刺参响应灿烂弧菌侵染的基因组DNA甲基化水平和转录组差异及其关联分析          下载免费PDF全文

李欣容  廖梅杰  李彬  荣小军  畅孟阳  王印庚  于永翔  张正  范瑞用  刘清兵 《渔业科学进展》2022,43(3):176-185

为探讨病原菌胁迫下刺参(Apostichopus japonicus)基因组DNA甲基化水平和转录组表达的差异,本研究采用人工攻毒侵染胁迫,获得刺参化皮体壁组织,并以未攻毒组的健康体壁组织为对照,对刺参2种体壁组织进行全基因组甲基化测序(WGBS)和转录组高通量测序,解析刺参体壁基因组DNA甲基化差异,筛选响应病原胁迫的差异甲基化区域和差异表达基因。同时,通过基因组甲基化和转录组联合分析,筛选负相关关联基因,为解析刺参响应灿烂弧菌(Vibrio splendidus)侵染的分子机理提供基础数据。结果显示,刺参对照组和侵染组基因组总甲基化水平分别为(3.59±0.04)%和(3.87±0.27)%,侵染组甲基化水平显著升高;在发生甲基化的位点中,攻毒组和对照组的mCpG占比分别为83.06%和81.91%,mCpG为最主要的甲基化形式。本研究共筛选出差异甲基化区域(DMRs) 626 677个,注释到23 706个功能基因。转录组测序共检测到29 290个基因,筛选到差异表达基因496个,其中,上调基因214个,下调基因282个。在基因组甲基化与转录组的关联分析中,筛选到180个负相关关联基因,其中,差异甲基化区域位于启动子区域的负相关基因为60个。对负相关关联基因的GO和KEGG富集分析,筛选到相关通路和LRR、hsp20和CARD等关键基因。本研究将为解析刺参抗病的表观遗传调控机制提供数据,也为刺参抗病性状选育提供科学参考。  相似文献   

一株感染深水网箱养殖许氏平鲉的病原菌分离与鉴定   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

王凯  王印庚  姜勇  张正  于永翔  廖梅杰 《渔业科学进展》2019,40(1):119-126

2016年7月,山东省长岛县深水网箱养殖许氏平鲉(Sebastes schlegeli)暴发严重皮肤溃疡症。作者对病鱼进行病原菌分离。通过形态学观察、常规生理生化试验、gyrB和16S rDNA基因克隆测序等方法对分离菌株进行鉴定。在病灶溃疡处分离到一株绝对优势菌BZ01,该菌株在TSB固体培养基上呈半透明菌落,在TCBS选择性培养基上菌落呈绿色。透射电镜观察为短棒状,具有单根极生鞭毛。人工回接感染证明,该菌株对许氏平鲉具有较强的致病力,可以引起皮肤溃疡等症状,且与自然感染症状一致,其LD₅₀为2.07×10~6 CFU/ml。通过gyrB和16S rDNA基因序列测定并构建系统发育树显示,菌株BZ01与弧菌属同源性最高,并在系统发育树中与轮虫弧菌(Vibrio rotiferianus)聚为一枝,结合形态及生理生化表型测定结果,将该菌株鉴定为轮虫弧菌(V.rotiferianus)。药敏试验结果显示,该菌株对四环素类、喹诺酮类、香豆素类、肽酰转移酶类高度敏感,而对大环内酯类、多肽类、磺胺类、β-内酰胺类、氨基糖苷类中度敏感或不敏感。  相似文献   

刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析          下载免费PDF全文

刘安然  廖梅杰  李彬  王印庚  荣小军  张正  范瑞用  陈贵平 《渔业科学进展》2019,40(1):101-109

本研究在前期构建的刺参(Apostichopus japonicus)高密度遗传连锁图谱和QTL分析的基础上,筛选出26个与体长、体重、体宽、棘刺总数、抗病力相关的SNP位点,设计出可用于HRM检测的SNP扩增引物13对。在扩大群体中利用HRM小片段法对这13个刺参重要经济性状相关的候选SNP位点进行分型和多态性检测,并结合扩大群体的相关性状数据进行了QTL位点验证。多态性结果显示,13个位点中有3个单态性位点,其余10个多态性位点中有3个位点为低等位多态性,7个位点为中等位多态性。10个多态性位点的最小等位基因频率(MAF)介于0.016(SNP113)~ 0.332(SNP160)之间,平均值为0.173;各位点的观测杂合度(Ho)介于0.031(SNP113)~0.818(SNP9)之间,平均值为0.433;期望杂合度(He)介于0.031(SNP113)~0.834(SNP9)之间,平均值为0.402;多态信息含量(PIC)介于0.030(SNP113)~0.393(SNP160)之间,平均为0.248,有6个位点偏离Hardy- Weinberg平衡。QTL验证结果表明,SNP40和SNP160位点为与生长(体长、体重、体宽)相关的位点,各位点的优势基因型分别为SNP40(CC)和SNP160(AA);SNP88、SNP112和SNP126这3个位点为与抗病力相关的位点,各位点的优势基因型为SNP88(CC)、SNP112(AA)和SNP126(TT)。基于这5个位点构建生长和抗病二倍型,发现二倍型K1(CC AA TT)抗病力最强,S1(CC AA)、S3(CC AC)在生长方面优势显著,相关研究结果可为分子标记辅助育种在生产中应用提供基础数据。  相似文献   

