黄鳍鲷肌肉中弹性蛋白酶基因全长克隆及生物信息学          下载免费PDF全文

钟婵  吴国平  舒梅  孙乐常  曹敏杰 《水产学报》2021,45(1):125-135

研究表明弹性蛋白酶(elastase, Ela)参与调控嗜水气单胞菌引起的细菌性溃疡病,对控制鱼类养殖中免疫疾病有重要作用。本研究根据已报道脊椎动物的Elas基因序列设计特异性引物,通过RT-PCR和RACE技术克隆获得黄鳍鲷Ela基因(AlEla)cDNA序列全长,并对其进行生物信息学分析。结果显示,AlEla基因全长为946 bp,包含807 bp的开放阅读框,编码269个氨基酸,含有16个氨基酸信号肽的亲水性稳定膜外蛋白,定位于细胞外基质,具有3个O-糖基化和15个磷酸化的潜在位点。编码的成熟AlEla蛋白预测相对分子质量27 509 u,等电点为6.05。氨基酸序列同源性比对发现,AlEla与鲷和鲆的Elas2的同源性为84.76%～99.26%,处于系统进化树上同一分支,表明它们的亲缘性相近。AlEla具有Elas的保守结构,如Tryp-SPc结构域、丝氨酸蛋白酶催化三联体、保守的半胱氨酸残基以及在C端含有GDSGGPL序列等,揭示该酶有丝氨酸蛋白酶的催化活性。对AlEla蛋白的二级结构分析显示,α-螺旋、β-转角、β-折叠和无规则卷曲所占的比例分别为17.84%、7.06%、24.54%和50.56%。三级结构分析推测α-螺旋和β-折叠对于AlEla蛋白的空间构象可能有着重要作用。本研究从黄鳍鲷肌肉中成功克隆AlEla基因并分析其生物信息学特征,为后续研究AlEla参与调控鱼类免疫疾病的机制提供理论基础。  相似文献   

绿鳍马面鲀鱼皮特性及制革应用分析     

胡琼  潘鲁莹  王晓然  孔青  边力  李凤辉  常青  刘长琳  陈四清  臧汝瑛 《安徽农业科学》2023,(22):193-196

绿鳍马面鲀鱼皮作为加工副产品，通常被当作废弃物处理，不仅浪费资源还会污染环境。该研究认为，绿鳍马面鲀鱼皮拥有易完整剥离、来源稳定、外观独特、轻薄柔软、透气防水性好等优良制革特性，其中鱼皮平均约占体重的6.5%,100万t鱼可产生64 963 t鱼皮，1.42亿m²制革量，鱼皮革以100元/m²价格计算，价值高达142亿元。故绿鳍马面鲀鱼皮制革可开辟一个新产业，将鱼皮变废为宝，提高绿鳍马面鲀的附加值，对促进绿鳍马面鲀产业持续健康发展、保护环境具有重要的意义。  相似文献   

基于脂肪酸分析的太平洋黄鳍金枪鱼营养生态位研究     

周成  杨旭  杨报国  王少琴 《中国水产科学》2023,30(10):1202-1213

黄鳍金枪鱼(Thunnus albacares)是生态系统中的顶级捕食者, 是海洋生态系统能量流动及物质循环的重要一环。为研究太平洋黄鳍金枪鱼在个体发育过程中的摄食变化以及不同海域营养生态位差异, 根据 2019 年东太平洋和 2021 年中西太平洋海域金枪鱼渔船采集的黄鳍金枪鱼样本, 对其肌肉的脂肪酸组成及特征进行了分析研究。结果显示, 黄鳍金枪鱼肌肉检测出 34 种脂肪酸, 包括 16 种饱和脂肪酸(SFA), 8 种单不饱和脂肪酸(MUFA), 10 种多不饱和脂肪酸(PUFA)。黄鳍金枪鱼肌肉脂肪酸中 SFA 含量与 PUFA 含量呈负相关, MUFA 含量与 PUFA 含量呈正相关。SFA 含量与叉长呈显著负相关, MUFA、PUFA 含量与叉长呈显著正相关。中西太平洋和东太平洋黄鳍金枪鱼肌肉脂肪酸含量存在差异, 两海域之间脂肪酸组成平均不相似性为 18.85%, 主要差异来自 n-3 系列多不饱和脂肪酸(n-3 PUFA)、SFA、PUFA、C22∶6n3 (DHA)、Cl6∶0、Cl8∶1n9、MUFA、C22∶6n3/C20∶5n3 (DHA/EPA)、 C18∶0、n-6 系列多不饱和脂肪酸(n-6 PUFA)。主成分分析显示, 黄鳍金枪鱼的营养级越高, 肉食性越高, 以甲藻和硅藻为食源的生物对黄鳍金枪鱼的能量来源贡献越大。相反, 营养级越低的黄鳍金枪鱼主要摄食以细菌、陆地植物和植食性桡足类为食源的生物。主成分回归表明, 黄鳍金枪鱼随叉长增大, 其营养级增加, 肉食性提高, 食性逐渐由以甲壳类和头足类向虾和硬骨鱼等富含多种特征脂肪酸的生物转变。东太平洋黄鳍金枪鱼较中西太平洋肉食性更强, 营养级更高, 甲壳类对其能量贡献更大。  相似文献   

