中国新发L1A PRRSV变异株的出现与流行状况分析     

许浒  龚帮俊  李超  孙琪  李宛生  赵静  郭镇洋  李金昊  张思钰  相丽润  彭金美  王倩  周国辉  冷超粮  汤艳东  赵鸿远  安同庆  蔡雪辉  张洪亮  田志军 《中国预防兽医学报》2023,(8):779-786

2017年我国首次发现类NADC34 PRRSV，该类病毒属于L1A (Sublineage1.5)亚型。近年来，新发类NADC34 PRRSV在我国不断变异，已经成为危害我国养猪业重要的PRRSV亚型。为了确定新发类NADC34 PRRSV的流行特征，本研究从2021年～2023年37份新发类NADC34 PRRSV阳性病料样品中选择4份样品经PCR分段扩增PRRSV全基因组序列并测序，利用Seq Man软件拼接，获得了4株完整的PRRSV全基因组序列，相应的病毒分别命名为TZJ2165、TZJ2451、TZJ2756、WK621株。下载GenBank中所有中国类NADC34 PRRSV和美国L1C变异株的ORF5基因及NSP2基因序列，利用MEGA7.0构建上述PRRSV ORF5基因序列的遗传进化树，分析其遗传变异情况。利用Megalign软件分析各分支内ORF5基因序列的相似性，以及新发类NADC34 PRRSV NSP2氨基酸序列，分析其是否存在一致的氨基酸缺失特征。根据PRRSV ORF5基因的限制性片段多态性(RFLP)分类方法，对新发类NADC34 PRRSV的ORF5...  相似文献   

基于16S rDNA高通量测序技术分析受水灾影响猪场水样的菌群特征     

洪勃  孙琪  李栋凡  于学祥  库旭钢  何启盖 《畜牧兽医学报》2023,(5):2092-2100

2021年7月，河南省部分地区突发特大水灾，致使受灾区域内的猪场损失惨重，本研究旨在探究水灾发生后猪场水样中存在的病原菌，为猪场防控可能出现的疾病提供技术支撑。通过实地采样和委托采样的方式，获得了26个受灾猪场中的48份水样，包括19份猪饮用水、22份场内积雨水和7份废弃污水，采用菌落计数和高通量测序技术，对样品的细菌总数和菌群丰度进行分析研究，同时对采集的水样开展消毒剂杀菌试验。结果发现：饮用水、积雨水和污水中的平均含菌量分别为1.55×10⁵、1.88×10⁸和3.70×10⁹ CFU·mL^-1,其中污水中的细菌总数最多，其次为积雨水，饮用水中的细菌总数最少，但远超国家饮用水的安全标准。本研究在不同种类的水样中均检测到了链球菌属、埃希氏杆菌属、弓形杆菌属、不动杆菌属和假单胞菌属等潜在的致病菌属，以及嗜低温弓形杆菌、猪链球菌、大肠杆菌、鲍曼不动杆菌和豚鼠气单胞菌等致病菌。杀菌试验显示，氯制剂终浓度达到2 500mg·L^-1,作用30 min即可杀灭积雨水和污水中所有的细菌。本...  相似文献