棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的生物信息学分析     

李雨哲  邢淋雪  刘梦洁  刘苏瑶  鲍梦楠  刘震 《棉花学报》2021,33(1):66-74

【目的】苯丙氨酸解氨酶是苯丙烷类代谢的关键酶,对调节植物生长和抗逆有重要作用。从全基因组层次了解棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的进化和功能,可为相关研究提供数据支撑。【方法】利用HMMER和BLASTP从棉花基因组筛选苯丙氨酸解氨酶基因家族,利用MEGA-X进行进化分析,利用MCScanX进行共线性分析,并利用NCBI SRA的数据进行表达分析。【结果】本研究分别从陆地棉、海岛棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组中筛选到12、13、7、8个苯丙氨酸解氨酶基因,依据进化分析和共线性关系数据,我们推测四种棉花的二倍体祖先起初应有6个苯丙氨酸解氨酶基因。顺式作用元件分析结果表明,苯丙氨酸解氨酶基因家族含有较多的光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关的元件。苯丙氨酸解氨酶的蛋白序列具有保守的基序。陆地棉的12个苯丙氨酸解氨酶在低温、高温、盐和PEG胁迫下有不同的表达方式。【结论】本研究明确了苯丙氨酸解氨酶在棉花基因组中的数量、理化性质、进化和表达特征,为苯丙氨酸解氨酶的深入研究提供了参考。  相似文献   

酶法从鳕鱼皮中提取胶原多肽的研究     

刘春娥  刘峰  刘苏瑶 《齐鲁渔业》2011,(12):1-3

胶原多肽具有多种生理活性。鳕鱼皮中含有丰富的胶原蛋白。本实验以鳕鱼皮为研究对象,采用酶法从鱼皮中提取胶原多肽,以氨基含量和水解度为指标,通过单因素和正交实验确定酶解的最佳条件。实验结果表明,采用碱性蛋白酶,加酶量4．5％、酶解温度50℃、pH8．5、酶解时间5小时,蛋白质水解度可达到13．87％。  相似文献