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71.
利用马克隆值差异显著的BILs鉴定棉纤维品质相关基因 总被引：1，自引：1，他引：0
【目的】马克隆值是衡量棉纤维品质的重要指标之一。利用马克隆值存在显著差异的2个陆海回交近交系材料进行高通量基因芯片分析,旨在筛选和鉴定棉纤维发育相关的关键基因。【方法】从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)高世代回交近交系(Backcross Inbred Lines,BILs)群体中选取NMGA-140(马克隆值6.2)和NMGA-051(马克隆值4.0)为材料,利用Affymetrix公司的棉花寡聚核苷酸基因芯片对其开花后10 DPA(Days after anthesis)的棉纤维进行了表达谱分析。【结果】获得了2655个差异表达基因,包括功能预测基因(15.57%),翻译、核糖体结构与生物合成相关基因(13.54%)和翻译后修饰、蛋白质转换、分子伴侣相关基因(9.31%)等。推测β-tub10正向调控棉纤维发育过程,β-tub1负向调控棉纤维发育过程,Ghi.3578.1.S1_s_at在棉纤维发育早期起到了作用。【结论】为棉花纤维品质的遗传改良提供了丰富的基因资源,为分子标记辅助育种开发更多新的分子标记。 相似文献
72.
[Objective] The MAPKKK gene family plays an important regulating role in response to multiple abiotic stresses and the development of plant. This study aims to identify MAPKKK genes of Gossypium raimondii and analyze their functions. [Method] In this study, based on G. raimondii genome database and bioinformatics method, G. raimondii MAPKKK family genes were identified and analyzed. Using the MEGA5, GSDS and Mapchart program, the phylogenetic tree, gene structure and chromosomes location analyses were accomplished. Based on the existing microarray data in cotton and comparative profiles of these MAPKKK genes, different expression of them in multiple abiotic stresses and the expression at different cotton fiber developmental stages were analyzed. [Result] A sum of 114 MAPKKK genes were identified systematically in G. raimondii and classified into 3 subfamilies (Raf, ZIK and MEKK) according to the gene stucture and phylogenetic tree analyses. They were distributed on all the 13 chromosomes of G. raimondii, and segmental duplication and tandem duplication events may have occurred. Compared with the recently released 78 genes of G. raimondii MAPKKK family genes, 47 sequences are exactly the same ones. [Conclusion] The results are helpful to understand the evolution and function of MAPKKK gene family. Our results provide a foundation for future functional characterizations of MAPKKK genes in cotton and probably other Gossypium plants. 相似文献
73.
为研究不同发育时期花生籽仁油脂合成过程中基因表达调控模式,本研究以高油酸、中油花生品系F18和低油酸、低油花生品种‘鲁花6号’为材料,对下针后10、30、40、60 DAP(days after pegging)的花生种子进行表达谱芯片测序。结果表明,130、3556、2783个基因分别在30、40、60 DAP时期差异表达。GO注释和KEGG富集结果显示,差异表达的基因主要富集在脂肪酸合成和光合等代谢进程中,其中FAB2、FAD2、WRI1等主要参与油酸的积累,参与光合作用的基因均为捕光叶绿素a/b结合蛋白,全部上调表达。代谢通路图结果表明,籽仁发育的40 DAP和60 DAP时期,脂肪酸合成途径的基因均上调表达。研究结果为花生油脂代谢的分子机制提供理论基础,同时也为花生品质改良贡献了基因资源。 相似文献
74.
免疫检测技术是食品安全检测领域中应用广泛的技术之一,新的免疫检测技术不断应用于抗微生物药物残留检验中,有力地推动了抗微生物药物残留安全监测体系的建立。首先,对抗微生物药物人工抗原合成与抗体生产技术进行了论述,之后着重综述了量子点荧光免疫分析法、时间分辨免疫分析法、免疫传感器和免疫芯片检测技术近年来取得的研究进展,并对这些技术的未来发展进行了展望。 相似文献
75.
