肠道微生物与宿主遗传背景互作关系的研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

谭振  翟丽维  陈少康  刘会杰  王楚端 《中国畜牧杂志》2016,(5):84-88

哺乳动物的肠道寄居着大量而且种类繁多的微生物,它们受到宿主基因和环境尤其是食物的影响。近年来,随着宏基因组的出现和测序技术的不断发展,关于人和其他动物的肠道微生物研究日益深入。肠道微生物与人类肥胖和Ⅱ型糖尿病相关性的发现等,进一步加强了科学界对于肠道微生物的关注度。然而,对于肠道微生物与宿主的密切联系以及相互作用机制仍然需要深入研究。本文简要论述了肠道微生物对宿主的功能贡献和宿主的遗传背景对肠道微生物的影响。  相似文献   

不同规模工厂化养猪的成本及效率分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

吕军  刘怡冰  翟丽维  邢凯  王楚端 《中国畜牧杂志》2020,(2):169-173

我国生猪养殖规模和水平参差不齐,本文以26家规模化猪场为研究对象,其中包括规模Ⅰ(2000头以下基础母猪)3家、规模Ⅱ(2000~3000头基础母猪)3家、规模Ⅲ(3000~4000头基础母猪)4家、规模Ⅳ(4000头以上基础母猪)16家,比较不同养殖规模工厂化养猪场的生产成本和生产效率。结果表明:不同规模的工业化猪场在生产成本与生产效率方面有显著差异。随着规模增加,生长育肥期饲料成本、兽药疫苗、固定资产折旧及人工费用降低,生长育肥阶段成本明显下降,出栏猪成本与规模呈现负相关。仔猪哺乳及仔猪保育阶段对管理水平要求较高,随着养殖规模增大,管理难度相应加大,需要强调实施精细管理,以维持平均每头基础母猪年提供断奶仔猪头数(PSY)以及平均每头基础母猪年提供出栏猪头数(MSY),达到最大限度的规模效益。  相似文献   

猪EPOR和MYPN基因SNPs检测及其与肉质、胴体性状关联分析     

杜东升  翟丽维  徐丹丹  王楚端 《中国畜牧兽医》2009,36(10):80-84

对EPOR、MYPN 2个候选基因进行SNPs检测,并与肉质性状的关联分析,以期为分子育种提供依据.采用PCR-SSCP及PCR-RFLP方法对目的基因片段进行SNPs检测,结果显示,在研究群体内,EPOR基因不存在SNP,而MyPN基因存在2个SNP.用SAS软件对MyPN基因的2个SNP位点与部分肉质、胴体性状进行关联分析,结果表明,在本试验群体中,SNP1对背膘厚、导电性、眼肌面积和肌内脂肪的影响都达到了显著水平(P<0.05);SNP2对其中的背膘厚和肌内脂肪含量影响达到了显著水平(P<0.05);另外性别、品种对部分性状也有较大影响(P<0.05).结合本研究结果和其它相关研究结果,可以推断MYPN基因可能是影响肉质、胴体性状的主效基因或与控制这些性状的主效基因连锁,可以作为肉质、胴体性状的候选基因.  相似文献   

RNA-seq数据差异表达分析流程比较     

赵延辉  陈少康  翟丽维  侍玉梅  原佳妮  盛熙晖  齐晓龙  郭勇  王楚端  邢凯 《中国农业大学学报》2023,28(6):153-159

为选择出合适的基因差异表达分析流程,本研究基于松辽黑猪和长白猪脂肪转录组数据,对TopHat2、HISAT2、STAR3种比对工具以及DESeq2、edgeR、limma 3种差异表达基因筛选工具的性能进行分析,并结合KEGG通路富集结果进行综合评价。结果表明：1)HISAT2拥有最快的运行速度,STAR拥有最高的唯一比对率。经综合考虑,本研究选取HISAT2数据进行后续差异表达基因筛选分析。2)DESeq2筛选出616个差异基因,edgeR筛选出890个差异基因,limma筛选出829个差异基因,三者有246个差异基因重合。3)DESeq2、edgeR、limma的上调差异表达基因分别富集到110、108和142条通路,其中有72条通路重合,而下调差异表达基因分别富集到190、247和177条通路,其中有158条通路重合。本研究推荐使用HISAT2进行基因组比对。当研究不存在生物学重复时,推荐使用edgeR进行差异表达基因筛选。而为了减少分析过程中的假阳性,可以选择DESeq2或者两个及以上工具的差异表达基因的交集。本研究将有助于研究人员从转录组数据中获得更好、更全面的生物学见解。  相似文献   

母猪FcRn基因多态性及其对初乳中IgG含量的影响     

王炳艳  王立贤  王婷  翟丽维  王楚端  李振宽  周伟良 《畜牧兽医学报》2007,38(8):765-768

对猪IgG C片段受体基因(FcRn)的单链构象多态性进行分析,在FcRn基因Site1位点即第3外显子的147处碱基发现T突变为C和在Site6位点即第6外显子的1 040处碱基发现C突变为G,其中外显子6的碱基突变使苏氨酸变为精氨酸。在3个品种207头母猪样本中检验多态位点和初乳中IgG含量的相关性,建立固定效应模型进行最小二乘分析,对不同基因型的初乳中IgG含量进行差异显著性检验。结果表明:试验群体中Site1位点的突变对初乳中IgG含量没有显著影响(P>0.05),Site6位点的突变对初乳中IgG含量有显著影响(P<0.05),多重t检验结果表明Site6位点不同基因型的初乳中IgG含量差异显著(P<0.05):CC型的初乳中IgG含量最高,DD型的初乳中IgG含量最低,说明FcRn基因可以作为猪初乳中IgG含量的候选基因之一。  相似文献   

系统分析肝脏转录组解析猪脂肪沉积的分子调控机制     

邢凯  翟丽维  侍玉梅  沈奥  曹永春  王楚端  白立景 《中国畜牧杂志》2022,(8):29-35

肝脏是调控猪能量平衡和代谢的重要器官。本研究选择松辽黑猪和长白猪背膘厚度显著差异的个体（每个品种内高、低各3头）为研究对象，利用高通量转录组测序技术鉴定其肝脏组织中基因的表达水平并进行差异表达分析，进一步对差异表达基因进行生物学功能分析。结果表明，在不同背膘厚度的比较中，共发现差异表达基因395个，其中部分参与了花生四烯酸代谢、谷胱甘肽代谢、P450细胞色素代谢过程、脂肪酸代谢、胰岛素抵抗、皮质醇的合成和分泌等通路。ACACA、ELOVL6、OGDHL、GSTO2、GGT5、CREB3L1等基因是肝脏中调控脂肪合成和代谢的关键基因。在不同品种猪中，鉴定出458个差异表达基因，显著富集在PPAR信号通路、细胞色素P450代谢通路、甘油三酯代谢通路、胆汁酸合成、MAPK信号通路、免疫相关通路等通路。PPAR信号通路和CD28、CD59、ICOS、CXCR4、FOS、INF等基因是影响不同品种猪生长性能和免疫性状差异的关键通路和基因。品种内与品种间脂肪沉积差异的分子机制并不相同。本研究对猪脂肪性状的遗传改良、肝脏功能解析有一定意义。  相似文献