基于ADASYN和Stacking集成的南太平洋黄鳍金枪鱼渔场预报模型研究     

张聪  周为峰  樊伟 《海洋渔业》2023,(5):544-558

为提供更为准确的南太平洋黄鳍金枪鱼(Thunnus albacores)渔场预报信息，针对传统渔场分类问题中渔场和非渔场样本数据分布不均衡的问题，提出了一种基于自适应综合过采样(ADASYN)和Stacking集成的渔场分类模型——A-Stacking模型。利用2008—2019年南太平洋黄鳍金枪鱼的渔业数据，结合时空因子、海洋环境因子共32个特征要素(月份、经纬度、海平面异常、涡动能、叶绿素a浓度、叶绿素梯度、叶绿素距平、海表温度梯度、海表温度距平以及0～500 m水层的垂直温度和盐度)建立了南太平洋黄鳍金枪鱼渔场预报模型。为了验证模型的可靠性，将CART、Adaboost、GBDT、XGBoost、KNN、RF和Stacking模型对照。结果显示，A-Stacking模型具有更高的准确率、召回率、F1-score、G-mean和AUC值，且模型的ROC曲线和PR曲线能较好地包含其他模型，表明模型的分类效果更好。研究表明，A-Stacking集成模型对南太平洋黄鳍金枪鱼渔场的预报效果较好，能有效处理不均衡数据的渔场分类问题，可为今后的渔场预报方法提供参考。  相似文献   

衡水湖红鳍原鲌的年龄、生长和繁殖特性研究     

张晨星  靳昊泽  王蕊  张娜 《河北渔业》2023,(9):4-9+19

为研究衡水湖红鳍原鲌(Cultrichthys erythropterus)的年龄、生长和繁殖特性，在衡水湖采集261尾红鳍原鲌，测定其年龄、体长、体重、性腺发育时期、性腺重等。结果表明，衡水湖红鳍原鲌的2～3龄为优势龄组，从4月份开始，随着气温的逐渐回升，平均年龄呈现出缓慢上升的趋势，到6月份达到了最高，为1.95,之后从7月份开始又逐渐降低。红鳍原鲌的体长范围为76～238 mm,均值为119 mm;体重范围为5.5～113.1 g,均值为24.6 g。红鳍原鲌的雌性个体为正异速生长，雄性个体为负异速生长。红鳍原鲌的雌雄种群性比为0.903∶1,体长150 mm以下种群，雄性个体占据优势(雌雄比0.87∶1);体长150 mm以上的种群，雌性个体占据优势(雌雄比1.36∶1)。衡水湖红鳍原鲌的繁殖期为4—9月，主要集中在6—7月。卵径范围为0.30～1.20 mm,主要集中在0.60～1.00 mm,根据卵径的变化趋势推测其产卵类型为分批产卵。  相似文献   

大规格大鳍鳠对隐蔽所的选择及其行为特征          下载免费PDF全文

李晓莉  朱永久  杨德国  吴兴兵  李学梅  朱挺兵  孟子豪 《中国水产科学》2022,29(12):1768-1777

为探究大规格大鳍鳠(Mystus macropterus)对不同隐蔽所的选择及其相关的行为特征, 本研究在同一养殖池中以不同材料构建了 3 种类型的洞穴(瓦片、卵石和水草), 并在实验池中按照放鱼的数量分别设置自由选择组(1 尾鱼)、无竞争组(3 尾鱼)、竞争组(6 尾鱼) 3 个实验组, 分析了 3 种养殖密度条件下大鳍鳠对隐蔽所的选择及其行为特征。结果显示, 大鳍鳠更偏好瓦片洞穴和卵石洞穴, 这两种洞穴未见多尾鱼同栖, 水草洞穴可见两尾鱼同栖。 面对不同种类洞穴, 大鳍鳠均表现为白天躲避在洞穴中, 夜间出来活动的特征。在无竞争和竞争组中, 大鳍鳠均表现出探索、巡查、捕食等日常行为, 追逐、碰撞、撕咬等攻击行为以及入侵、驱赶、守卫等领地行为。竞争组中实验鱼的攻击频率显著高于无竞争组, 夜间的攻击频率显著高于白天。大鳍鳠能够根据攻击行为建立社群等级分出“优势个体”和“弱势个体”。因此, 建议大鳍鳠在池塘养殖过程中采取夜间投喂模式, 并在池塘中设置足够的开放式隐蔽所供其躲避, 以避免其相互间攻击行为的发生, 提高养殖成效。  相似文献   

