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绣球属植物花期长、花色丰富,是重要的切花、盆花和园林绿化植物。我国是绣球属种质资源分布中心,但育种技术落后,缺少具备市场竞争力的自育品种。分子标记技术可辅助定向改良观赏性状、缩短育种周期,已成为观赏植物育种的重要手段。研究总结了近年来常用分子标记技术在绣球属植物种植资源鉴定与评价以及分子标记辅助育种中的应用,并展望新一代测序技术应用前景,如提高资源评价与鉴定的准确性、发掘与观赏性状紧密连锁分子标记、提高育种后代选择效率、缩短育种周期等,为绣球属种质资源保护与有效利用提供参考。 相似文献
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尾叶紫薇全长转录组测序及微卫星标记开发 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]尾叶紫薇是培育香花紫薇的重要种质资源,目前花香功能基因的研究及已开发的SSR分子标记较少,无法满足分子育种研究需求.[方法]采用PacBio sequel平台对尾叶紫薇3个开花时期混样进行全长转录组测序,通过公共数据库对Unigene进行功能注释,利用MISA软件检索全长转录组的SSR位点,Primer3批量设计SSR引物并检测.[结果]测序获得39087条非冗余、高质量全长转录本,平均长度为2109 bp,N50长度为2427 bp,长度主要分布在500~4000 bp.有38559条序列(98.64%)获得功能注释,功能主要集中于细胞进程及代谢进程.其中参与花香相关萜类物质合成的有56个,参与脂肪酸衍生物合成的有922个.获得的16425个SSR位点分布在12060条序列中,平均每5.02 kb出现1个SSR序列,3141条序列含有多个SSR位点.SSR位点主要重复类型是二核苷酸和三核苷酸,分别占所有SSR位点的41.95%和31.58%,重复基序类型有96种,AG/CT重复类型的出现频率最高.SSR的重复次数以5~15次为主,长度为10~86 bp,平均为16.84 bp.随机选取52对SSR引物进行PCR检测,有40对引物能产生单一、清晰的条带,有效扩增率为76.92%.[结论]获得与花香物质合成相关基因序列和大量有效SSR标记,将为深入了解尾叶紫薇花香物质合成与代谢、紫薇属植物种质资源评价与保护、分子标记辅助育种等研究奠定基础. 相似文献
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