Comparative proteomic analysis of cucumber roots infected by Fusarium oxysporum f. sp. cucumerium Owen     

《Physiological and Molecular Plant Pathology》2016

Cucumber Fusarium wilt (CFW), caused by the soil-borne fungus Fusarium oxysporum f. sp. cucumerium, is a serious disease in cucumber (Cucumis sativus) production worldwide. For the efficient control of the pathogenic fungi, a better understanding of its interaction and associated resistance mechanisms at the molecular level is required. Here, we report a comparative proteomics analysis of total root protein isolated from infected cucumber root of susceptible bulk (SB) and resistant bulk (RB) of cucumber generation F2. Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) coupled with MS/MS approaches identified 15 over-accumulated proteins from the RB plants. Identified proteins are mainly involved in defense and stress responses, oxidation reduction, metabolism and transport and other process. These proteins are likely to be a part of resistance-related protein network, playing different roles in cucumber disease resistance. Three vital clues regarding wilt resistance of C. sativus are gained from this study. First, jasmonic acid and redox signaling components were found in response to F. oxysporum infection in resistant plants. Second, the LRR family protein may play an important role in the defense reaction against CFW. Third, biotic and abiotic stress-related proteins were induced by the CFW fungus F. oxysporum, indicating the activation of common stress pathway.  相似文献   

植物细胞核蛋白质组学研究进展     

王思宁  赵琪  戴绍军 《现代农业科技》2013,(5):225-226

细胞核储藏有植物体的主要遗传信息。植物细胞核蛋白质组的动态变化直接影响植物基因表达调控,进而调节植物生长发育与环境应答过程。细胞核蛋白质组学研究为解析植物发育与逆境应答的分子机制提供了重要信息。综述了近年来植物细胞核蛋白质组学研究的进展,以促进其进一步研究。  相似文献   

光温敏雄性不育玉米9417雄穗幼穗期叶片叶绿体蛋白质差异分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

郝勇锋  李维平  王帅  姚伟  周丹平 《河南农业科学》2013,42(1):18-22

为了研究玉米"两用系"9417雄穗不育的分子机制,以玉米光温敏雄性不育系9417的不育和可育2种状态的植株为材料,利用SDS-PAGE、质谱和生物信息学等技术,对其幼穗分化敏感期叶片中叶绿体差异表达蛋白质组进行分离和鉴定。电泳图谱显示,光温敏雄性不育、可育株在雄穗分化发育敏感时期叶绿体表达蛋白至少存在4条显著的差异条带,其中No.1、No.2是可育株中存在而不育株缺失的条带;No.3、No.4是不育株存在可育株中缺失的条带。质谱分析共鉴定出4种蛋白质:①AOL_s00004g466、②luc7-like protein 3-like、③putative T3SS effector EspN2-2、④ABC transporter ATP-binding protein。可育株中No.1为假定蛋白,No.2蛋白的U1-snRNP成分在RNA的加工和修饰中起介导自身与帽结合蛋白相结合的作用;不育株中No.3蛋白具T3SS效应,No.4蛋白在膜上ATP结合区域具单向转运底物的作用。叶绿体出现差异蛋白质,可能与雄性败育、不育有关。  相似文献   

基于组学技术探究甜菜耐盐机理研究进展     

路正禹  王堽  李任任  崔汝菲  耿贵 《中国农学通报》2021,37(15):92-98

为揭示甜菜盐胁迫下的分子响应机制,利用组学技术发现并鉴定关键基因及蛋白,迅速给予甜菜耐盐机理新的依据。本研究综述了转录组学、蛋白质组学、代谢组学、基因组学在甜菜耐盐机理中的研究进展。目前研究指出转录组学、蛋白质组学可筛选出甜菜耐盐关键候选基因,如BvM14-SAMS2、BvM14-glyoxalase I、BvNHX等,并利用基因组学对所发现基因进行验证。同时,探讨代谢组学在甜菜盐胁迫研究中的应用,以期通过代谢产物的定量与定性测量评估基因功能,为甜菜盐胁迫相关研究提供新信息与新思路。下一步应不断深化各组学技术间的融合,强化多学科交叉融合意识并积极创新,以发掘更多优质的甜菜耐盐遗传种质资源与基因资源。  相似文献   

蛋白质组学技术在鱼类安全生产中的应用研究进展     

王任  王彦波  冯立芳  李学鹏  李婷婷  励建荣 《饲料工业》2011,32(6)

