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本研究通过测序牛樟叶片 cDNA 获得 17 046 条 Uni-EST,从中检测出 1 316 个 SSR 位点,平均每 25.7 kb EST 含 1 个 SSR 位点。功能注释发现 1 242 条 SSR-EST 中有 690 条可被划分为 3 大功能类、18 个功能亚类。牛樟 EST-SSR 二核苷酸重复类型出现频率最高,三核苷酸次之。184 类重复基序中 AG/CT 出现频率最高(32.4%),其次为 AAG/CTT(9.3%)。从 1 242 条 SSR-EST 设计 SSR 引物 537 对,随机选取 150 对检测牛樟的多态性及在香樟、大叶樟和沉水樟中的可转移性。结果表明,有 44 对引物在牛樟中得到特异性扩增,其中 17 对具有多态性,检测出的等位基因数 2~7 个,平均 3.02 个。牛樟 SSR 标记在香樟、沉水樟和大叶樟的可转移率分别为 97.7%、97.7%和 95.3%。聚类分析表明,在遗传相似系数为 0.76 处,14 个樟属植物能被划分为 5 类,聚类结果与植物学分类结果基本吻合。 相似文献
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