大豆MPBQ-MT基因的克隆与生物信息学分析     

聂腾坤  赵琳  李海燕  李文滨 《大豆科学》2016,(1):39-45

以大豆品种合丰25和Bayfield为材料,克隆大豆2-甲基-6-植基-1,4-苯醌甲基转移酶(MPBQMTase)基因,获得1 029 bp的MPBQ-MT基因c DNA序列。通过序列比对发现10个大豆MPBQ-MT基因c DNA区内的潜在SNP位点。采用生物信息学方法分析MPBQ-MT基因编码的氨基酸序列和蛋白质结构。结果表明:MPBQ-MT基因CDS区共编码342个氨基酸,其中缬氨酸(Val)含量最多,占该基因编码氨基酸总数的8.8%;半胱氨酸(Cys)含量最少,占该基因编码氨基酸总数的1.2%;MPBQ-MT蛋白N端包含由58个氨基酸组成的叶绿体转运肽,为亲水性蛋白质。合丰25与Bayfield的MPBQ-MT蛋白质二级结构有所不同,2个品种的MPBQ-MT蛋白质中α-螺旋分别约占25.44%和27.49%,β-转角分别约占9.36%和9.06%,无规则卷曲分别约占40.35%和38.60%。2个品种的MPBQMT蛋白质中片层结构均约占24.85%。两个品种的MPBQ-MT蛋白质均有1个S-腺苷基甲硫氨酸结合位点。对MPBQ-MT蛋白三级结构进行预测,发现去掉转运肽后,MPBQ-MT蛋白质三级结构主要由11个连续的α-螺旋区域和8个连续的片层结构区域组成。结合MPBQ-MT蛋白三级结构对MPBQ-MT基因的生物学功能进一步分析,提出了较为合理的MPBQ-MT作用模型。由系统发生树可知MPBQ-MT蛋白在大豆与菜豆中的亲缘关系较近。  相似文献   

大豆维生素E五个相关基因表达模式分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

李海燕  隋美楠  聂腾坤  史帅  韩英鹏  李文滨 《东北农业大学学报》2016,(5):15-22

以合丰25和Bayfield两个大豆品种作试验材料,采用实时荧光定量PCR方法,测定不同生育时期大豆维生素E代谢过程相关酶基因(HPPD、HPT、MPBQ-MT、TC及TMT基因),并分析其表达模式,推测对大豆维生素E代谢过程合成起关键作用的基因。结果表明,五个基因中对大豆维生素E代谢过程合成起关键作用的可能为MPBQ-MT和TC基因。  相似文献   

大豆GmGBP1基因对转基因烟草幼苗耐热性的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

聂腾坤  赵琳  李文滨  丁福全  李敏敏  杨雪  张可欣  孙晶哲  杜海龙 《农业生物技术学报》2016,(3):313-322

  相似文献   

GmGBP1干涉转基因大豆种质创制及其对下游基因可变剪接的调控     

郑艳红  李欣  陶亚涵  李靖  孙嘉  刘颖  聂腾坤  李文滨  赵琳 《中国油料作物学报》2019,41(3):378

GmGBP1基因与大豆光周期开花时间相关，本试验以GmGBP1基因为对象，利用大豆子叶节转化法进行植物组织培养，得到GmGBP1干涉（GmGBP1-i）T2转基因大豆材料进行分子检测。RNA-seq转录组测序获得可变剪接数据，进一步利用RT-PCR方法对WT与GmGBP1-i大豆叶片测序结果中的可变剪接基因进行验证，共检测到3个基因发生可变剪接，表明GmGBP1干涉表达量降低引起了下游基因可变剪接。这为进一步研究大豆GmGBP1的基因功能及解析大豆成花诱导机理奠定了基础。  相似文献