腐烂茎线虫种内群体特异性检测研究   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

刘斌  梅圆圆  郑经武 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2007,33(5):490-496

对腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor Thorne)7个不同地理群体rDNA 中的ITS区进行PCR-RFLP和序列测定, 发现种内群体间无论在序列长度还是酶切图谱均存在一定的变异.根据其序列特征设计出种特异性引物, 对所供试的腐烂茎线虫群体及属间不同种群体样品的rDNA ITS区相应区段扩增以验证其特异性, 同时对分别由1～5条腐烂茎线虫成虫和幼虫提取的DNA进行特异性扩增以验证其灵敏度. 结果表明: 所有供试的腐烂茎线虫群体均可以特异性扩增一个346 bp的片段, 而所有供试的属外种均没有扩增片段;由1～5条腐烂茎线虫成虫和4～5条幼虫进行的特异性扩增也获得稳定的目的片段. 显示该特异性引物具有较高的稳定性、特异性和灵敏度, 能快速、准确地检测出腐烂茎线虫.  相似文献   

中草药青蒿(Artemisia annua L.)的实时荧光PCR检测   总被引：1，自引：0，他引：1  

赵玥  赵文军  吕国忠  朱水芳 《沈阳农业大学学报》2006,37(4):648-650

中草药青蒿,学名黄花蒿(Artem isia annuaL.),属于中国独有的抗疟药用植物资源之一。根据蒿属植物rDNA ITS序列多态性设计TaqM an探针及引物,通过实时荧光PCR方法对黄花蒿进行检测。结果表明:该组探针-引物对黄花蒿有很强的特异性,除黄花蒿外,其余8种对照蒿属材料均未检测到荧光信号。该方法快速、简便、安全、准确,适用于黄花蒿的出入境检验。  相似文献   

三株田间分离大豆根瘤菌16S rDNA基因鉴定及序列比较     

李琬  李璐  李景鹏  许修宏 《东北农业大学学报》2007,38(6):725-728

文章采用16S rDNA技术,对分离自黑龙江省的3株大豆根瘤菌进行了序列测定及分析,通过与模式菌株的比较确定其在系统发育中的地位。结果表明,3个菌株与慢生根瘤菌亲源最近,利用分析根瘤菌16S rDNA的方法来鉴定根瘤菌的准确性较高,可行性较好。  相似文献   

Molecular phylogenetical studies of the thermophilic spore-forming desulfotomaculum isolated from oil-field     

Chen Wu  Li Chunyan  Xiang Fu  Yu Longjiang 《农业科学与技术》2005,6(4):14-21

A novel thermophilic and heterotrophic sulfate-reducing bacteria, strain CW-03, was isolated from crude oil well whose depth was 3.2 kilometer. The bacterium was strictly anaerobic; it does not endure acid and its maximum surviving temperature was 70℃. Many short chain organic compounds can be utilized as electron donors, which were acetate, formate, lactate, propionate, pyruvate, butyrate, succinate, malate, fumarate, valerate, caproate, heptanoate, octanoate, decanoate, tridecanoate, pentadecanoate, palmitate, heptadecanoate or ethanol, while sulfate and sulfite were used as electron acceptors. The following substrates were not utilized： benzoate undecanoate, dodecanoate, tetradecane, propanol, butanol, H2＋CO2 （80/20%; v/v） and acetate （1mM） ＋ H2. When lactate was used as electron donors, sulfite and thiosulfate, but not sulfer and nitrate, can be used as electron acceptors. Strain CW-03 was motile, curved rod, Gram-positive, pole flagellum and spore-forming. On the basis of 16S rRNA sequence alignment （accession numbers： AY703032）, CW-03 should be included in the genus Desulfotomaculum with BLAST analysis on line. However, some of its physiology and multiple sequence alignments were different from other members of this genus. Therefore, CW-03 should be recognized as a new species, for which we propose the name Desulfotomaculum chinamiddle （Bacteria, Firmicutes, Clostridia, Clostridiales, Peptococcaceae）.  相似文献   

18SrDNA序列与同翅目昆虫的分类系统   总被引：6，自引：0，他引：6  

赵惠燕  袁锋  张改生 《西北农业学报》1997,6(2):102-105

大量文献资料分析发现，昆虫１８Ｓ ｒＤＮＡ序列可以用作种上分类的指标，同翅目中所有胸喙亚目昆虫的１８Ｓ ｒＤＮＡ序列比头喙亚目及地翅目昆虫的１８Ｓ ｒＤＮＡ序列长，是典型的分子分类特征。  相似文献   