红鳍东方鲀IgM重组表达与多克隆抗体制备          下载免费PDF全文

王森  黄宇希  彭欢  苏鹏  黎睿君 《现代农业科技》2022,(10)

红鳍东方鲀（Takifugu rubripes）是我国重要的海水养殖经济鱼类，探究红鳍东方鲀IgM的结构与功能对其病害防治与免疫系统的研究均有重要意义。本研究克隆获取了红鳍东方鲀IgM的重（H）链恒定（C）区序列，序列大小为1326bp，编码442个氨基酸，将获得的IgM序列连接至pET28a表达载体上，利用大肠杆菌BL21进行体外重组表达，SDS-PAGE结果显示：重组蛋白红鳍东方鲀IgM（TrIgM）大小约为62kDa，重组表达的IgM主要以包涵体形式表达。通过体外复性获得可溶性TrIgM蛋白, 将制备的TrIgM蛋白免疫BALB/c小鼠，获得了TrIgM鼠抗血清，Western blot检测结果表明：制备的鼠抗血清可以与重组TrIgM蛋白和红鳍东方鲀天然血清中的IgM的重链蛋白特异性结合。本研究中制备的抗血清可作为检测红鳍东方鲀IgM的特异性抗体，为红鳍东方鲀相关免疫检测提供基础。  相似文献   

基于线粒体控制区D-loop序列的内蒙古大鳍鼓鳔鳅群体遗传结构分析          下载免费PDF全文

杨艳平  杨丽文  乌兰  缪丽梅  罗旭光 《水产科技情报》2021,48(2):77-81

为了解内蒙古地区大鳍鼓鳔鳅(Herzenstein)群体的遗传背景和分化情况,对该地区52个大鳍鼓鳔鳅样本的线粒体控制区D-loop序列进行了遗传多样性和遗传分化分析。结果显示,在947 bp的D-loop区序列中,碱基A、T、C、G的平均含量分别为34.5%、28.0%、21.3%、16.2%,表现出较强的AT偏好性;有27个样本在645位点均缺失C碱基,突变总数为21;D-loop区序列存在多态性位点/突变位点20个,单倍型数(h)、单倍型多样性(H d)、核苷酸多样性(π)分别为17、0.912和0.0045;系统进化树分析显示,样本D-loop区序列分布在2个大的分支上,表明该群体结构形成了一定的遗传分化;样本的D-loop序列间的遗传距离均在0.010以下,说明样本的D-loop区序列亲缘关系较近。  相似文献   

光谱对红鳍东方鲀幼鱼肠道微生物组成的影响     

卢宏博  刘鹰  沈旭芳  王佳  周慧婷  姜洁明  李泽群  刘奇  闫红伟  孙群汶 《水产科学》2023,(2):241-249

为探究光谱对红鳍东方鲀幼鱼肠道微生物组成的影响，以红鳍东方鲀幼鱼为研究对象，在5种不同光谱(蓝光、绿光、红光、白光、黄光)条件下对其受精卵进行孵化和饲育共90 d。试验结束后对各组幼鱼体长进行测定，采用Illumina HiSeq高通量测序技术对其肠道微生物的组成进行分析。结果显示，绿光组、黄光组和白光组的幼鱼体长显著高于蓝光组和红光组(P<0.05),且幼鱼存活率蓝光组>红光组>黄光组>白光组>绿光组。以相似度为97%的聚类分析显示，蓝光组、绿光组、红光组、白光组和黄光组的红鳍东方鲀肠道微生物的运算分类单元数分别为631、508、530、513、418个，共有运算分类单元数87个，特有运算分类单元数为0,但蓝光组和红光组共有的运算分类单元数为13。蓝光组Ace和Chao指数显著高于黄光组(P<0.05),即蓝光组的微生物菌群的丰富度最大，黄光组最小。蓝光组和红光组Shannon指数显著高于绿光组和黄光组(P<0.05),即蓝光组和红光组的肠道微生物菌群多样性大于绿光组和黄光组。属水平肠道菌群分布显示，弓形杆菌属、弧菌属、支原体等为红鳍东方鲀幼...  相似文献   

东海黄鳍马面豚生物学特性和资源利用状况   总被引：2，自引：0，他引：2       下载免费PDF全文

钱世勤 《中国水产科学》1998,5(3):25-29

本文着重阐述东海黄鳍马面豚的生物学特性，计测若干形态性状和差异比较。指明东海与南海的黄鳍马面豚系两个不同的群系。  相似文献