鱼类水产品以其独特的营养价值,越来越受到人们的关注,鱼类的安全生产也成为研究的热点。近年来,蛋白质组学技术正被逐渐运用到鱼类安全生产的研究中,尤其是鱼类物种的鉴定、鱼类生鲜食物的理化评价、贮藏加工过程中的品质变化、批次质量差异检验和鱼类产品标准化等方面。鉴于此,本文在介绍蛋白质组学技术的基础上,系统探讨了蛋白质组学技术在鱼类安全生产中的应用研究进展,为鱼类安全生产提供一定借鉴。  相似文献   

Cross comparison of seminal plasma proteins from cattle and buffalo (Bubalus bubalis)     

Viviane Maria Codognoto  Paulo Henrique Yamada  Rúbia Alves Schmith  Felipe Rydygier de Ruediger  Camila de Paula Freitas-Dell’Aqua  Fabiana Ferreira de Souza  Suzane Brochine  Lucas Monteiro do Carmo  Andressa Filaz Vieira  Eunice Oba 《Reproduction in domestic animals》2020,55(1):81-92

The objective of this study was to evaluate seminal plasma proteins from cattle and buffalo (Bubalus bubalis), to identify differences between related species. Sixteen buffaloes and 16 cattle between 30 and 60 months of age were used. Semen collection was performed by electroejaculation, followed by macroscopic and microscopic subjective analyses. After analysis, the samples were centrifuged at 800 g for 10 min, and the supernatant (seminal plasma) was recentrifuged at 10,000 g for 30 min at 4°C. The total protein concentration was determined by the Bradford method, and the proteins were digested in solution for mass spectrometry (nLC-MS/MS). Multivariate statistical analysis was used to evaluate the proteomics results by non-hierarchical clustering the considering exponentially modified protein abundance index (emPAI). Principal component analysis (PCA) and partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) were used for clustering. Proteomics identified 78 proteins, and multivariate analysis showed 4 that were over-expressed in buffaloes (cystatin C, prosaposin, peptide YY and keratin type II cytoskeletal 5) and 9 in cattle (spermadhesin-1, seminal plasma protein PDC-109, ribonuclease 4, metalloproteinase inhibitor 2, acrosin inhibitor 1, seminal ribonuclease, C-type natriuretic peptide, angiogenin-1 and osteopontin). Among the proteins identified in seminal plasma, the C-type natriuretic peptide and metalloproteinase inhibitors were described for the first time in buffaloes. Some protease inhibitors were found over-expressed in buffaloes, and important proteins in seminal plasma of cattle were not identified or were found at lower expression levels in buffaloes, which can contribute to reproductive performance in this species.  相似文献   

组学技术分析肉鸡胚胎发育过程中肝脏蛋白表达的变化   总被引：3，自引：3，他引：0  

彭梦玲  胡文业  李乃馨  王菊花  丁建平  周杰 《畜牧兽医学报》2020,51(2):252-259

旨在探讨肉鸡胚胎在发育中后期肝脏蛋白水平的变化。本试验选取120枚重量为（65±0.2）g的罗氏308肉鸡种蛋,分为14胚龄（E14）和出壳1日龄（H1）两组,每组3个重复,每个重复20枚种蛋。孵化至E14胚龄和H1日龄时,采集肝脏组织样本,应用相对和绝对定量的等量异位标签（isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ）结合生物信息学分析技术筛选核心差异蛋白。结果显示,在E14和H1日龄之间共筛选出10个核心差异蛋白,主要促进脂肪酸降解（上调ACOX1、ACSL1、ACSL5、CPT1A和ECI2）和糖异生（上调ALDH3A2、FBP1、FBP2、GPI和PGM2,下调LDHB和ALDH9A1）。试验结果提示,胚胎发育的主要能量供给途径是脂肪酸降解,而不是糖酵解。此外,糖异生增多,促进糖原储存以应对出壳以及营养环境变化。  相似文献   