Background
An easy-to-handle microarray assay based on the cost-effective ArrayTube™ platform has been designed for the rapid and unequivocal identification of Coxiella burnetii, the causative agent of Q fever. The gene targets include the chromosomally coded markers icd, omp/com1, and IS1111 as well as the plasmid coded markers cbbE and cbhE.Results
A representative panel comprising 50 German C. burnetii isolates and 10 clinical samples was examined to validate the test. All tested isolates harboured plasmid QpH1 and were correctly identified, corresponding to 100% sensitivity. The assay’s limit of detection was 100 genome equivalents (GE) for icd, omp/com1, cbbE and cbhE and 10 GE for IS1111. Assay specificity was 100% as determined by analysing a panel of 37 non-Coxiella strains.Conclusions
The present array is a rational assembly of established and evaluated targets for the rapid and unequivocal detection of C. burnetii. This array could be applied to the screening of vaginal swabs from small ruminants; screening of environmental samples e.g. on farms or screening of human samples. 相似文献76.
77.
甘蓝型油菜华油杂6号及其亲本的基因差异表达研究 总被引：4，自引：1，他引：4
【目的】探讨甘蓝型油菜在基因表达水平上的杂种优势机理，以期为最终揭示杂种优势的遗传基础积累试验数据。【方法】应用拟南芥cDNA芯片，以华油杂6号及其亲本为材料，分析杂种和亲本在花蕾中的基因差异表达。【结果】杂种和母本8086A之间，有83个上调的转录本和331个下调的转录本；杂种和父本7-5之间，有94个上调表达的转录本和423个下调表达的转录本。在上调表达的转录本中，存在较多与光合作用相关的基因，讨论了这些基因和甘蓝型油菜华油杂6号杂种优势之间的关系。磷酸核酮糖(PRK)的Northern印迹结果与芯片显示结果基本一致。【结论】基础代谢基因对甘蓝型油菜杂种优势的形成影响较大。拟南芥cDNA芯片可以广泛应用于甘蓝型油菜及其近源物种的基因表达分析。 相似文献
78.
DNA芯片技术应用研究进展 总被引：3，自引：0，他引：3
DNA芯片技术是近年迅速发展的一门生物高新技术 ,其突出特点在于高度并行性、多样性 ,即能一次性对生物遗传信息进行大规模的快速、同步分析。DNA芯片技术目前已用于基因重复测序、基因表达分析、新基因的发现、基因单核苷酸多态性 ( SNPs)研究、基因诊断、药物筛选等领域 ,而且其应用范围还在不断扩展。本室运用这一新技术 ,检测水稻在受水稻黄单胞菌水稻致病变种及该菌株的 rpf C基因缺失突变体感染时基因表达的差异 ,发现一些基因可能与水稻抗白叶枯病相关 相似文献
79.
针对目前通用的cDNA微阵列数据的标准化处理方法(常称为对数比转换法)中存在的缺陷，提出了一种新的cDNA微阵列数据标准化方法－非转换法。该方法利用Huber等(2003)提出的芯片数据分析模型，在对芯片背景进行校正后，根据最小二乘估计原理，通过迭代的方式直接对样品中的基因转录水平进行估计，从而达到数据标准化的目的。利用计算机模拟，比较了在各种条件下(不同的芯片内探针重复数、不同的背景变异程度、不同的差异表达基因上下调比例等)该方法与对数比转换法的优劣。结果表明，在所有条件下，非转换法都优于对数比转化法，由非转换法得到的估计值的相对偏差都在5％以下，而由对数比转化法得到的估计值的相对偏差都在20％以上，而且对数比转化法对背景变异和差异表达基因上下调比例更敏感，随着背景变异程度的增大和差异表达基因上下调比例不对称性的提高，其估计值的偏差急剧上升，而非转换法则基本不受影响。因而非转换法可以作为cDNA微阵列数据标准化的一种替代方法。 相似文献
80.