5个鹅品种微卫星遗传多样分析     

段修军  龚道清  王丽华  王健  陈章言  高玉时  赵旭庭 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2006,27(3):40-43,61

选用10个微卫星引物对四川白鹅、豁眼鹅、莱茵鹅、朗德鹅、扬州鹅5个鹅品种进行遗传多样性分析。结果表明:5个鹅品种的10个微卫星座位共检测到272个等位基因,平均基因数为5.4个,5个鹅品种在10个微卫星座位上的基因频率存在一定差异,其平均基因杂合度为0.708 1,平均多态信息含量为0.661 8。其中,扬州鹅平均基因杂合度最高,为0.756 8,遗传多样性最丰富;朗德鹅平均遗传杂合度最低,为0.670 7。  相似文献   

乐清湾和三沙湾缢蛏群体遗传多样性的微卫星分析   总被引：1，自引：1，他引：1       下载免费PDF全文

刘达博  牛东红  冯冰冰  钟玉民  李家乐 《上海海洋大学学报》2011,20(3):350-357

利用微卫星标记分析了我国浙江乐清湾翁垟(ZWY)、乐成(ZYC)、南岳(ZNY)、南塘(ZNT)、清江(ZQJ)、湖雾(ZHW)、坞根(ZWG)、海山(ZHS)和芦浦(ZLP) 9个群体和福建三沙湾漳湾(FZW)、梅田(FMT)、三都(FSD)、渔江(FYJ)、白招(FBZ)、霞塘(FXT)、长春(FCC)、沙江(FSJ)和溪尾(FXW)9个缢蛏群体的遗传多样性和遗传分化,以期评价乐清湾和三沙湾内缢蛏群体的遗传结构差异,为我国缢蛏主要原产地种质资源保护和遗传育种提供基础资料。遗传多样性结果表明,浙江乐清湾和福建三沙湾内的缢蛏群体中各位点平均有效等位基因数N_e变化范围分别为8.146~10.457和7.457~9.947,平均期望杂合度H_e分别为0.872~0.909和0.846~0.894,Nei’s基因多样性指数分别为0.863~0.899和0.836~0.886,显示乐清湾和三沙湾缢蛏群体的遗传多样性仍处于较高水平。群体间遗传分化指数（F_ST）结果表明,缢蛏各群体间F_ST为0.000 1~0.052 3。基于Nei’s遗传距离（D_A）构建非加权组平均法（UPGMA）系统树结果显示,18个群体聚类为2支,除ZWY和ZWG群体外,ZYC、ZNY、ZNT、ZQJ、ZHW、ZHS 和ZLP浙江群体单独聚为一支;而ZWY、ZWG群体与FZW、FMT、FSD、FSJ、FBZ、FXT、FCC、FSJ 和FXW 9个福建群体聚类在一起,因此推测浙江的ZWY、ZWG群体可能来自福建,揭示在缢蛏的养殖过程中可能存在引苗现象。  相似文献   

日本沼虾太湖和鄱阳湖群体及其F₁的遗传结构分析          下载免费PDF全文

李瀚声  冯建彬  谢楠  冯晓宇  李应森  李家乐 《上海海洋大学学报》2011,20(3):321-327

采用12对微卫星标记分析了日本沼虾太湖、鄱阳湖两个野生群体及其双列杂交的F₁的遗传结构和遗传多样性。结果显示,所用引物的平均等位基因数(N_a)为17.67个,有效等位基因数(N_e)为12.48个,大小在112～427 bp之间。平均观测杂合度(H_o)为0.693 8,平均期望杂合度(H_e)为0.913 4。2个亲本及4个子代组合的两两遗传分化指数F_ST值在0.020 5~0.042 7之间,基因流(N_m)数值在5.607 5~11.957 0之间,表明日本沼虾组合间分化不明显。聚类分析结果表明,TP（太湖♀?鄱阳湖♂）组合与PT（鄱阳湖♀?太湖♂）组合,TT（太湖♀?太湖♂）组合与TH（太湖亲本）组合,PP（鄱阳湖亲本）组合与PY（鄱阳湖♀?鄱阳湖♂）组合分别先聚在一起,之后是TP,PT,TT,TH组合聚在一起,最后再与PP,PY组合聚合在一起。试验结果显示,杂交组合的观测杂合度有明显提高;杂交组合与其它组合分化不明显;杂交子代与母本的遗传结构更相似。本试验通过杂交来分析亲本及子代各个组合之间遗传多样性及遗传结构的变化情况,为日本沼虾资源保护和开发利用提供理论依据。  相似文献   

