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在露地或棚室黄瓜的生产中,霜霉病,角斑病两种病害的发生机率非常大。尽管两病的防治不是多么困难,但这两种病害的初期病征非常相似,往往使人不容易准确识别,以致于防治起来张冠李戴,南辕北辙。如何快、早、准的正确判断,成了有效防治两病的关键所在。霜霉病属真菌性病害,角斑病属细菌性病害。病原菌的不同会导致两病症状根本上的不同,只要掌握二者的规律,经过细心的观察,两病的区别会一目了然,请看下表: 相似文献
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本研究以猪卵泡为模型,探讨雌二醇(E2)经由STAT3调控生存蛋白(SURVIVIN)转录的非基因组途径,参与调控凋亡的分子机制。根据外观形态将卵泡分类,分别测定优势化卵泡与闭锁卵泡液中E2浓度。结果发现:E2在健康卵泡液中的含量极显著高于早期闭锁和晚期闭锁阶段(P0.01)。通过荧光定量Real time-q PCR和Western Blots检测卵泡不同发育阶段颗粒细胞中STAT3/SURVIVIN m RNA和蛋白水平,结果显示:SURVIVIN和STAT3在健康卵泡的颗粒细胞中的表达量极显著高于闭锁卵泡(P0.01),并随着闭锁程度的加剧呈现出逐渐递减的表达趋势。通过原代培养颗粒细胞中外源添加不同浓度E2(10-5、5×10-5、10-4 mol/L)检测相关基因蛋白表达水平的变化,结果显示:随着E2浓度的增加,STAT3的磷酸化水平也相应增加,其靶基因SURVIVIN的表达量却没有受到活化的STAT3影响。由此可见,E2能够通过上调STAT3的表达参与调控卵泡闭锁的发生。 相似文献
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苏尼特羊全基因组选择信号检测 总被引：1，自引：0，他引：1
【目的】选择信号是物种在进化过程中,经历长期的自然和人工选择在基因组上所留下的印迹。选择信号检测不仅能反映选择对品种培育的作用,还可以作为重要经济性状QTL定位的一个有效方法。苏尼特羊是中国内蒙古地区一个优良的地方绵羊品种,适应于恶劣的戈壁自然环境条件。对苏尼特羊全基因组选择信号检测,不仅能够寻找受正向选择（positive selection）相关的候选基因,揭示重要经济性状的遗传机制,还能为苏尼特羊品种培育过程中受正向选择的性状所经历过长期的人工选育提供遗传学证据。【方法】基于Illumina Ovine SNP50K芯片利用基于单倍型信息的单倍型积分值（integrated haplotype score, iHS）方法对苏尼特羊进行全基因组选择信号检测。首先对SNP芯片数据进行经过质控和单倍型推断后,共剩余42 616个SNP标记用于连锁不平衡（linkage disequilibrium, LD）分析和单倍型推断。然后按照祖先等位基因信息进一步筛选后得到30 537个SNP标记估计用于选择信号检测iHS值,并再以500kb长度作为为一个窗口进行划分一个选择区段,计算窗口内iHS均值,然后进行显著性检验。对具有显著|iHS|值的选择区段基因组区域进行基因注释,并对所检测的候选基因进行GO富集分析。【结果】构建了苏尼特羊的连锁不平衡衰减图谱,发现LD值随着两标记间距离的增大而减小,但也发现某些远距离标记之间存在较高水平的连锁不平衡。通过iHS方法在全基因组范围内共检测到204个具有选择信号的基因组区段,这些区段内与845个候选基因紧密相关。其中有与绵羊角的缺失相关的RXFP2基因,调控一系列控制绵羊毛色基因的ASIP,参与机体神经系统发育的HTR4和SOX10,与胚胎时期神经嵴发育密切相关的SOX10,可以激活骨调控中转录因子12进而调节骨骼发育的E2F2,对骨骼与肌肉的发育和形成相关的PLA2G6,促进核糖体蛋白合成的RPL7基因,与绵羊肺气肿相关性的POL,以及调节机体的先天性免疫功能和适应性免疫应答反应的MATR3。此外,还包括与神经系统发育和疾病相关的ZWINT、PPP1R1B、GPR98、LUC7L3、CAPZA1和MYT1L等。通过生物信息学分析发现与生物学过程相关的有24个GO条目、分子功能相关的有4个GO条目,和细胞组分相关的有3个GO条目。这些GO条目主要与蛋白质合成、大分子物质代谢降解过程和蛋白质的靶向运输、分子活性和核糖体组分以及在核糖体亚基相关。【结论】构建了第一张中国绵羊品种的连锁不平衡图谱和全基因组选择信号图谱。在全基因组范围内检测到与选择相关的重要经济性状的候选基因,其中部分候选基因在绵羊驯化过程中具有非常重要的意义,为进一步了解绵羊的人工选择过程提供了重要的参考依据,也为中国绵羊品种的培育提供了理论基础。 相似文献