高粱SbSBP15基因的克隆及分析     

冯明  杨睿  张正  张彦琴  常建忠 《分子植物育种》2023,(18):5929-5936

SBP-box (squamosa promoter binding protein, SBP)基因编码一类绿色植物特有的转录因子,它与器官大小的控制、株型、激素和逆境响应等植物重要发育过程密切相关。本研究克隆了高粱SbSBP15基因,对其进行了序列分析、系统进化分析及表达分析。SbSBP15基因编码一个由409个氨基酸组成的蛋白质,含有3个外显子和2个内含子,其SBP结构域位于96～165 aa区域;系统进化显示19个SBP15蛋白可分为4组(Ⅰ～Ⅳ),其中第Ⅰ～Ⅲ组内仅有单子叶植物蛋白,而第Ⅳ组中同时包含有单子叶植物蛋白和双子叶植物蛋白。Sb SBP15与玉米Ub2和Ub3关系最近;启动子序列分析表明,SbSBP15启动子的顺式作用元件包含逆境响应、组织特异性表达以及植物生长发育等相关元件;SbSBP15基因在花后10 d的种子中表达量最高,是苗期根部表达量的18倍;但是随着高粱种子不断发育,SbSBP15表达量逐渐降低,表明SbSBP15可能参与高粱种子发育的过程。本研究为进一步探索SbSBP15的生物学功能奠定了基础。  相似文献   

生物柴油的现状与发展前景   总被引：14，自引：0，他引：14  

姜楠  张正 《世界农业》2005,(3):50-52

柴油作为一种重要的石油炼制产品,在各国燃料结构中占有较高的份额,已成为重要的动力燃料。随着世界范围内车辆柴油化趋势的加快．未来柴油的需求量会愈来愈大,而石油资源的日益枯竭和人们环保意识的提高,大大促进了世界各国加快柴油替代燃料的开发步伐．尤其是进入20世纪90年代,生物柴油以其优越的环保性能受到了各国的重视。  相似文献   

新时期促进知识产权保护事业发展的对策   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈令梅  赵海军  张正  王翠萍 《山东农业科学》2005,(6):65-66

从阐述知识产权制度对促进科技进步、经济社会发展的重要作用入手,介绍了我国知识产权保护现状;从树立知识产权保护观念、设立专业管理机构和建立激励制度、重视知识产权开发和合理分配利益、健全制度和法律维权四个方面探讨了我国加强高等院校、科研院所知识产权建设的对策。  相似文献   

新疆盐生植物——盐地碱蓬简介     

宫江平  张正  田长彦  王黎  赵振勇  荆卫民  张福海  张科 《新疆农垦科技》2019,(2)

本文对盐生植物——盐地碱蓬的形态特征、生长环境及分布范围进行了介绍,并从整地、施肥、播种、灌溉及田间管理等栽培技术与生产前景和应用价值方面进行了详细阐述。  相似文献   

多经路正兴     

张正有 《农电管理》1995,(1)

多经路正兴我局于１９８７年３月成立了劳动服务公司。企业性质为：全民所有，集体经营，自负盈亏，照章纳税的经营方式。当时，是一无流动资金，二无设备，仅组织七人开展业务，以＂安置型＂、＂福利型＂为目的，主要经销电力器材和开展电度表修校业务。为使多经工作步入...  相似文献   

促进中国花生行业协会发展的思考     

杨萍  张正  崔太昌  贾曦 《农村经济与科技》2013,24(7):83-85

建立符合国际标准和适应市场经济环境的花生行业协会,对于我国花生产业的发展具有重要意义。在行业协会基本理论的基础上,分析了促进中国花生行业协会发展的必要性和我国现有花生行业协会发挥的作用及不足,据此提出了促进中国花生行业协会发展的对策建议。  相似文献   

基于信息平台的农产品质量安全监管体系建设研究     

马晨  李瑾  张正 《北方园艺》2015,(12):198-205

在对北京市大兴区质量安全监管部门、农户进行调研的基础上,阐述了农产品质量安全监管平台建设的目标与技术基础,深入分析了北京大兴区基于信息平台的农产品质量安全监管体系建设情况,梳理了当前大兴区农产品质量安全监管中存在的问题。研究发现,虽然目前大兴区在农产品质量安全监管工作取得了很大的进步,但仍存在不少问题,农产品质量安全监管技术、农产品质量安全监管效力还有待提高。  相似文献