文昌鸡蛋品质性状与微卫星标记的关联分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

钱凯  李慧芳  徐文娟  朱文奇  张晶鑫 《四川农业大学学报》2007,25(3):332-336,356

对120只55周龄文昌鸡进行了蛋品质的测定,测定的8个性状为:蛋重、蛋壳重、蛋壳厚度、蛋壳强度、哈氏单位、蛋形指数、蛋黄重、蛋黄颜色。通过统计软件,对各蛋品质性状进行了相关分析,并通过选用20对微卫星标记,分析蛋品质性状的遗传参数,筛选出了与哈氏单位、蛋重、蛋壳强度有关的分子遗传标记。结果表明:①蛋品质大多数性状间相关性不显著;②文昌鸡群体内遗传差异较大,保留着丰富的遗传多样性;③位于2号染色体的标记ADL0176、MCW0239和4号染色体的标记MCW0240与55周龄哈氏单位呈显著相关;位于4号染色体的标记LEI0119与55周龄蛋重相关;位于Z染色体的标记MCW0246和LEI0229与55周龄蛋壳强度呈显著相关。本研究结果为文昌鸡的蛋品质的间接选择提供理论依据,同时也为哈氏单位、蛋壳强度、蛋重的QTL定位和标记辅助选择提供理论依据。  相似文献   

静宁鸡和固原鸡品种划分的分子遗传基础     

李显耀  张龙超  曲鲁江  杨宁 《农业生物技术学报》2005,13(5):664-667

甘肃静宁鸡和宁夏固原鸡具有相似的形成历史，被合并为静原鸡收录在中国家禽品种志。当地对此持有不同的看法，认为这两个品种不应合并为一个品种，而应为两个不同的品种。研究利用26个微卫星标记对两群体进行分析，计算两群体中各标记的等位基因数、有效等位基因数、杂合度以及群体间的Nei氏遗传距离、遗传相似系数和分化系数。结果表明，静宁鸡中各标记的观察等位基因数目为1～16，平均为5．962，平均有效等位基因数目为3．254；固原鸡中各标记的观察等位基因数目为1～14，平均为5．615，平均有效等位基因数目为3．222。静宁鸡中各标记观察杂合度为0～0．839，平均为0．558；固原鸡中各标记观察杂合度为0～0．867，平均为0．515。静宁鸡和固原鸡间的遗传距离为0．0876，遗传相似系数为0．9161。说明两群体具有相似的血缘、相似的遗传基础，中国家禽品种志将这两个品种合并为一个品种是有一定道理的。研究为解决类似的品种定名争执提供了新的方法。  相似文献   

Development and Characterization of Novel Polymorphic Microsatellite Markers for Tapinoma indicum (Hymenoptera: Formicidae)     

Li Yang Lim  Abdul Hafiz Ab Majid 《Journal of insect science (Online)》2021,21(4)