基于平行反应监测验证技术分析绵羊胚胎骨骼肌蛋白质组数据     

王欣悦  赵志达  石田培  尚明玉  张莉 《畜牧兽医学报》2020,51(7):1587-1596

旨在对绵羊胚胎骨骼肌蛋白质组学数据进行分析,为阐明绵羊胚胎骨骼肌生长发育机制奠定基础。前期试验应用串联质谱定量法（tandem mass tag,TMT）对成年中国美利奴绵羊妊娠第85（D85）、105（D105）和135天（D135）的胚胎背最长肌进行蛋白质定量,并对D85/D105、D105/D135和D85/D135 3个比较组进行分析。本试验在此基础上,利用KEGG和平行反应监测（parallel reaction monitoring,PRM）等数据分析方法对3个比较组绵羊胚胎骨骼肌上、下调差异丰度蛋白质进行分析和验证,并对候选蛋白质进行生物信息学分析。本研究对肌纤维成熟分化标志性蛋白肌球蛋白重链（myosin-2 isoform X2,MYH）进行PRM靶向定量验证,结果表明,其变化趋势与绵羊胚胎肌纤维成熟分化趋势相符。本研究对上调差异丰度蛋白和下调差异丰度蛋白的KEGG分析结果表明,D105/D85比较组中上调差异丰度蛋白质显著富集于胰岛素等信号通路,D135/D105和D135/D85比较组中下调差异丰度蛋白质显著富集于DNA复制和蛋白质消化吸收等信号通路。与肌肉发育相关的cAMP依赖性蛋白激酶A催化亚基α（PRKACA）和葡萄糖转运蛋白成员4（GLUT4）蛋白均显著富集于胰岛素信号通路中,生物信息学分析显示,这两个蛋白质的理论分子量分别为121.73和20.64 ku,分别有147、12个带正电荷的氨基酸残基和135、12个带负电荷的氨基酸残基;理论等电点分别为8.81和6.54;亲水性平均系数分别为-0.408和0.811;PRKACA蛋白无N端糖基化位点,有45个磷酸化位点;GLUT4蛋白有1个N端糖基化位点,25个磷酸化位点;PRKACA蛋白三级结构与CAMP-2依赖蛋白激酶a嵌合融合的晶体结构相似度为85%,GLUT4蛋白三级结构与人葡萄糖转运蛋白GLUT1的相似性为78%。本研究表明,PRM定量验证趋势与绵羊胚胎肌纤维成熟分化趋势相符,PRKACA和GLUT4蛋白具有丰富的磷酸化修饰位点,并参与胰岛素信号通路调控,是重要的候选蛋白。  相似文献   

梨品种‘玉露香’抗火疫病蛋白质组学分析     

吴瑞瑞  叶云锋  陈松余  徐幼平  楼兵干  蔡新忠 《植物保护》2022,48(6):90-97

由解淀粉欧文氏菌Erwinia amylovora引起的火疫病是一种重要的经济病害,严重影响着全球苹果和梨的生产。E. amylovora 被列为我国重要的检疫性有害生物。然而,植物抗火疫病分子机制尚不够明确。本研究鉴定了梨品种‘玉露香’对 E. amylovora 的抗性,开展了抗性相关蛋白质组学分析。嫩枝穿刺接种分析结果表明,‘玉露香’对 E. amylovora 表现出明显早期抗性。采用高通量蛋白组学分析技术,鉴定获得‘玉露香’和感病品种‘库尔勒香梨’的差异表达蛋白192个,其中包括29个抗病和防卫相关蛋白,13个氧化还原相关蛋白以及1个铜离子转运ATP酶蛋白HMA5。抑菌动态分析结果显示,2 mmol/L Cu2+完全抑制E. amylovora 的生长。本研究为进一步揭示梨火疫病抗性分子机制提供了候选基因。  相似文献   

外源激素影响苦瓜种子发育过程中蛋白表达的初步分析     

黄玉辉  黄如葵  黄熊娟  梁家作  陈小凤  陈振东  冯诚诚  刘杏连  秦健 《广西农业科学》2015,46(4)

[目的]研究外源ABA和GA对苦瓜种子发育过程中蛋白质表达的影响,揭示外源ABA和GA对苦瓜种子蛋白质累积进程调控的生理机制.[方法]以密瘤小果型苦瓜MC26为材料,在花后第5d分别用ABA和GA处理果实,以清水处理为对照;运用双向电泳分析苦瓜种子发育过程中蛋白质组的动态变化.[结果]不同处理中,经ABA处理且花后22 d采收的苦瓜种子蛋白表达量和蛋白条带数均最高,经GA处理且花后28 d采收的苦瓜种子蛋白表达量和蛋白条带数均最低.经GA处理的苦瓜种子蛋白表达量低于对照,而经ABA处理的苦瓜种子中低分子量(18～35 kD)蛋白表达量略高于对照.2-DE图谱分析结果表明,经外源ABA和GA处理的苦瓜种子分别出现23和26个差异表达蛋白质点;其中ABA处理上调表达的蛋白点有13个,下调表达的蛋白点有10个;GA处理上调表达的蛋白点有15个,下调表达的蛋白点有11个.选用表达量明显变化的19个蛋白质点,通过MALDI-TOF-TOF MS分析和数据库检索,成功鉴定出9个差异表达蛋白质点,涉及到胁迫响应、糖酵解、贮藏和未知蛋白等4个功能类别.[结论]ABA和GA处理的苦瓜种子贮藏蛋白的表达与对照存在明显差异,说明外源ABA和GA对苦瓜种子贮藏蛋白累积具有一定的调控作用.  相似文献