扩增SRY基因鉴定牛、羊胚胎性别的初步研究     

吕文发  姚淑珍 《家畜生态》2006,(4)

本研究利用本试验室设计的SRY基因3对常规PCR引物扩增牛SRY基因和羊的SRY基因,结果表明:第2对引物扩增出公牛和公羊基因组的DNA 750 bp左右清晰条带,而母牛、母羊基因组DNA无此扩增条带,说明第2对引物可以应用于牛和羊的早期胚胎性别鉴定;  相似文献   

牛传染性鼻气管炎病毒LUXTM新型荧光PCR检测方法的建立     

陈茹  毕英佐  曹永长  林志雄  赵吟  罗琼  朱道中 《中国预防兽医学报》2007,29(4):303-307

本研究针对牛传染性鼻气管炎病毒（Infectious bovine rhinotracheitis virus，IBRV）高度保守的gC基因设计单标记并具有自身荧光淬灭功能的LUX^TM引物，建立L刚新型实时荧光PCR方法用于快速检测IBRV。该方法对四株IBRV细胞培养物的检测均呈典型阳性反应，而对其它动物疱疹病毒以及健康牛组织DNA和细胞对照的检测结果为阴性，检测时间包括核酸提取仅需1h～2h。试验表明，LUX^TM荧光PCR法对IBRV细胞增殖病毒液的检测敏感性可达0．04TCID50，比病毒分离敏感性至少提高10倍；对10倍系列稀释的纯化IBRV核酸样品，L刚荧光PCR的检测敏感性比常规PCR可提高10^3倍。将病毒液添加到健康牛精液和血液样品中，该荧光PCR可检测到牛冻存精液中40TCID50牛抗凝全血、血清和临床精液中0．04TCID50的病毒，说明对临床样品的检测有效。本研究所建立的LUXTM荧光PCR方法快速敏感，适合应用于活牛及其遗传物质的进出口检疫、养牛业疾病防控等领域对IBRV的快速检测。  相似文献   

基于高通量测序方法的蒙古栎SSR标记开发     

陈罡  于世河  姜义仁  卜鹏图  郑颖  冯健 《中国农学通报》2021,37(16):13-17

为研究蒙古栎遗传多样性,基于Illumina高通量de novo拼接序列数据鉴定10个SSR位点,并利用8个采自辽宁不同地区的蒙古栎样本进行多样性验证。结果表明,这10个新SSR位点具有一定多态性,每个位点的等位基因数为4~6,平均为4.5个,这批针对蒙古栎专门开发的SSR标记对于研究辽宁分布的蒙古栎群体遗传多样性和资源利用将具有很大价值。  相似文献   

基于本地BLAST的高通量引物设计R包（LightPrimer）及其应用     

熊亚俊  陈伊洁  邹娟  张帆 《中国油料作物学报》2022,44(5):1130

引物优劣是PCR反应成败的重要影响因素之一，当前引物设计软件存在通量低、操作复杂、开源性不高等不足。本文开发了一款基于R语言和本地BLAST的针对克隆、qRT-PCR、SNP和InDel标记的高通量引物设计软件（LightPrimer）。该软件通过序列信息从基因组当中提取特定序列，进行片段化处理，然后将片段与基因组进行本地BLAST比对，通过序列特异性指数和比对位点数筛选高特异性片段，然后对Tm值、GC含量、扩增片段长度、引物长度、引物3'末端匹配、末端GC碱基和引物二聚体进行筛选，得到候选引物列表，并通过序列评价诊断图为引物优化提供参考。该软件具有高通量、操作简便、跨平台、开源等特点，可为现有引物设计软件提供有益补充。软件可从github下载（https://github.com/YangtzeSoyGDB/LightPrimer.git）。  相似文献