使用Cytoscape对生物网络数据的建模和分析     

江珊  蒋勃  徐桂珍  李继红  乐毅 《农业网络信息》2017,(6)

生物网络是系统生物学研究的重要内容。本文介绍了多种常用复杂生物网络可视化系统,针对Cytoscape系统在可视化的建模过程以及在建模过程中使用到的布局算法进行对比研究,并利用Cytoscape系统中丰富的插件对复杂网络数据进行分析,包括对数据进行网络分析和更改、使用BINGO插件进行基因注释、使用AGILENT LITERATURE SEARCH(ALS)插件搜索基因相互作用文献等。  相似文献   

‘龙麦35’与寒地多年生麦草杂交后代的分子细胞遗传分析     

陈雅欣  王雪莹  蒋勃  孙世权  刘檠  宋维富  杨雪峰  宋庆杰  张延明  李新玲 《分子植物育种》2021,(6):1954-1961

本研究利用黑龙江省哈尔滨地区冬季寒冷的气候特点以及形态学和分子细胞遗传学研究手段,对‘龙麦35’与6份寒地多年生麦草杂交后代F1进行选育和分析。结果表明,寒地多年生麦草同中间偃麦草染色体组构成一致,具有出色的抗寒性;寒地多年生麦草1-1-4和7-31花期同‘龙麦35’同步,杂交结实率明显高于其他组合。杂种F1为两亲中间型,植株成活率低,减数分裂时期寒地多年生麦草的染色体可同‘龙麦35’染色体发生配对,但染色体组配对不完全,单价体数量多于二价体,导致植株不育。F₁植株虽不具有抗寒性,但具有割后再生性。8个F₁株系,仅株系F₁18731结实,GISH检测结果表明,F₂18731染色体组带有27条‘龙麦35’染色体,14条麦草染色体和1条小麦-麦草易位染色体,染色体数为42条。本研究可为寒地多年生麦草染色体组的研究和利用提供理论基础。  相似文献