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【目的】基于前期绵羊肉用性状GWAS研究结果,旨在探讨RIPK2基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响,找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记,同时对GWAS结果进行验证。【方法】在343只乌珠穆沁绵羊试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成池DNA,设计引物对RIPK2基因外显子及其上下游1 000bp的调控区进行PCR扩增,PCR产物检测为目的条带后测序。使用DNAMAN和Chromas2软件对测序峰图进行分析,采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点及前期GWAS得到的SNP位点进行基因型分型。使用Haploview软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用SPSS （22.0）软件进行RIPK2基因SNP位点与生长性状间的关联分析。【结果】共发现了4个多态位点,A5536G的同义突变rs01位于第四外显子内,在该位点检测到三种基因型,AA基因型频率为0.42,AG基因型频率为0.45,GG基因型频率为0.13,优势等位基因为A,其频率为0.65;在第七外显子上检测到T8952C错义突变rs02,在该突变位点检测到3种基因型,其中TT基因型频率为0.82,TC基因型频率为0.16,CC基因型频率为0.02,T为优势等位基因,基因频率为0.9;在第十外显子检测到 T2836C的突变rs05,在该位点检测到两种基因型TT和CC,没有检测到杂合子基因型,TT基因型频率为0.25,CC基因型频率为0.75;上游调控区发现一个G5181C的突变rs30,有3种基因型,其中GC基因型频率为0.50,CC基因型频率为0.18,GG基因型频率为0.32,G为优势等位基因,其频率为0.58; GWAS得到的SNP位点是T4456C,在本研究中被命名为rs34,在该位点有3种基因型,其中TT基因型频率为0.49,TC基因型频率为0.37,CC基因型频率为0.14,优势等位基因T的频率为0.68。χ2适合性检验发现,除rs34位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05)。rs02位点处于低度多态(PIC＜0.25),其余位点处于中度多态(0.25＜PIC＜0.5)。连锁不平衡分析发现,rs01和rs02位点强连锁,在群体中共构建了3种单倍型,AT 为优势单倍型,其频率为0.645,这两个位点共构建了6 种基因型组合,其中AATT为优势基因型组合,频率为0.425。单标记关联分析表明：rs01位点的AA、AG基因型的个体和GG基因型个体在4月龄体重、胸围上差异显著（P＜0.05）,在6月龄体高、胸围上差异显著(P＜0.05)。rs02位点CC基因型个体在4月龄体重、体高、胸围和6月龄胸宽上显著优于TT、TC基因型个体（P＜0.05),在4月龄体斜长、6月龄体高和体斜长上极显著优于TT、TC基因型的个体（P＜0.01）。rs30位点上,GG基因型的个体在4月龄体重、胸围与其他两种基因型个差异显著(P＜0.05),3个基因型的个体在6月龄胸围上均有显著差异（P＜0.05）。rs34位点的3个基因型的个体仅在4月龄体重上差异显著(P＜0.05)。rs01-rs02组合基因型关联分析发现：GGCC基因型组合的个体在4月龄体重、体高、体斜长、胸围上与其他基因型之间差异显著（P＜0.05）,GGCC基因型组合的个体在6月龄体高、体斜长、胸宽上与其他基因型组合的个体差异显著（P＜0.05）。【结论】RIPK2基因对绵羊生长性状具有较显著的影响,其SNPs作为分子标记对乌珠穆沁绵羊生长性状的选育具有一定的指导意义。 相似文献
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赵福平 《国外畜牧学(猪与禽)》2005,25(2):17-20
