版纳微型猪近交系精子发生相关基因PHF7的分子特征及转录调控研究     

刘志朋  代红梅  杨忠  张霞  霍海龙  王配  李卫真  赵筱  霍金龙 《四川农业大学学报》2022,(2):243-252

[目的]获得版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)精子发生相关基因PHF7的分子特征,构建其转录调控网络.[方法]通过RNA-seq技术对BMI睾丸进行全转录组测序;利用RT-PCR技术从BMI睾丸分离PHF7全长编码序列并分析其分子特征和蛋白功能;进一步基于睾丸全转录组测序数...  相似文献   

基于转录组测序分析SPACA1在版纳微型猪近交系睾丸中的表达及转录调控特征     

刘志朋  张霞  代红梅  杨福华  廖隽锐  许静  霍金龙 《河北农业大学学报》2023,(1):88-96

旨在分析版纳微型猪近交系（Banna mini-pig inbred line,BMI）SPACA1基因的序列特征、生物学功能及在睾丸中的表达调控模式。选取4头成年BMI公猪的睾丸进行全转录组测序，获得SPACA1基因在睾丸中的表达丰度。采用RT-PCR技术克隆SPACA1的完整编码序列，分析SPACA1的序列、染色体定位、分子特征及相应蛋白的结构和功能。对SPACA1的相互作用蛋白进行GO、KEGG功能富集，并将获得的蛋白与转录组测序所获得的基因表达量进行关联分析。利用转录组测序数据构建SPACA1 mRNA与miRNA和lncRNA的ceRNA调控网络。SPACA1基因CDS区全长为888 bp(Genbank登录号：OK042308)，具有2个跨膜螺旋结构，与SPACA3、SPACA4、HIPK4和CCDC62显著相关；SPACA1及其互作蛋白主要参与精子细胞发育、分化，精子活力、顶体反应和精子鞭毛形成等通路；SPACA1基因受6个miRNAs靶向调控。本研究报道了SPACA1的表达、分子结构、蛋白质功能、在睾丸中的和转录调控作用，为深入研究SPACA1基因在BMI受精以及顶体反...  相似文献