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为了全面了解苦瓜转录组SSR位点特征和满足苦瓜分子育种对分子标记的需求,利用MISA软件对来自苦瓜材料‘大沥-11’6个组织的59740条转录组Unigene序列进行SSR位点搜索,共检测出31066个SSR位点,出现频率(发现的SSR个数与总Unigene数之比)为52.00%,平均每2.62 kb出现1个SSR位点。在苦瓜转录组SSR位点中,基元类型主要为三核苷酸,占总SSR位点的42.17%;其次是二核苷酸,占总SSR位点的31.66%。利用Primer 3软件对搜索到的苦瓜转录组SSR位点进行引物设计,然后把获得的引物序列比对回苦瓜的参考基因组,选择上下游引物序列都是唯一比对的序列并去除重复后共获得9135对特异SSR引物。选择MC00上的232对特异SSR引物对‘谭边大顶’和‘华艺320’两个苦瓜品种基因组DNA进行PCR扩增,其中有219对特异引物可扩增出清晰的条带,有效扩增率为94.40%;有31对特异引物扩增产物表现出多态性,多态率为13.36%。本研究开发的苦瓜转录组特异SSR引物为苦瓜的种质资源分析、基因定位、分子标记辅助选择等理论与应用研究提供了引物数据参考。 相似文献
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罗思良费永红农媛吴兰芳韦德斌周银慧黄杰韦静钟维罗顺遂 《长江蔬菜》2023,(19):45-47
导读:随着形势的不断发展,粮食安全已经成为国家稳定安全的重要因素。要响应中央提出的全面推进乡村振兴,加快建设农业强国,全方位夯实粮食安全根基,优化种植业结构。为提高土地复种指数,实现农民增收及农业增效,根据早春西瓜、粮饲通用玉米的生产特点,总结了百色市右江区早春西瓜与粮饲通用玉米配套栽培模式,旨在为类似农业生产区提供一定的技术参考。 相似文献
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