中国北方地区甘草根瘤菌表型及遗传多样性研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

谷峻  陈文新 《中国农业科学》2006,39(7):1321-1327

【目的】了解中国北方地区甘草根瘤菌的生物多样性。【方法】采用表型数值分类、16S rDNA PCR-RFLP分析和BOX-PCR指纹图谱分析的方法对北方地区的甘草根瘤菌进行表型、遗传多样性分析。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中约85％的相似水平上产生2个表观群，有11株菌未与已知参比菌株聚群。16S rDNA PCR-RFLP分析表明，供试的20株菌共产生14种遗传型，表现出丰富的遗传多样性。BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明与甘草共生的根瘤菌的基因组也具有多样性。【结论】在中国北方地区与甘草共生的根瘤菌在Sinorhizobium、Rhizobium和Mesorhizobium属中均有分布。  相似文献   

Bayesian inference towards the resolution of molecular evolution:application to the "Trichoderma harzianum sensu lato" clade          下载免费PDF全文

Druzhinina I S　 Kubicek C P 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2004,30(4):458-458

The Hypocrea lixii/Trichoderma harzianum species aggregate contains a group of taxa (H. lixii /T. harzianum, T. aggressivum, T. tomentosum, T. cerinum, T. velutinum, H. tawa) of which some (e.g. T. harzianum) are important for biocontrol of plant pathogenic fungi in agriculture, whereas others are aggressive pathogens of Agaricus spp. and Pleurotus spp. in mushroom farms (T. aggressivum), or opportunistic pathogens of immunocompromised mammals including humans (T. harzianum). We ch…  相似文献   

烟粉虱复合种不同地理种群的遗传分化   总被引：13，自引：0，他引：13  

褚栋  刘国霞  范仲学  陶云荔  张友军 《中国农业科学》2006,39(8):1571-1580

烟粉虱Bemisia tabaci(Gennadius) 是由具有遗传分化的不同地理种群组成的复合种。本文介绍了烟粉虱不同地理种群遗传分化的最新研究进展，并在世界各国对烟粉虱核糖体ITS1(rDNA ITS1)、线粒体COI（mtDNA COI）基因大量测序的基础上，进一步分析了烟粉虱不同地理种群的遗传分化。根据mtDNA COI和rDNA ITS1基因序列分析的结果，烟粉虱不同地理种群可分为5组，即亚洲组（Asia group）、美洲组（America group）、非洲组（Africa group）、澳洲组(Australia group)、B型/地中海/中东/北非/Ms型组(Biotype B/Mediterranean/Middle Eastern/Northern Africa/Biotype Ms group)；此外，还包括3个没有特定组的种群，即乌干达（Uganda）、科特迪瓦（Ivory Coast和台湾（Taiwan）种群。地理隔离可能是造成烟粉虱不同地理种群遗传分化的最重要驱动力。许多具有入侵性或生物学优势的烟粉虱种群随着人类活动而传入新的地区，造成了严重的经济损失。有必要加强烟粉虱生物型的监测，遏制已入侵烟粉虱种群的蔓延，防止新的具有潜在危险性的烟粉虱种群传入中国。  相似文献   

长角血蜱肠道细菌的分离与鉴定     

李春红  周勇志  赵素华  刘毅  张厚双  曹杰  周金林 《中国预防兽医学报》2011,33(8)

为深入研究肠道细菌在蜱的生理学和传播病原上的作用,本研究进行了长角血蜱肠道细菌的分离鉴定。按照细菌传统分离方法并结合16S rDNA测序鉴定,获得7个分离株,这些菌株分别属于显核菌属(Caryophanon sp.)、考克氏菌属(Kocuria sp.)、葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)、微杆菌属(Microbacterium sp.)和短杆菌属(Brevibacterium sp.)5个菌属。  相似文献   

拮抗酵母菌0732-1的鉴定及其ITS-5.8S rDNA序列分析     

王晓东  李国庆  张莉  葛米红 《北方园艺》2011,(1):146-149

从石河子地区西瓜叶片上分离获得1株对哈密瓜细菌性果斑病菌-燕麦嗜酸菌属西瓜亚种(Acidovorax avena subsp.citrulli)有显著拮抗作用的酵母菌0732-1,对该菌株形态学观察、培养性状观察、生理生化测定,以及结合ITS-5.8S rDNA序列同源性分析。结果表明:酵母菌0732-1为异常毕赤酵母(Pichiaanomala Kurtzman),首次证明了P.anomala对哈密瓜细菌性果斑病菌具有生防作用。  相似文献