红富士苹果芽变系DNA甲基化研究     

杜晓云  宋来庆  赵玲玲  刘美英  唐岩  孙燕霞  姜中武    束怀瑞 《园艺学报》2019,46(1):107-120

以35份富士苹果(Malus×domestica Borkh.‘Fuji’)芽变材料为试材,利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation Sensitive Amplified Polymorphism,MSAP)分析和UPGMA聚类方法,对其基因组甲基化修饰水平、变异模式以及表观遗传变异关系进行研究。结果表明:(1)不同富士系得到不同的MSAP扩增,总DNA甲基化水平27.90%～36.16%,平均32.87%,双链全甲基化为主要甲基化方式;(2)富士芽变材料绝大多数位点保持了原有甲基化模式;(3)绝大多数芽变(68.57%)检测到全部的甲基化变异模式(12种),去甲基化频率极显著高于甲基化频率(P <0.01),且CG去甲基化极显著高于CHG;(4)36份种质遗传相似系数平均值0.89(0.79～0.92),在聚类图上,富士原种分布在芽变系集中区外,新近发生的芽变系更倾向于聚在一起,着色系片红型和条红型芽变呈分散排布状态。总的来看,富士芽变的甲基化变异模式丰富,超甲基化和去甲基化相伴发生,但以去甲基化为主;‘富士’着色芽变与其最原始品种富士,以及芽变之间发生了较大表观遗传变异;片红和条红型芽变聚类未表现明显偏好性。本研究将为进一步开展富士着色系芽变机理研究提供指导,可以CG去甲基化为切入点展开深入研究。  相似文献   

核桃叶片基因组DNA的4种提取方法比较   总被引：2，自引：0，他引：2  

韩继成  徐平  李春敏  陈湖  张新忠 《河北农业科学》2007,11(1):68-71

以核桃叶片为材料,比较了高盐低pH法、SDS法、改良CTAB法和适合酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法提取基因组DNA的效果;通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计、RAPD、ISSR等方法进行PCR扩增和用EcoRI、PstI内切酶酶切对所提取的DNA样品进行检测,比较所得DNA的产量和质量.结果表明,4种提取方法从叶片中得到的DNA产量和质量有所不同,其中酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法产量最高,纯度适中.4种方法提取的DNA对以后的PCR和酶切均没有影响.  相似文献   

猪瘟病毒与非洲猪瘟病毒双重荧光定量PCR方法的建立与应用     

刘婉宁  李世念  倪民婷  苏霖  师庆伟  王金涛 《黑龙江畜牧兽医》2022,(19):80-85

为了建立能够猪瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)和非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)双重荧光定量PCR方法,试验比对了CSFV与ASFV的基因组序列,针对CSFV 5′-UTR和ASFV B646L保守靶序列,分别设计2条特异性引物及1条TaqMan探针,通过优化扩增体系和程序,建立可同时检测CSFV和ASFV的双重荧光定量PCR方法,并建立该方法的标准曲线,同时用敏感性试验、特异性试验和重复性试验对该方法进行评价,最后检验该方法的应用效果。结果表明：CSFV和ASFV标准曲线的相关系数(R²)分别为0.999和1,线性关系良好;CSFV与ASFV的最低检测浓度分别为1.3×10⁰ copies/μL和2.4×10⁰ copies/μL;与其他常见猪只病原检测无交叉反应;批间与批内变异系数均小于2%,稳定性良好。试验建立的方法对44份临床样本的检测结果与《猪瘟病毒实时荧光RT-PCR检测方法》(GB/T 27540—2011)和《非洲猪...  相似文献   

安犏牛线粒体DNA分析及系统进化研究     

曹梦丽  丁考仁青  马忠涛  裴杰  包鹏甲  石红梅  梁春年  阎萍  郭永光  郭宪 《中国草食动物科学》2021,(3):7-11

安格斯牛与牦牛杂交所产F1犏牛显示出较高的杂交优势,不仅耐高寒、耐粗饲,而且弥补了牦牛生长慢的缺点.为了解安犏牛的线粒体结构特性,从二代测序数据中组装了安犏牛[Angus cattle(Bos taurus;♂)×Gannan yak(Bos grunniens;♀)]完整的线粒体基因组.结果表明:安犏牛基因组大小为 ...  相似文献   

"自杀性"DNA疫苗研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

向菁  王红宁  鲜凌瑾  张夏兰  周庆哲 《动物医学进展》2007,28(5):83-87

DNA疫苗作为第三代全新的疫苗,具有传统疫苗和其他基因工程苗不可比拟的优点.但由于其安全性方面存在着一些尚待解决的问题,使得实际应用受到限制."自杀性"DNA疫苗是基于常规的DNA疫苗和自主复制型RNA疫苗而发展起来的一种新型疫苗.由于其制备原理和过程与常规DNA疫苗相类似,所以它具备常规DNA疫苗在制作、运输储存以及免疫等各方面的优点.同时由于它以甲病毒复制子为基础能诱导转染细胞自主凋亡,故比常规DNA疫苗更为安全有效.文章针对"自杀性"DNA疫苗载体的构建、作用机理、优点以及国内外研究情况作一介绍.  相似文献   