Tapinoma indicum (Forel) (Hymenoptera: Formicidae) is a nuisance pest in Asia countries. However, studies on T. indicum are limited, especially in the field of molecular biology, to investigate the species characteristic at the molecular level. This paper aims to provide valuable genetic markers as tools with which to study the T. indicum population. In this study, a total of 143,998 microsatellite markers were developed based on the 2.61 × 10⁶ microsatellites isolated from T. indicum genomic DNA sequences. Fifty selected microsatellite markers were amplified with varying numbers of alleles ranging from 0 to 19. Seven out of fifty microsatellite markers were characterized for polymorphism with the Hardy–Weinberg equilibrium (HWE) and linkage disequilibrium (LD) analysis. All seven microsatellite markers demonstrated a high polymorphic information content (PIC) value ranging from 0.87 to 0.93, with a mean value of 0.90. There is no evidence of scoring errors caused by stutter peaks, no large allele dropout, and no linkage disequilibrium among the seven loci; although loci Ti-Tr04, Ti-Tr09, Ti-Te04, Ti-Te13, and Ti-Pe5 showed signs of null alleles and deviation from the HWE due to excessive homozygosity. In conclusion, a significant amount of microsatellite markers was developed from the data set of next-generation sequencing, and seven of microsatellite markers were validated as informative genetic markers that can be utilized to study the T. indicum population.  相似文献   

利用微卫星遗传标记估计金华猪个体间的亲缘关系   总被引：4，自引：0，他引：4  

王燕丽  徐宁迎 《中国畜牧杂志》2006,42(9):7-9

本研究采用微卫星标记多重扩增结合荧光标记检测技术,对金华猪Ⅰ系保种群中的120头猪的29个微卫星位点的基因型进行了检测,由检测结果可见,金华猪的基因纯合率较高,用SPSS软件对其中的72头金华猪个体间的亲缘关系进行聚类,在距离系数为8．147的水平上将这些猪聚成10大类。个体间的亲缘关系清楚可见,除个别猪外,与系谱资料的记录结果基本相符。根据聚类结果对5头系谱不明的猪进行了亲缘关系分析,结果是97-288与 98-104接近全同胞。23与784、99-542、K89等4头猪间的亲缘关系接近半同胞,302、382这两只猪间及与其他猪间几乎无亲缘关系。  相似文献   

昆山麻鸭微卫星DNA标记监测选种效果的研究   总被引：1，自引：1，他引：0  

赵旭庭  吉文林  沈根明  高勤学  彭建林  段修军  陈章言 《中国家禽》2006,28(24):84-86

利用12个微卫星标记分析了昆山麻鸭高产系F0代和F1代遗传多样性,监测选种效果。结果表明12个微卫星座位共检出83个等位基因,基因频率分布在0.0077～0.5859,平均每对引物扩增出8.3个等位基因。F0代微卫星的平均杂合度为0.7489,平均多态性含量0.7125;F1代为0.7668和0.6901。表明昆山麻鸭种群的群体遗传变异已趋于稳定。  相似文献   

微卫星DNA及其在羊品种资源评价和保护中的应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

吕惧金马月辉  耿社民杨燕 《家畜生态》2003,24(2):45-47,51

本文论述了目前我国及国外绵山羊品种资源现状，微卫星DNA形成特性以及国内外关于利用微卫星DNA研究绵山羊品种资源的进展，以期更好地推动我国绵山羊品种资源系统评价和保护的研究。  相似文献   

鸡微卫星DNA指纹与屠宰性状关系的研究     

张福宜  高玉时  王克华  童海兵 《中国家禽》2005,9(Z1):111-114

利用25个微卫星标记,对以隐性白羽鸡和仙居鸡为亲本建立的资源群体F2500只鸡进行遗传检测,并测定各个体的活重、屠体重、屠体率,采用方差分析法对标记与性状进行连锁分析.研究结果表明各位点平均等位基因数为5,平均杂合度为0.7012,平均多态信息含量为0.6468.方差分析显示MCW0095、ABR0322、ADL289、MCW4、ADL166、MCW104对活重、屠体重有显著影响(P＜0.05或0.01);MCW104对屠体率有极显著影响(P＜0.01);其他标记对性状的影响未达到显著水平.  相似文献