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为了寻求松毛虫属昆虫分类的新方法,利用COⅠ基因为分子标记针对松毛虫属(Dendromilus)10个地理种群的昆虫进行了分子系统学的研究。结果表明,COⅠ序列中,共有248个变异位点、219个简约信息位点,A+T平均含量为71.5%,大部分碱基改变为颠换。不同地理种群松毛虫的遗传距离为0.007～0.319,平均遗传距离为0.175。利用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最小进化法(ME)构建了系统发育树,系统树显示10个地理种群聚为2支:梓潼、长沙、古田、玉溪、石林、禄丰6个种群聚为1支;墨江、思茅、安宁、曲靖种群聚为1支。 相似文献
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采用L16(4^5)正交试验设计,对影响兴安落叶松SSR-PCR反应体系的主要因素(模板DNA、d NTPs、Mg^2+、Taq聚合酶浓度及引物浓度)进行了试验分析,其结果表明:兴安落叶松SSR-PCR体积为20μL的最佳反应体系是模板DNA用量50 ng、正反向引物浓度均为5μmol·L^-1、d NTPs浓度为2.5 mmol·L^-1、Mg^2+的浓度为2.5 mmol·L^-1、Taq聚合酶用量为1.0 U、最佳退火温度为60℃。试验所建立的反应体系可进一步用于兴安落叶松SSR遗传图谱构建、多样性分析、良种选育等方面的研究中。 相似文献
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为了解小叶章(Deyeuxia angustifolia Kom.)中GST基因的生物学信息,为后续研究GST基因在小叶章中的功能提供理论基础。利用RT-PCR技术和染色体步移法克隆小叶章GST基因及其上游启动子序列,对其进行生物信息学分析和启动子的顺式作用元件分析。克隆得到小叶章GST基因的cDNA序列,命名为DaGST,其开放阅读框为703 bp,编码233个氨基酸,蛋白质相对分子量为25.45 kD。保守结构域预测小叶章DaGST蛋白含有GST-N-Tau和GST-C-Tau两个典型的结构域。系统进化分析表明小叶章DaGST蛋白与大麦(Hordeum vulgare)亲缘关系最近,其次为山羊草(Aegilops tauschii)。克隆得到1 184 bp启动子序列,启动子结构分析表明,小叶章DaGST基因启动子除具有典型的TATA-box、CAAT-box作用元件外,还包括激素响应元件(ABRE, MeJA, SA)等。通过小叶章DaGST基因及启动子的分析,为进一步阐明小叶章的胁迫应答机制提供理论依据。 相似文献
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