘关系开展分析,进而构建群体家系结构。【结果】在79头浦市黑猪中共检出57 466个SNPs位点,平均基因型检出率为99.15%。遗传多样性分析提示SNP位点具有多态性,群体存在近交（有效群体含量Ne仅为1.5,且平均观察杂合度<平均期望杂合度）。群体平均状态同源（Idengtical by state,IBS）遗传距离为（0.294 9±0.072 6）,公猪为（0.277 1±0.091 8）,共检测到长纯合片段（Runs of hemozygosity,ROH）(29.60±16.12)个,其中长度在0～100 Mb的占40.5%,且群体基于ROH的平均近交系数为0.108。IBS距离矩阵、G矩阵结果以及群体ROH值的分析结果均反映出群体内个体之间存在较近的亲缘关系。根据群体进化树结果,将群体划...  相似文献   

氮肥运筹对港啤1号群体质量及产量和蛋白质含量的影响   总被引：3，自引：1，他引：2  

张国良戴其根  陈培红王勤张桂华  许如根张洪程 《麦类作物学报》2005,25(4):101-104

为给啤酒大麦优质高产栽培中合理施用氮肥提供科学依据,在配合磷肥的前提下,研究了不同氮肥运筹对啤酒大麦港啤1号群体质量、产量和籽粒蛋白质含量的影响。结果表明,随着施氮量的增加,有效穗数、叶面积指数、群体干物质积累量、籽粒产量和蛋白质含量随之增加;随着氮肥用量后移,越冬苗、返青苗、最高茎蘖数、有效穗数均呈下降的趋势,成穗率和籽粒蛋白质含量均呈上升趋势;综合考虑大麦群体质量、产量及籽粒蛋白质含量等多项指标,啤酒大麦港啤1号以总施氮量225kg/hm2、基肥与穗肥比例为8∶2的组合较好,可获得5790.75kg/hm2的产量,并生产出符合酿酒业标准的优质啤麦原料。  相似文献   

基于地标点法的不同黄河鲤群体形态鉴别     

姜京京  张成锋  唐永凯  敬小军  李红霞  刘磊  苏胜彦 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2023,(3):29-36

为了解黄河鲤谱系进化过程中不同群体形态差异,利用地标点法对20世纪70年代标本黄河鲤和现有山东、河南黄河鲤群体形态进行比较。选取19个地标点,通过最小平方和法进行回归分析,回归系数为0.998,证明地标点选取有效。通过地标点的重叠效果以及对平均形进行矢量化、网格化处理,形态差异主要体现在背鳍基部和腹鳍。相对扭曲主成分分析在不同黄河鲤群体中共提取34个主成分,通过第1、2主成分绘制散点图,标本黄河鲤群体与其他2个群体无重叠且较集中,河南和山东黄河鲤群体重叠且分散。聚类分析表明,河南、山东群体聚为一支,标本黄河鲤为单独一支。前5个主成分累积贡献率为93.03%,解释了主要形态变异,对前5个相对扭曲主成分得分建立Bayes判别函数,结果显示100%的标本黄河鲤能准确识别。背鳍基部和腹鳍2个位置靠近鱼类传统测量中体高特征值,标本黄河鲤与河南、山东黄河鲤形态差异极显著。综上,标本黄河鲤与河南、山东黄河鲤形态差异较大,主要体现在体高/体长比,而河南和山东黄河鲤形态无明显差异,为探究不同群体黄河鲤谱系在种质利用过程中分化和遗传渐渗时间奠定了基础。  相似文献   

芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析     

漆艳香  蒲金基  张欣  陆英  张贺  张辉强  谢艺贤 《热带作物学报》2011,32(4):663-667

根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF/XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)中获得了约1.4 kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明,该基因片段长1 422 bp含有一个完整的LuxR同源基因,并命名为XcmR。生物信息学分析表明,XcmR基因完整ORF(开放阅读框)全长765 bp,编码254个氨基酸,分子质量和等电点分别约为28.2 ku和8.9,与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhyR/AsaR氨基酸序列具有86%~99%相似性。系统聚类结果表明,XcmR与来源于柑桔溃疡病菌(X.axonopodis pv.citri)、番茄疮痂病菌(X.c.pv.vesicatoria)、水稻白叶枯菌(X.oryzae pv.oryzae)和甘蓝黑腐病菌(X.c.pv.campestris)的LuxR蛋白聚成一支。NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明,XcmR是LuxR蛋白家族的一员,具有LuxR蛋白相似结构。  相似文献   

贵州省种猪繁育核心群体及健康养殖技术要点     

付昌友 《养猪》2023,(5):56-59

在人们日常生活中,猪肉是一种十分重要的肉类动物产品,其食品安全问题也受到了广大群众的关注。高质量猪肉生产是我国国民经济和社会发展的重要环节,种猪繁育及健康养殖技术要点在规模化和集约化养殖场中具有至关重要的作用。近年来,养猪行业对贵州省畜牧经济发展影响越来越大,健康养殖对贵州省种猪繁育技术的进步和成熟起着重要作用。本文主要围绕种猪繁育核心群体的指标、繁殖种猪核心群体的构建、健康养殖界定及其要点等几方面展开综述,以期优化和改进现有养殖技术,推广应用健康养殖关键技术,提高种猪健康养殖过程中的繁育技术,促进我国养殖业的绿色、可持续、高效发展。  相似文献   

泵闸结构流场的水力特性     

黄建军  郑源  张盾 《排灌机械》2010,28(2):149-154

为了提高泵闸工程工作的稳定性和高效性,采用计算流体动力学方法,以设计参数作为控制条件,运用Fluent软件对某泵闸工程进行了数值模拟计算和分析,并对闸门附近的结构进行了优化.结合河道过流特点,建立了断面有效过流面积率和过流均匀度两个表示过流断面水流流态的公式,并以此作为数值模拟优化的目标函数,对泵闸结构进行了优化.通过数值模拟,分析了引、排水工况下的水流及流场分布规律,分析了实际闸门附近的水流动特性和过流情况,分析了内河侧＂S＂形转弯对工程水流的影响.通过整体水工模型试验,对改造后的消能设施进行了论证.结果表明,改造后的内外河最大流速均小于0.6~0.8 m/s,且河道的有效过流面积率和过流均匀度均大于0.75.  相似文献