荧光探针PCR检测牛嵴病毒的方法建立     

师志海  王文佳  孟红丽  王亚州  闫祥洲  邱祥琦  程燕  滑留帅  施巧婷  徐照学 《中国兽医学报》2022,(4):657-661

牛嵴病毒(bovine kobuvirus, BKoV)是与犊牛腹泻密切相关的病原,试验针对BKoV 3D基因设计特异性引物和探针,建立快速检测BKoV的实验室方法。该方法仅能特异性扩增BKoV,对其他犊牛腹泻病原无扩增,特异性较强;对BKoV质粒标准品的最低检出限为11.0拷贝/μL,灵敏性较强;且组内与组间变异系数均小于2%,重复性较好。对采集自河南省的221份犊牛腹泻临床样本进行检测,BKoV的核酸检出率为9.05%(20/221)。本研究建立的检测方法为BKoV的临床快速检测和流行病学调查提供了有效手段。  相似文献   

双针结构土壤水分传感器探针最优长度分析与试验     

赵燕东  聂铭君 《农业机械学报》2011,42(11):39-43

在两针平行式探针结构的阻抗模型的基础上,进一步理论推导了终端开路式和终端短路式两种类型土壤水分传感器探针长度与阻抗特性的关系.借助高频分析软件HFSS确定了两针平行式土壤水分传感器的最佳探针结构,并采用有机溶液模拟土壤体积含水率进行了试验,试验结果表明:终端开路式和终端短路式土壤水分传感器探针长度在0 ～8.3 cm时,其土壤体积含水率测量范围达到0～100％.  相似文献   

我国口岸截获的10种乳白蚁的检疫鉴定     

王新国  陆军  王建国  徐新峰  牟桂萍  江志海  邓雪华  华展义 《植物检疫》2022,(4):68-74

乳白蚁（Coptotermes）是一类我国进境植物检疫中经常截获的重要有害生物,然而长久以来其分类和鉴定都比较混乱。本文结合乳白蚁分类研究的最新成果,从我国口岸经常截获的乳白蚁中挑选出10个“确定种”,即台湾乳白蚁（C. formosanus）、曲颚乳白蚁（C. elisae）、格斯特乳白蚁（C. gestroi）、巴布亚乳白蚁（C. pamuae）、甘氏乳白蚁（C. gambrinus）、短刀乳白蚁（C. acinacifomis）、南美乳白蚁（C. testaceus）、中间乳白蚁（C. intermedius）、非洲乳白蚁（C. sjostedti）和阿曼乳白蚁（C. amanii）。对这10种乳白蚁的形态进行了分析,测量了其头部、前胸背板和后颏上9个重要特征值,结合图例分析了头部背面、前胸背板和上颚形态特征。扩增并分析了10种乳白蚁mtDNA上的COI基因片段,进一步验证了乳白蚁种类鉴定结果。最后给出了10种乳白蚁兵蚁的形态鉴定检索表,以期为口岸乳白蚁的检疫鉴定提供参考。  相似文献   

Frankia共生固氮基因的分离与克隆     

陈丽梅  柏学亮  彭源东 《广西农业生物科学》1996,(1)

利用ＤＮＡ－ＤＮＡ杂交方法，分离细枝木麻黄的Ｆｒａｎｋｉａ菌株Ｃｏ０１的ｎｉｆ克隆ｐＣｃ１ＧＸ，赤杨内生菌株Ａｔ４的ｎｉｆ克隆ｐＡｔ１ＧＸ及沙棘的ＦｒａｎｋｉａＨｒ１８的ｎｉｆ克隆ｐＨｒ１８ＧＸ、ｐＨｒ１１－③ＧＸ。用基因功能互补法，从Ｆｒａｎｋｉａ菌株Ａｔ４的基因文库中分离到二个可能可互补豌豆根瘤菌ｎｏｄ基因功能的克隆ｐＡｔ２ＧＸ、ｐＡｔ３ＧＸ，并制作了ｐＡｔ２ＧＸ、ｐＡｔ３ＧＸ的亚克隆，予进一步实验，获得充分的证据证明ｐＡｔ２ＧＸ、ｐＡｔ３ＧＸ是否带有Ｆｒａｎｋｉａ菌株Ａｔ４的ｎｏｄ基因．  相似文献   

实蝇DNA提取方法的比较   总被引：3，自引：0，他引：3  

余洁  陈劲松  翁瑞泉  邱君志  关雄 《农业生物技术学报》2004,12(6):741-742

在实蝇的口岸检疫鉴定工作中，主要以成虫的外部形态特征作为分类依据，而口岸截获的往往是幼虫或卵，通常的做法是对其进行室内饲养待获得成虫后再进行鉴定。这样的检疫周期太长，并且不利于对世界或某一区域实蝇种群结构的了解。分子生物学技术可以弥补传统方法的不足，能快速、准确和灵敏地检测出实蝇种类，揭示其种群间的亲缘关系并提早制定相应的防治方法。本实验比较了5种实蝇基因组DNA提取方法，并进一步用RAPD技术快速鉴定其种类。  相似文献