过去十年由于猪基因组图谱的巨大进展,为猪遗传学家和育种学家产生了新的研究方法。现在猪遗传连锁图谱已有近5000个座位,其中包括好几百个基因、微卫星标记和扩增片段长度多态性(AFLP)标记。物理遗传图谱使用体细胞杂交克隆板和辐射杂交克隆板等方法也迅速地发展,已有4000多个基因和标记。科学家对外来品种和商品猪种进行数量性状座位(QTL)扫描和候选基因分析,已鉴定出大量与生长速度、瘦肉量、饲料消耗、肉质、窝产仔数和疾病抗性有关的染色体区域和单个基因。使用标记选择(MAS)的商品猪场也积极地将这些基因标记与常规的性能信息联合起来以便提高猪生产中经济重要的生产性状。现在研究已经使用新的研究方法,包括猪基因阵列和前沿的生物信息,这些方法能够用来找到新的候选基因以及加快对猪基因功能的了解。猪基因组测序的研究已经启动,更深一层的测序现在也正在考虑中。本综述了猪基因组研究进展和将来研究的方向以及涉及猪行业和人类的健康。 相似文献
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呼伦贝尔羊重要脂肪相关基因mRNA差异表达分析 总被引：1，自引：1，他引：0
旨在基于前期尾部极端大小呼伦贝尔羊的尾部脂肪转录组测序研究结果,选择10个重要的脂肪相关基因,研究其在不同组织中的表达情况,进一步验证这些基因与绵羊脂肪代谢的关系。本研究利用实时荧光定量方法检测CFD、PLIN4、THY1、IL-18、PTPN11、LPL、IRX3、HOXA10、MID1IP1、UGCG基因在6月龄呼伦贝尔羊大尾和小尾品系7种组织(尾部脂肪、臀部脂肪、皮下脂肪、肾周脂肪、网膜脂肪、肝、肌肉)中mRNA的表达差异。研究结果表明:1)10个基因除了在肌肉中存在痕量表达外,在其他各个组织均有表达,而且在不同品系间的一个或多个组织中的表达量存在显著差异。2)IRX3和UGCG基因在大尾羊品系尾部脂肪组织中的表达量均极显著低于小尾羊品系(P0.01),表明这两个基因与绵羊尾部脂肪代谢有直接关系。3)PLIN4和PTPN11基因在各个组织的表达趋势相近,且在大尾羊品系的皮下及网膜脂肪组织的表达量极显著高于小尾羊品系(P0.01),而THY1基因与它们的表达趋势正好相反,在大尾品系皮下及网膜脂肪的表达量显著低于小尾羊品系(分别为P0.01,P0.05)。4)LPL基因只在小尾羊的臀部脂肪组织的表达量极显著高于大尾羊(P0.01);仅有CFD基因在肝中高表达,并在大尾羊中的表达量极显著高于小尾羊(P0.01),而其他基因在肝中低表达或者痕量表达;HOXA10基因仅在肾周脂肪组织中高表达,并且在大尾羊中的表达量极显著高于小尾羊(P0.01)。研究结果可为阐明绵羊脂肪代谢的分子调控机理提供参考。 相似文献
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伐区装车场合理位置及设备最佳配备可看作是以综合成本最低为目标函数的线性规划问题。本文所建立的优化模型,在内蒙古金河林业局某作业区进行了验证,结果表明,优化后的新系统伐区综合成本比旧系统降低了16.6％,经济效果明显。 相似文献
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用随机回归模型对507头中国荷斯坦奶牛的第1胎日产奶量进行了分析，将时间配合勒让德多项式作为自变量，再用平均信息约束最大似然法（AIREML）进行估计。然后通过协方差函数对时间轴上的时间点间估计协方差值，再用Excel绘制三维图。结果表明：配合M6-5-10时，能对月间隔的测定日产奶量数据进行分析，并能反映出整个时间轴上的加性遗传效应和永久环境效应的变异，且能得到光滑的三维图形。降价配合涉及的参数比较少，同时能够很好地缓和协方差函数估计值间的差异。 相似文献
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本试验利用Illumina OvineSNP50 BeadChip芯片对71只苏尼特羊进行了分型,共检测到134个拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVR),大小范围为29.48 kb~1.30 Mb之间,总长度达到25.95 Mb。基因注释及功能分析结果显示,这些基因与嗅觉感官知觉、化学刺激的感官知觉、感官知觉、识别等环境应答有关。选取5个CNVR进行qPCR验证,其中3个CNVR得到验证。通过对苏尼特羊基因组拷贝数变异的分析可以进一步了解绵羊基因组结构的特点,为今后开展绵羊基因组结构变异与重要经济性状的关联研究提供参考。 相似文献