杜洛克猪全基因组连锁不平衡分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

刁淑琪  罗元宇  蔡迪  陈桂华  陈赞谋  张豪  李加琪  张哲 《广东农业科学》2016,43(11):116-121

利用猪Illumina Porcine SNP60K芯片对福建某核心种猪场杜洛克猪216个个体进行基因型检测,基于该高密度SNP芯片数据,运用Haploview软件计算全基因组连锁不平衡并构建杜洛克猪连锁不平衡图谱。结果表明,该杜洛克猪群体不同染色体上相邻标记间r2存在波动,波动范围为0.46~0.59,相邻标记间的平均连锁不平衡程度r2为0.52,SSC10的r2最低(平均为0.46),SSC6的r2最高(平均为0.59),连锁不平衡水平随着标记间距的增加而衰减、变异程度随之减小。该研究结果可为杜洛克猪遗传分析及全基因组选择研究提供参考。  相似文献   

影响母猪断奶至配种间隔的遗传参数估计     

徐志婷  孙显月  滕金言  刁淑琪  张豪  张哲  李加琪 《华南农业大学学报》2020,41(2):18-22

【目的】分析影响母猪断奶至配种间隔的因素,并估计母猪断奶至配种间隔的遗传参数,为猪场育种规划提供理论参考。【方法】本研究材料为2011—2016年间采集的华南地区2个场区(A场和B场)大白母猪和长白母猪的繁殖记录。采用Duncan’s法对影响母猪断奶至配种间隔的因素进行显著性分析,并使用DMU软件的AI-REML结合EM算法进行遗传参数估计。【结果】分娩胎次和断奶年份对母猪断奶至配种间隔影响均极显著(P0.01);断奶季节对A、B 2个场区长白母猪及B场大白母猪的断奶至配种间隔影响均极显著(P0.01),而对A场大白母猪的断奶至配种间隔影响不显著(P0.05);带仔数对A、B 2个场区的母猪断奶至配种间隔影响均不显著(P0.05)。A场大白和长白母猪的断奶至配种间隔遗传力分别为0.02和0.04,B场大白和长白母猪断奶至配种间隔的遗传力均为0.06。【结论】华南地区母猪断奶至配种间隔为低遗传力性状,受分娩胎次与断奶季节的影响显著。在实际生产中应缩短母猪初产后断奶至配种间隔,并尽可能使母猪在冷季断奶。  相似文献   

基于SNP芯片的海南猪全基因组选择信号分析     

冯雪燕  刁淑琪  刘玉强  徐志婷  魏趁  袁晓龙  李加琪  张哲 《畜牧兽医学报》2022,53(2):349-359

旨在通过检测海南猪全基因组上的选择信号,以挖掘与海南猪重要经济性状相关的候选基因,并解析讨论海南猪在进化驯化历史中的受选择情况.本研究利用68头海南猪的GeneSeek Genomic Profiler Procine SNP 80K芯片数据,使用整合单倍型分数(integrated haplotype score,i...  相似文献